Pekka Marttinen

Professori (Associate Professor), Tietotekniikan laitos
Professori (Associate Professor), Computer Science Professors
Professori (Associate Professor), Computer Science - Artificial Intelligence and Machine Learning (AIML)
Professori (Associate Professor), Professorship Marttinen P.

https://orcid.org/0000-0001-7078-7927

Puhelin+358 50 5124362

Aalto SCI Computer Science Konemiehentie 2

Tutkimustuotoksia vuodessa

65 Article
23 Conference article in proceedings
2 Konferenssiesitys
2 Poster
Lisää

23 tulosta

Suodatin

2024
Can docstring reformulation with an LLM improve code generation?
Dainese, N., Ilin, A. & Marttinen, P., 2024, EACL 2024 - 18th Conference of the European Chapter of the Association for Computational Linguistics, Proceedings of the Student Research Workshop. Falk, N., Papi, S. & Zhang, M. (toim.). Association for Computational Linguistics, s. 296-312 17 Sivumäärä
Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussa › Conference article in proceedings › Scientific › vertaisarvioitu

Open access
Improving Medical Multi-modal Contrastive Learning with Expert Annotations
Kumar, Y. & Marttinen, P., 2024, (Hyväksytty/In press) The 18th European Conference on Computer Vision (ECCV 2024).
Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussa › Conference article in proceedings › Scientific › vertaisarvioitu
In-Context Symbolic Regression : Leveraging Large Language Models for Function Discovery
Merler, M., Haitsiukevich, K., Dainese, N. & Marttinen, P., 2024, Proceedings of the 62nd Annual Meeting of the Association for Computational Linguistics (Volume 4: Student Research Workshop). Fu, X. & Fleisig, E. (toim.). Association for Computational Linguistics, s. 589-606 18 Sivumäärä (Proceedings of the Annual Meeting of the Association for Computational Linguistics; Vuosikerta 4).
Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussa › Conference article in proceedings › Scientific › vertaisarvioitu

Open access
Knowledge-augmented Graph Neural Networks with Concept-aware Attention for Adverse Drug Event Detection
Gao, Y., Ji, S. & Marttinen, P., 25 toukok. 2024, Proceedings of the 2024 Joint International Conference on Computational Linguistics, Language Resources and Evaluation (LREC-COLING 2024). European language resources distribution agency, s. 9787–9798 (International conference on computational linguistics)(LREC proceedings).
Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussa › Conference article in proceedings › Scientific › vertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
30 Lataukset (Pure)
Temporal Causal Mediation through a Point Process: Direct and Indirect Effects of Healthcare Interventions
Hizli, C., John, T., Juuti, A., Saarinen, T., Pietiläinen, K. & Marttinen, P., 2024, Advances in Neural Information Processing Systems 36 (NeurIPS 2023). Curran Associates Inc., 10 Sivumäärä (Advances in Neural Information Processing Systems; Vuosikerta 36).
Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussa › Conference article in proceedings › Scientific › vertaisarvioitu

Open access
VMS: Interactive Visualization to Support the Sensemaking and Selection of Predictive Models
He, C., Raj, V., Moen, H., Gröhn, T., Wang, C., Peltonen, L. M., Koivusalo, S., Marttinen, P. & Jacucci, G., 18 maalisk. 2024, Proceedings of 2024 29th Annual Conference on Intelligent User Interfaces, IUI 2024. ACM, s. 229-244 16 Sivumäärä
Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussa › Conference article in proceedings › Scientific › vertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
32 Lataukset (Pure)
2023
Causal Modeling of Policy Interventions From Treatment-Outcome Sequences
Hizli, C., John, S., Juuti, A., Saarinen, T., Pietiläinen, K. & Marttinen, P., heinäk. 2023, Proceedings of the 40th International Conference on Machine Learning. Krause, A., Brunskill, E., Cho, K., Engelhardt, B., Sabato, S. & Scarlett, J. (toim.). JMLR, s. 13050-13084 35 Sivumäärä (Proceedings of Machine Learning Research; Vuosikerta 202).
Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussa › Conference article in proceedings › Scientific › vertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
41 Lataukset (Pure)
Contextualized Graph Embeddings for Adverse Drug Event Detection
Gao, Y., Ji, S., Zhang, T., Tiwari, P. & Marttinen, P., 17 maalisk. 2023, Machine Learning and Knowledge Discovery in Databases - European Conference, ECML PKDD 2022, Proceedings: European Conference, ECML PKDD 2022, Grenoble, France, September 19–23, 2022, Proceedings, Part II. Amini, M.-R., Canu, S., Fischer, A., Guns, T., Kralj Novak, P. & Tsoumakas, G. (toim.). Springer, s. 605–620 16 Sivumäärä (Lecture notes in computer science; Vuosikerta 13714).
Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussa › Conference article in proceedings › Scientific › vertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
2 Sitaatiot (Scopus)

142 Lataukset (Pure)
Incorporating functional summary information in Bayesian neural networks using a Dirichlet process likelihood approach
Raj, V., Cui, T., Heinonen, M. & Marttinen, P., 2023, Proceedings of The 26th International Conference on Artificial Intelligence and Statistics (AISTATS) 2023. Ruiz, F., Dy, J. & van de Meent, J.-W. (toim.). JMLR, s. 6741-6763 (Proceedings of Machine Learning Research; Vuosikerta 206).
Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussa › Conference article in proceedings › Scientific › vertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
35 Lataukset (Pure)
Mixture of Coupled HMMs for Robust Modeling of Multivariate Healthcare Time Series
Poyraz, O. & Marttinen, P., 4 jouluk. 2023, Proceedings of the 3rd Machine Learning for Health Symposium. JMLR, s. 461-479 18 Sivumäärä (Proceedings of Machine Learning Research ; Vuosikerta 225).
Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussa › Conference article in proceedings › Scientific › vertaisarvioitu

Open access
Nonparametric modeling of the composite effect of multiple nutrients on blood glucose dynamics
Odnoblyudova, A., Hizli, C., John, S., Juuti, A., Särkkä, S., Pietiläinen, K. & Marttinen, P., 4 jouluk. 2023, Proceedings of the 3rd Machine Learning for Health Symposium. JMLR, s. 428-444 (Proceedings of Machine Learning Research ; Vuosikerta 225).
Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussa › Conference article in proceedings › Scientific › vertaisarvioitu

Open access
Patient Outcome and Zero-shot Diagnosis Prediction with Hypernetwork-guided Multitask Learning
Ji, S. & Marttinen, P., 2023, Proceedings of the 17th Conference of the European Chapter of the Association for Computational Linguistics. Vlachos, A. & Augenstein, I. (toim.). Association for Computational Linguistics, s. 589–598
Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussa › Conference article in proceedings › Scientific › vertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
45 Lataukset (Pure)
Reader: Model-based language-instructed reinforcement learning
Dainese, N., Marttinen, P. & Ilin, A., 2023, Proceedings of the 2023 Conference on Empirical Methods in Natural Language Processing. Bouamor, H., Pino, J. & Bali, K. (toim.). Association for Computational Linguistics, s. 16583–16599
Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussa › Conference article in proceedings › Scientific › vertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
1 Sitaatiot (Scopus)

96 Lataukset (Pure)
Weak Supervision and Clustering-Based Sample Selection for Clinical Named Entity Recognition
Sun, W., Ji, S., Denti, T., Moen, H., Kerro, O., Rannikko, A., Marttinen, P. & Koskinen, M., 2023, Machine Learning and Knowledge Discovery in Databases: Applied Data Science and Demo Track - European Conference, ECML PKDD 2023, Proceedings. De Francisci Morales, G., Bonchi, F., Perlich, C., Ruchansky, N., Kourtellis, N. & Baralis, E. (toim.). Springer, s. 444-459 16 Sivumäärä (Lecture Notes in Computer Science (including subseries Lecture Notes in Artificial Intelligence and Lecture Notes in Bioinformatics); Vuosikerta 14174 LNAI).
Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussa › Conference article in proceedings › Scientific › vertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
36 Lataukset (Pure)
2022
Deconfounded Representation Similarity for Comparison of Neural Networks
Cui, T., Kumar, Y., Marttinen, P. & Kaski, S., 2022, Advances in Neural Information Processing Systems 35 (NeurIPS 2022). Koyejo, S., Mohamed, S., Agarwal, A., Belgrave, D., Cho, K. & Oh, A. (toim.). Morgan Kaufmann Publishers, 14 Sivumäärä (Advances in Neural Information Processing Systems; Vuosikerta 35).
Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussa › Conference article in proceedings › Scientific › vertaisarvioitu

Open access
2021
A Critical Look at the Consistency of Causal Estimation with Deep Latent Variable Models
Rissanen, S. & Marttinen, P., 2021, Advances in Neural Information Processing Systems 34 - 35th Conference on Neural Information Processing Systems, NeurIPS 2021. Neural Information Processing Systems Foundation, s. 4207-4217 11 Sivumäärä (Advances in Neural Information Processing Systems; Vuosikerta 6).
Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussa › Conference article in proceedings › Scientific › vertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
12 Sitaatiot (Scopus)

60 Lataukset (Pure)
Medical Code Assignment with Gated Convolution and Note-Code Interaction
Ji, S., Pan, S. & Marttinen, P., 1 elok. 2021, Findings of the Association for Computational Linguistics: ACL-IJCNLP 2021. Association for Computational Linguistics, s. 1034-1043 10 Sivumäärä (Annual Meeting of the Association for Computational Linguistics).
Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussa › Conference article in proceedings › Scientific › vertaisarvioitu

Open access
8 Sitaatiot (Scopus)
Multitask Recalibrated Aggregation Network for Medical Code Prediction
Sun, W., Ji, S., Cambria, E. & Marttinen, P., 2021, Machine Learning and Knowledge Discovery in Databases: Applied Data Science Track - European Conference, ECML PKDD 2021, Proceedings. Dong, Y., Kourtellis, N., Hammer, B. & Lozano, J. A. (toim.). Springer, s. 367-383 17 Sivumäärä (Lecture Notes in Computer Science (including subseries Lecture Notes in Artificial Intelligence and Lecture Notes in Bioinformatics); Vuosikerta 12978 LNAI).
Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussa › Conference article in proceedings › Scientific › vertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
6 Sitaatiot (Scopus)

75 Lataukset (Pure)
2020

Batch simulations and uncertainty quantification in Gaussian process surrogate approximate Bayesian computation
Järvenpää, M., Vehtari, A. & Marttinen, P., 2020, Conference on Uncertainty in Artificial Intelligence (UAI 2020). JMLR, Vuosikerta 124. (Proceedings of Machine Learning Research).
Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussa › Conference article in proceedings › Scientific › vertaisarvioitu

Open access
Dilated Convolutional Attention Network for Medical Code Assignment from Clinical Text
Ji, S., Cambria, E. & Marttinen, P., 2020, Proceedings of the 3rd Clinical Natural Language Processing Workshop. Association for Computational Linguistics, s. 73-78
Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussa › Conference article in proceedings › Scientific › vertaisarvioitu

Open access
Learning Global Pairwise Interactions with Bayesian Neural Networks
Cui, T., Marttinen, P. & Kaski, S., 24 elok. 2020, ECAI 2020 - 24th European Conference on Artificial Intelligence, including 10th Conference on Prestigious Applications of Artificial Intelligence, PAIS 2020 - Proceedings. De Giacomo, G., Catala, A., Dilkina, B., Milano, M., Barro, S., Bugarin, A. & Lang, J. (toim.). IOS Press, s. 1087-1094 8 Sivumäärä ( Frontiers in Artificial Intelligence and Applications; Vuosikerta 325).
Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussa › Conference article in proceedings › Scientific › vertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
8 Sitaatiot (Scopus)

59 Lataukset (Pure)
Predicting utilization of healthcare services from individual disease trajectories using RNNs with multi-headed attention
Kumar, Y., Salo, H., Nieminen, T., Vepsäläinen, K., Kulathinal, S. & Marttinen, P., 2020, Machine Learning for Health (ML4H) at NeurIPS 2019. JMLR, s. 93-111 (Conference on Neural Information Processing Systems).
Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussa › Conference article in proceedings › Scientific › vertaisarvioitu

Open access
2017
Interactive Elicitation of Knowledge on Feature Relevance Improves Predictions in Small Data Sets
Micallef, L., Sundin, I., Marttinen, P., Ammad-Ud-Din, M., Peltola, T., Soare, M., Jacucci, G. & Kaski, S., 7 maalisk. 2017, IUI 2017 - Proceedings of the 22nd International Conference on Intelligent User Interfaces. ACM, s. 547-552 6 Sivumäärä
Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussa › Conference article in proceedings › Scientific › vertaisarvioitu

Open access
21 Sitaatiot (Scopus)

Pekka Marttinen

Tutkimustuotos

Hakutulokset