Single cell RNA sequencing analytical tools for studying cell differentiation

Projektin yksityiskohdat

Tiivistelmä

Vaihtoehtoisella liitoksella on osoitettu olevan tärkeä rooli syövän kehityksessä. Tällä hetkellä useimmat vaihtoehtoiset silmukointitutkimukset pysyvät irtotavarana RNA-seq-tasolla. Vaikka arvioidaan, että 92% ihmisen geeneistä käy läpi vaihtoehtoisen silmukoinnin, irtotavarana RNA-seq: tä käyttävät tutkimukset voivat paljastaa vaihtoehtoisen silmukoinnin vain pienelle osalle syövän geeneistä. Tämä johtuu syövän heterogeenisestä luonteesta, jossa merkittävät silmukointitapahtumat ovat spesifisiä solupopulaatiolle keskiarvona kaikille heterogeenisille soluille. Siksi on luonnollista turvautua yksisoluiseen RNA-sekvensointiin (scRNA-sekvenssi) syövän heterogeenisyyden käsittelemiseksi. Tässä projektissa aion käyttää multi-omics-lähestymistapaa systemaattisesti tutkimaan vaihtoehtoista silmukointia ja sen säätelyä syövän scRNA-sekvenssin perusteella.
Akronyymi-
TilaKäynnissä
Todellinen alku/loppupvm01/09/202031/08/2025

Yhteistyöpartnerit

YK:n kestävän kehityksen tavoitteet

Vuonna 2015 YK:n jäsenvaltiot sopivat 17 maailmanlaajuisesta kestävän kehityksen tavoitteesta (Sustainable Development Goal, SDG) poistamaan köyhyyden, suojelemaan planeettaa ja takaamaan vaurauden kaikille. Tämä projekti edistää seuraavia kestävän kehityksen tavoitteita:

  • SDG 3 – Hyvä terveys ja hyvinvointi

Sormenjälki

Tutustu tutkimuksen aiheisiin, joita tämä projekti koskee. Nämä merkinnät luodaan taustalla olevien stipendien/apurahojen perusteella. Yhdessä ne muodostavat ainutlaatuisen sormenjäljen.