DNA Microarray Analysis: From Affymetrix CEL Files to Comparative Gene Expression

Sandeep Kumar, Shruti Shandilya, Suman Kapila, Mohit Sharma, Nikhil Agrawal

Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussaChapterScientificvertaisarvioitu

1 Sitaatiot (Scopus)

Abstrakti

Microarray technique is widely used for the rapid detection and comparison of expression of thousands of genes at the same time. For the microarray data analysis, robust and reproducible protocols are being generated day by day. Bioconductor provides several free microarray data analysis packages. The analysis includes the following processes: quality control, normalization, and calculation of differential gene expression. This chapter demonstrates a protocol to find out the differentially expressed genes from the raw data (.CEL files) using the Bioconductor tools.

AlkuperäiskieliEnglanti
OtsikkoComputation in Bioinformatics
AlaotsikkoMultidisciplinary Applications
KustantajaJohn Wiley & Sons
Sivut139-153
Sivumäärä15
ISBN (elektroninen)9781119654803
ISBN (painettu)9781119654711
DOI - pysyväislinkit
TilaJulkaistu - 1 tammik. 2021
OKM-julkaisutyyppiA3 Kirjan tai muun kokoomateoksen osa

Sormenjälki

Sukella tutkimusaiheisiin 'DNA Microarray Analysis: From Affymetrix CEL Files to Comparative Gene Expression'. Ne muodostavat yhdessä ainutlaatuisen sormenjäljen.

Siteeraa tätä