Systemaattinen lähestymistapa vaihtoehtoisten silmukoiden tutkimiseen scRNA-seq: stä syöpään

Projektin yksityiskohdat

Tiivistelmä

Vaihtoehtoisella liitoksella on osoitettu olevan tärkeä rooli syövän kehityksessä. Tällä hetkellä useimmat vaihtoehtoiset silmukointitutkimukset pysyvät massa-RNA-seq-tasolla. Vaikka arvioidaan, että 92% ihmisen geeneistä käy läpi vaihtoehtoisen silmukoinnin, irtotavarana RNA-seq: tä käyttävät tutkimukset voivat paljastaa vaihtoehtoisen silmukoinnin vain pienelle osalle syövän geeneistä. Tämä johtuu syövän heterogeenisestä luonteesta, jossa solupopulaatiolle spesifiset merkittävät silmukointitapahtumat keskiarvoistetaan kaikille heterogeenisille soluille. Siksi on luonnollista turvautua yksisoluiseen RNA-sekvensointiin (scRNA-sekvenssi) syövän heterogeenisyyden käsittelemiseksi. Tässä projektissa aion käyttää multi-omics-lähestymistapaa systemaattisesti tutkimaan vaihtoehtoista silmukointia ja sen säätelyä syövän scRNA-sekvenssin perusteella.
Akronyymi-
TilaPäättynyt
Todellinen alku/loppupvm01/09/202028/02/2024

Yhteistyöpartnerit

Sormenjälki

Tutustu tutkimuksen aiheisiin, joita tämä projekti koskee. Nämä merkinnät luodaan taustalla olevien stipendien/apurahojen perusteella. Yhdessä ne muodostavat ainutlaatuisen sormenjäljen.
  • Genomic monitoring of SARS-CoV-2 uncovers an Nsp1 deletion variant that modulates type I interferon response

    Lin, J., Tang, C., Wei, H., Du, B., Chen, C., Wang, M., Zhou, Y., Yu, M., Cheng, L., Kuivanen, S., Ogando, N. S., Levanov, L., Zhao, Y., Li, C., Zhou, R., Li, Z., Zhang, Y., Sun, K., Wang, C., Chen, L., & 52 muutaXiao, X., Zheng, X., Chen, S., Yang, R., Zhang, D., Xu, M., Song, J., Wang, D., Li, Y., Lei, S., Zeng, W., Yang, Q., He, P., Zhang, Y., Zhou, L., Cao, L., Luo, F., Liu, H., Wang, L., Ye, F., Zhang, M., Li, M., Li, X., Li, K., Ke, B., Xu, J., Yang, H., He, S., Pan, M., Yan, Y., Zha, Y., Jiang, L., Yu, C., Liu, Y., Xu, Z., Li, Q., Jiang, Y., Sun, J., Hong, W., Wei, H., Lu, G., Vapalahti, O., Luo, Y., Wei, Y., Connor, T., Tan, W., Snijder, E. J., Smura, T., Li, W., Geng, J., Ying, B. & Chen, L., 10 maalisk. 2021, julkaisussa: Cell Host and Microbe. 29, 3, s. 489-502.e8 22 Sivumäärä

    Tutkimustuotos: LehtiartikkeliArticleScientificvertaisarvioitu

    Open access
    Tiedosto
    79 Sitaatiot (Scopus)
    48 Lataukset (Pure)