SIRIUS 4: a rapid tool for turning tandem mass spectra into metabolite structure information

Tutkimustuotos: Lehtiartikkeli

Tutkijat

  • Kai Dührkop
  • Markus Fleischauer
  • Marcus Ludwig
  • Alexander A. Aksenov
  • Alexey V. Melnik
  • Marvin Meusel
  • Pieter C. Dorrestein
  • Juho Rousu

  • Sebastian Böcker

Organisaatiot

  • Friedrich Schiller University Jena
  • UC-San-Diego
  • Saarland University

Kuvaus

Mass spectrometry is a predominant experimental technique in metabolomics and related fields, but metabolite structural elucidation remains highly challenging. We report SIRIUS 4 (https://bio.informatik.uni-jena.de/sirius/), which provides a fast computational approach for molecular structure identification. SIRIUS 4 integrates CSI:FingerID for searching in molecular structure databases. Using SIRIUS 4, we achieved identification rates of more than 70% on challenging metabolomics datasets.

Yksityiskohdat

AlkuperäiskieliEnglanti
Sivut299-302
Sivumäärä4
JulkaisuNature Methods
Vuosikerta16
Numero4
TilaJulkaistu - 1 huhtikuuta 2019
OKM-julkaisutyyppiA1 Julkaistu artikkeli, soviteltu

Lataa tilasto

Ei tietoja saatavilla

ID: 32997688