Algoritmisia menetelmiä biomolekulaaristen nanorakenteiden suunnitteluun (ALBION)

Projektin yksityiskohdat

LyhytotsikkoALBION/Orponen
AkronyymiALBION
TilaKäynnissä
Todellinen alku/loppupvm01/09/201731/08/2021

Tutkimustuotos

  • 6 Article
  • 2 Conference contribution
  • 1 Doctoral Thesis

RuleDSD: A rule-based modelling and simulation tool for DNA strand displacement systems

Gautam, V., Long, S. & Orponen, P., 2020, Proceedings of the 13th International Joint Conference on Biomedical Engineering Systems and Technologies: Volume 3 BIOINFORMATICS. De Maria, E., Fred, A. & Gamboa, H. (toim.). s. 158-167 10 Sivumäärä

Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussaConference contributionScientificvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
  • 6 Lataukset (Pure)

    A computational framework for DNA sequencing microscopy

    Hoffecker, I. T., Yang, Y., Bernardinelli, G., Orponen, P. & Högberg, B., 4 syyskuuta 2019, julkaisussa : Proceedings of the National Academy of Sciences. 116, 39, s. 19282-19287 6 Sivumäärä, 1821178116.

    Tutkimustuotos: LehtiartikkeliArticleScientificvertaisarvioitu

    Open access
    Tiedosto
  • 19 Lataukset (Pure)

    A Critical Comparison of Rejection-Based Algorithms for Simulation of Large Biochemical Reaction Networks

    Thanh, V. H., 1 elokuuta 2019, julkaisussa : Bulletin of Mathematical Biology. 81, 8, s. 3053-3073 21 Sivumäärä

    Tutkimustuotos: LehtiartikkeliArticleScientificvertaisarvioitu

    Open access
    Tiedosto
  • 4 Sitaatiot (Scopus)
    89 Lataukset (Pure)

    Aktiviteetit

    • 2 Vierailu ulkomaille
    • 1 Hosting a visitor
    • 1 Konferenssiesitelmä

    Algorithmic design of 3D wireframe RNA polyhedra

    Abdulmelik Mohammed (Puhuja)
    8 lokakuuta 201812 lokakuuta 2018

    Aktiviteetti: Konferenssiesitelmä

    Ibuki Kawamata

    Pekka Orponen (Host)
    19 helmikuuta 201823 helmikuuta 2018

    Aktiviteetti: Hosting a visitor

    University of South Florida

    Abdulmelik Mohammed (Visiting researcher)
    29 syyskuuta 20176 lokakuuta 2017

    Aktiviteetti: Vierailu ulkomaille