Projekteja vuodessa
Abstrakti
Cellulose binding modules (CBMs) are found widely in different proteins that act on cellulose. Because they allow a very easy way of binding recombinant proteins to cellulose, they have become widespread in many biotechnological applications involving cellulose. One commonly used variant is the CBMCipA from Clostridium thermocellum. Here we studied the oligomerization behavior of CBMCipA, as such solution association may have an impact on its use. As the principal approach, we used sedimentation velocity and sedimentation equilibrium analytical ultracentrifugation. To enhance our understanding of the possible interactions, we used molecular dynamics simulations. By analysis of the sedimentation velocity data by a discrete model genetic algorithm and by building a binding isotherm based on weight average sedimentation coefficient and by global fitting of sedimentation equilibrium data we found that the CBMCipA shows a weak dimerization interaction with a dissociation constant KD of 90 ± 30 μM. As the KD of CBMCipA binding to cellulose is below 1 μM, we conclude that the dimerization is unlikely to affect cellulose binding. However, at high concentrations used in some applications of the CBMCipA, its dimerization is likely to have a marked effect on its solution behavior.
Alkuperäiskieli | Englanti |
---|---|
Sivut | 1995-2004 |
Sivumäärä | 10 |
Julkaisu | International Journal of Biological Macromolecules |
Vuosikerta | 163 |
DOI - pysyväislinkit | |
Tila | Julkaistu - 15 marrask. 2020 |
OKM-julkaisutyyppi | A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä |
Sormenjälki
Sukella tutkimusaiheisiin 'Analyzing the weak dimerization of a cellulose binding module by analytical ultracentrifugation'. Ne muodostavat yhdessä ainutlaatuisen sormenjäljen.Projektit
- 3 Päättynyt
-
Veden ja suolan vaikutus polyelektrolyyttikomplekseissa
Sammalkorpi, M. (Vastuullinen tutkija), Batys, P. (Projektin jäsen), Harmat, A. (Projektin jäsen), Javannikkhah, S. (Projektin jäsen), Mudedla, S. (Projektin jäsen), Vahid, H. (Projektin jäsen), Kastinen, T. (Projektin jäsen), Mohammadyarloo, Z. (Projektin jäsen), Vuorte, M. (Projektin jäsen), Scacchi, A. (Projektin jäsen) & Khavani Sariani, M. (Projektin jäsen)
01/09/2017 → 31/12/2021
Projekti: Academy of Finland: Other research funding
-
Uusi tie silkkiin: Silkki-materiaalien biopohjainen tuotanto
Linder, M. (Vastuullinen tutkija), Griffo, A. (Projektin jäsen), Batys, P. (Projektin jäsen), Tersteegen, J. (Projektin jäsen), Aranko, S. (Projektin jäsen), Mohammadi, P. (Projektin jäsen), Roas Escalona, N. (Projektin jäsen) & Lemetti, L. (Projektin jäsen)
01/01/2017 → 31/12/2020
Projekti: Academy of Finland: Other research funding
-
Suomen Akatemian Biosynteettisten hybridimateriaalien molekyylimuokkauksen huippuyksikkö (2014-2019), HYBER
Linder, M. (Vastuullinen tutkija), Fang, W. (Projektin jäsen), Gandier, J.-A. (Projektin jäsen), Rooijakkers, B. (Projektin jäsen), Schmidt, G. (Projektin jäsen), Jonkergouw, C. (Projektin jäsen), Mohammadi, P. (Projektin jäsen), Velagapudi, R. (Projektin jäsen), Rahman, M. (Projektin jäsen) & Virtanen, S. (Projektin jäsen)
01/01/2017 → 31/12/2019
Projekti: Academy of Finland: Other research funding
Laitteet
-
Biotalousinfrastruktuuri
Seppälä, J. (Manager)
Kemian tekniikan korkeakouluLaitteistot/tilat: Facility
-
Raaka-aineiden tutkimusinfrastruktuuri
Karppinen, M. (Manager)
Kemian tekniikan korkeakouluLaitteistot/tilat: Facility