Jos olet muokannut tietoja Puressa, ne näkyvät pian tässä.

Henkilökohtainen profiili

Koulutus / tieteellinen pätevyys

Dipl.ins., tietotekniikka, Aalto-yliopisto, Sähkötekniikan korkeakoulu

Tekn. kand., tietotekniikka, Aalto-yliopisto, Sähkötekniikan korkeakoulu

Keywords

  • Computational biology
  • Machine learning
  • Data mining
  • Bioinformatics
  • Bayesian modeling
  • Self-Organizing Map

Sormenjälki Sukella tutkimusaiheisiin, joissa Tommi Vatanen on aktiivinen. Nämä aihemerkinnät ovat peräisin tämän henkilön teoksista. Yhdessä ne muodostavat ainutlaatuisen sormenjäljen.

  • 7 Samanlaiset profiilit

Verkko Viimeisin maatasolla toteutettu yhteistyö. Saat syvempiä lisätietoja pisteitä napsauttamalla.

Tutkimustuotos

  • 15 Article
  • 7 Conference contribution
  • 1 Letter
  • 1 Doctoral Thesis

An additive Gaussian process regression model for interpretable non-parametric analysis of longitudinal data

Cheng, L., Ramchandran, S., Vatanen, T., Lietzén, N., Lahesmaa, R., Vehtari, A. & Lähdesmäki, H., 17 huhtikuuta 2019, julkaisussa : Nature Communications. 10, 1, s. 1-11 11 Sivumäärä, 1798.

Tutkimustuotos: LehtiartikkeliArticleScientificvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
  • 4 Sitaatiot (Scopus)
    139 Lataukset (Pure)

    Genomic variation and strain-specific functional adaptation in the human gut microbiome during early life

    Vatanen, T., Plichta, D. R., Somani, J., Münch, P. C., Arthur, T. D., Hall, A. B., Rudolf, S., Oakeley, E. J., Ke, X., Young, R. A., Haiser, H. J., Kolde, R., Yassour, M., Luopajärvi, K., Siljander, H., Virtanen, S. M., Ilonen, J., Uibo, R., Tillmann, V., Mokurov, S. & 8 muuta, Dorshakova, N., Porter, J. A., McHardy, A. C., Lähdesmäki, H., Vlamakis, H., Huttenhower, C., Knip, M. & Xavier, R. J., 1 maaliskuuta 2019, julkaisussa : Nature Microbiology. 4, 3, s. 470-479

    Tutkimustuotos: LehtiartikkeliArticleScientificvertaisarvioitu

  • 22 Sitaatiot (Scopus)

    The human gut microbiome in early-onset type 1 diabetes from the TEDDY study

    Vatanen, T., Franzosa, E. A., Schwager, R., Tripathi, S., Arthur, T. D., Vehik, K., Lernmark, Å., Hagopian, W. A., Rewers, M. J., She, J. X., Toppari, J., Ziegler, A. G., Akolkar, B., Krischer, J. P., Stewart, C. J., Ajami, N. J., Petrosino, J. F., Gevers, D., Lähdesmäki, H., Vlamakis, H. & 2 muuta, Huttenhower, C. & Xavier, R. J., 25 lokakuuta 2018, julkaisussa : Nature. 562, 7728, s. 589-594 6 Sivumäärä

    Tutkimustuotos: LehtiartikkeliLetterScientificvertaisarvioitu

    Open access
    Tiedosto
  • 108 Sitaatiot (Scopus)
    417 Lataukset (Pure)

    High-throughput automated microfluidic sample preparation for accurate microbial genomics

    Kim, S., De Jonghe, J., Kulesa, A. B., Feldman, D., Vatanen, T., Bhattacharyya, R. P., Berdy, B., Gomez, J., Nolan, J., Epstein, S. & Blainey, P. C., 27 tammikuuta 2017, julkaisussa : Nature Communications. 8, s. 1-10 13919.

    Tutkimustuotos: LehtiartikkeliArticleScientificvertaisarvioitu

    Open access
    Tiedosto
  • 39 Sitaatiot (Scopus)
    153 Lataukset (Pure)

    Intestinal virome changes precede autoimmunity in type I diabetes-susceptible children

    Zhao, G., Vatanen, T., Droit, L., Park, A., Kostic, A. D., Poon, T. W., Vlamakis, H., Siljander, H., Härkönen, T., Hämäläinen, A. M., Peet, A., Tillmann, V., Ilonen, J., Wang, D., Knip, M., Xavier, R. J. & Virgin, H. W., 25 heinäkuuta 2017, julkaisussa : Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 114, 30, s. E6166-E6175

    Tutkimustuotos: LehtiartikkeliArticleScientificvertaisarvioitu

  • 72 Sitaatiot (Scopus)

    Aktiviteetit

    • 2 Konferenssiesitelmä
    • 2 Julkinen esitelmä
    • 2 Vierailu ulkomaille

    Talk at 16th International Symposium on Microbial Ecology

    Tommi Vatanen (Puhuja)
    23 elokuuta 2016

    Aktiviteetti: Konferenssiesitelmä

    Xavier Lab in the Broad Institute

    Tommi Vatanen (Visiting researcher)
    1 tammikuuta 201631 joulukuuta 2016

    Aktiviteetti: Vierailu ulkomaille

    Talk at the Human Microbiome conference

    Tommi Vatanen (Puhuja)
    12 kesäkuuta 2015

    Aktiviteetti: Konferenssiesitelmä

    Talk at tenth annual Broad Institute scientific retreat, 2015

    Tommi Vatanen (Puhuja)
    15 joulukuuta 2015

    Aktiviteetti: Julkinen esitelmä

    Talk at CSIBD Symposium & Workshop 2015

    Tommi Vatanen (Puhuja)
    14 marraskuuta 2015

    Aktiviteetti: Julkinen esitelmä

    Lehtileikkeet

    Could bacteria-attacking viruses hold a clue to obesity?

    Tommi Vatanen

    15/03/2020

    3 kohdetta/ Medianäkyvyys

    Lehdistö/media: Esiintyminen mediassa

    University of Auckland welcomes Te Pūtea Rangahau a Marsden 5 November 2019

    Tommi Vatanen

    05/11/2019

    1 kohde/ Medianäkyvyys

    Lehdistö/media: Esiintyminen mediassa

    New findings about the gut microbiome in infants and children

    Tommi Vatanen

    04/06/2019

    1 kohde/ Medianäkyvyys

    Lehdistö/media: Esiintyminen mediassa

    The gut microbiome in infants and children

    Tommi Vatanen

    04/06/2019

    1 kohde/ Medianäkyvyys

    Lehdistö/media: Esiintyminen mediassa

    Are You A Super Pooper?

    Tommi Vatanen

    22/01/2019

    1 kohde/ Medianäkyvyys

    Lehdistö/media: Esiintyminen mediassa