Leak-Resistant Design of DNA Strand Displacement Systems

Vinay Gautam*

*Tämän työn vastaava kirjoittaja

Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussaConference contributionScientificvertaisarvioitu

25 Lataukset (Pure)

Abstrakti

Although a number of dynamically-controlled nanostructures and programmable DNA Strand Displacement (DSD) systems have been designed using DNA strand displacement, predictability and scalability of these DNA-based systems remain limited due to leakages introduced by spuriously triggered displacement events. We present a systematic design method for implementing leak-resistant DNA strand displacement systems in which each legitimate displacement event requires signal species to bind cooperatively at the two designated toehold binding sites in the protected fuel complexes, and thus inhibits spurious displacement events. To demonstrate the potential of the leak-resistant design approach for the construction of arbitrary complex digital circuits and systems with analog behaviors, we present domain-level designs and displacement pathways of the basic building blocks of the DNA strand displacement cascades, e.g. OR, AND gates, and an elementary bimolecular reaction.

AlkuperäiskieliEnglanti
OtsikkoBio-inspired Information and Communication Technologies - 12th EAI International Conference, BICT 2020, Proceedings
ToimittajatYifan Chen, Tadashi Nakano, Lin Lin, Mohammad Upal Mahfuz, Weisi Guo
Sivut80-96
Sivumäärä17
DOI - pysyväislinkit
TilaJulkaistu - 2020
OKM-julkaisutyyppiA4 Artikkeli konferenssijulkaisuussa
TapahtumaInternational Conference on Bio-inspired Information and Communications Technologies - Shanghai, Kiina
Kesto: 7 heinäkuuta 20208 heinäkuuta 2020
Konferenssinumero: 12

Julkaisusarja

NimiLecture Notes of the Institute for Computer Sciences, Social-Informatics and Telecommunications Engineering, LNICST
KustantajaSpringer
Vuosikerta329 LNICST
ISSN (painettu)1867-8211

Conference

ConferenceInternational Conference on Bio-inspired Information and Communications Technologies
LyhennettäBICT
MaaKiina
KaupunkiShanghai
Ajanjakso07/07/202008/07/2020

Sormenjälki Sukella tutkimusaiheisiin 'Leak-Resistant Design of DNA Strand Displacement Systems'. Ne muodostavat yhdessä ainutlaatuisen sormenjäljen.

Siteeraa tätä