Kimmo Kaski

Senior Advisor

Tutkimustuotokset

  1. 2008
  2. Julkaistu

    Critical evaluation of the computational methods used in the forced polymer translocation

    Lehtola, V., Linna, R. & Kaski, K., 2008, julkaisussa : Physical Review E. 78, 6, s. 61803-61010

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkeli

  3. Julkaistu

    Detecting modules in dense weighted networks with the Potts method

    Heimo, T., Kumpula, J. M., Kaski, K. & Saramäki, J., 2008, julkaisussa : Journal of Statistical Mechanics: Theory and Experiment. s. P08007/1-13

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkeli

  4. Julkaistu

    Efficient data structures for sparse network representation

    Hyvönen, J., Saramäki, J. & Kaski, K., 2008, julkaisussa : International Journal of Computer Mathematics. 85, 8, s. 1219-1233

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkeli

  5. Julkaistu

    Metabolic phenotypes, vascular complications, and premature deaths in a population of 4,197 patients with type 1 diabetes

    Mäkinen, V-P., Forsblom, C., Thorn, L. M., Waden, J., Gordin, D., Heikkilä, O., Hietala, K., Kyllönen, L., Kytö, J., Rosengard-Baerlund, M. & 6 muuta, Saraheimo, M., Tolonen, N., Parkkonen, M., Kaski, K., Ala-Korpela, M. & Groop, P-H., 2008, julkaisussa : DIABETES. 57, 9, s. 2480-2487

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkeli

  6. Julkaistu

    Modelling language competition: bilingualism and complex social networks

    Castello, X., Eguíluz, V. M., San Miguel, M., Loureiro-Porto, L., Toivonen, R., Saramäki, J. & Kaski, K., 2008, 7th International Conference on the Evolution of Language (EVOLANG7), Barcelona, Spain, March 2008. Andrew D. M. Smith, K. S. (toim.). World Scientific Publishing

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussavertaisarvioitu

  7. Julkaistu

    Multivariate biochemical basis of vascular complications and mortality in 4,197 patients with type I diabetes

    Mäkinen, V-P., Forsblom, C., Thorn, L. M., Waden, J., Gordin, D., Heikkilä, O., Hietala, K., Kytoe, J., Rosengard-Barlund, M., Saraheimo, M. & 4 muuta, Parkkonen, M., Kaski, K., Ala-Korpela, M. & Groop, P. H., 2008, julkaisussa : Diabetologia. 51, s. pp. S548-S548

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkeli

  8. Julkaistu

    Optimised methodology for 1H NMR lipidomics of serum

    Tynkkynen, T., Laatikainen, R., Tukiainen, T., Mäkinen, V. P., Groop, P-H., Kaski, K., Gröhn, O., Hallikainen, M., Soininen, H., Pirttilä, T. & 2 muuta, Ala-Korpela, M. & Soininen, P., 2008, (The 30th Finnish NMR Symposium, June 11-13, Helsinki, Finland, 2008).

    Tutkimustuotos: Työpaperi

  9. Julkaistu

    Reconsideration of hydrophobic lipid distributions in lipoprotein particles

    Kumpula, L., Kumpula, J., Taskinen, M-R., Jauhiainen, M., Kaski, K. & Ala-Korpela, M., 2008, julkaisussa : Chemistry and Physics of Lipids. 155, 1, s. 57-62

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkeli

  10. Julkaistu

    Sequential algorithm for fast clique percolation

    Kumpula, J. M., Kivelä, M., Kaski, K. & Saramäki, J., 2008, julkaisussa : Physical Review E. 78, 2, s. 026109

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkeli

  11. Julkaistu
  12. Julkaistu
  13. Julkaistu

    Towards the Multicomponent MDL Denoising

    Ojanen, J., Heikkonen, J. & Kaski, K., 2008, Festschrift in Honor of Jorma Rissanen on the Occasion of his 75th Birthday. Grünwald, P., Myllymäki, P., Tabus, I., Weinberger, M. & Yu, B. (toim.). Tampere: Tampere International Center for signal Processing, s. 205-212

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussavertaisarvioitu

  14. 2007
  15. Julkaistu

    1H NMR at 800 MHz Facilitates Detailed Phospholipid Follow-Up during Atherogenic Modifications in Low Density Lipoproteins

    Soininen, P., Öörni, K., Maaheimo, H., Laatikainen, R., Kovanen, P. T., Kaski, K. & Ala-Korpela, M., 2007, julkaisussa : Biochemical and Biophysical Research Communications. 360, 1, s. 290–294

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkeli

  16. Julkaistu

    1H NMR metabonomics of plasma lipoprotein subclasses: elucidation of metabolic clustering by self-organising maps

    Suna, T., Salminen, A., Soininen, P., Laatikainen, R., Ingman, P., Mäkelä, S., Savolainen, M. J., Hannuksela, M. L., Jauhiainen, M., Taskinen, M-R. & 2 muuta, Kaski, K. & Ala-Korpela, M., 2007, julkaisussa : NMR in Biomedicine. 20, s. 658-672 15 Sivumäärä

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkeli

  17. Julkaistu

    1H NMR metabonomics of serum in identifying lipoprotein subclass metabolism in the borkerline of health and disease

    Ala-Korpela, M., Mäkinen, V-P., Soininen, P., Brezmes, J., Salminen, A., Lankinen, N., Suna, T., Ingman, P., Cañellas, N., Mäkelä, S. & 6 muuta, Savolainen, M., Hannuksela, M., Forsblom, C., Correig, X., Groop, P-H. & Kaski, K., 2007, (The 29th Finnish NMR Symposium, June 13-15, Turku, FInland, 2007).

    Tutkimustuotos: Työpaperi

  18. Julkaistu

    1H NMR metabonomics of serum to identify and classify lipoprotein subclass profiles

    Ala-Korpela, M., Mäkelä, S., Salminen, A., Soininen, P., Suna, T., Lankinen, N., Ingman, P., Savolainen, M. J., Taskinen, M-R., Hannuksela, M. & 2 muuta, Jauhiainen, M. & Kaski, K., 2007, (The 76th Annual Congress of The European Atherosclerosis Society (EAS), June 10-13, Helsinki, Finland, 2007).

    Tutkimustuotos: Työpaperi

  19. Julkaistu
  20. Julkaistu

    1H NMR metabonomics of type 1 diabetes: a holistic approach to metabolic syndrome

    Mäkinen, V-P., Soininen, P., Forsblom, C., Parkkonen, M., Ingman, P., Kaski, K., Groop, P-H. & Ala-Korpela, M., 2007, The 2nd International Congress on Prediabetes and the Metabolic Syndrome, April 25-28, Barcelona, Spain, 2007.

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussavertaisarvioitu

  21. Julkaistu

    1H NMR metabonomics of type 1 diabetes: a holistic approach to metabolic syndrome

    Mäkinen, V-P., Soininen, P., Forsblom, C., Ingman, P., Kaski, K., Groop, P-H. & Ala-Korpela, M., 2007, The 76th Annual Congress of the European Atherosclerosis Society (EAS), June 8-9, Turku, Finland, 2007.

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussavertaisarvioitu

  22. Julkaistu

    1H NMR metabonomics to identify lipoprotein subclass profile: Metabolic syndrome at the borderline of health and disease

    Ala-Korpela, M., Mäkinen, V-P., Soininen, P., Brezmes, J., Salminen, A., Lankinen, N., Suna, T., Ingman, P., Cañellas-Alberich, N., Mäkelä, S. & 6 muuta, Savolainen, M., Hannuksela, M., Forsblom, C., Correig-Blanchar, X., Groop, P-H. & Kaski, K., 2007, (EUROMAR Magnetic Resonance Conference, July 1-6, Tarragona, Spain, 2007).

    Tutkimustuotos: Työpaperi

  23. Julkaistu

    Affinity propagation algorithms: A new way to classify 1H NMR metabonomics data on serum lipoproteins

    Cañellas, N., Brezmes, J., Salminen, A., Soininen, P., Kaski, K., Correig, X. & Ala-Korpela, M., 2007, (The Conferentia Chemometrica 2007 (2007), September 2-5, Budapest, Hungary, 2007).

    Tutkimustuotos: Työpaperi

  24. Julkaistu

    Analysis of a large-scale weighted network of one-to-one human communications

    Onnela, J-P., Saramäki, J., Hyvönen, J., Szabó, G., Argollo de Menezes, M., Kaski, K., Barabási, A-L. & Kertész, J., 2007, julkaisussa : New Journal of Physics. 9, 179

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkeli

  25. Julkaistu

    Anomalous lifetime distributions and topological traps in ordering dynamics

    Castelló, X., Toivonen, R., Equíluz, V. M., Saramäki, J., Kaski, K. & San Miguel, M., 2007, julkaisussa : Europhysics Letters. 79, 66006

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkeli

  26. Julkaistu

    A novel Bayesian approach to quantify clinical variables and to determine their spectroscopic counterparts in 1H NMR metabonomic data

    Vehtari, A., Mäkinen, V-P., Soininen, P., Ingman, P., Mäkelä, S. M., Savolainen, M. J., Hannuksela, M. L., Kaski, K. & Ala-Korpela, M., 2007, julkaisussa : BMC Bioinformatics. 8, Supplement 2, s. S8

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkeli

  27. Julkaistu

    Application of 1H NMR spectroscopy of serum to study alcohol-related metabolic effects

    Peltola, T., Mäkinen, V-P., Mäkelä, S., Laitinen, M., Soininen, P., Ingman, P., Nissinen, A., Savolainen, M., Hannuksela, M., Kaski, K. & 1 muuta, Ala-Korpela, M., 2007, (The 29th Finnish NMR Symposium, June 13-15, Turku, Finland, 2007).

    Tutkimustuotos: Työpaperi

  28. Julkaistu

    A probabilistic approach to the assessment of metabolic synrome using 1H NMR spectroscopy of serum and Fuzzy Artmap neural networks

    Brezmes, J., Cañellas, N., Salminen, A., Soininen, P., Kaski, K., Correig, X. & Ala-Korpela, M., 2007, The Conferentia Chemometrica2007 (200), September 2-5, Budapest, Hungary, 2007.

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussavertaisarvioitu

  29. Julkaistu

    A quantitative Bayesian approach to metabonomic 1H NMR data of serum

    Jylänki, P., Niemi, J., Mäkinen, V-P., Salminen, A., Vanhatalo, L., Soininen, P., Ingman, P., Kaski, K., Groop, P-H., Vehtari, A. & 1 muuta, Ala-Korpela, M., 2007, The Conferentia Chemometrica 2007 (CC 2007), September 2-5, Budapest, Hungary.

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussavertaisarvioitu

  30. Julkaistu

    Assessment of multi-molecular associations in cognitive decline by 1H NMR metabonomics of serum

    Tukiainen, T., Hokkanen, J., Mäkinen, V-P., Tynkkynen, T., Soininen, P., Gröhn, O., Hallikainen, M., Soininen, H., Kaski, K., Laatikainen, R. & 2 muuta, Pirttilä, T. & Ala-Korpela, M., 2007, The 29th Finnish NMR Symposium, June 13-15, Turku, Finland, 2007.

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussavertaisarvioitu

  31. Julkaistu

    Atherosclerotic serum lipoprotein profiles predispose to Alzheimer´s disease - a pilot study by 1H NMR metabonomics

    Hokkanen, J., Tukiainen, T., Mäkinen, V-P., Tynkkynen, T., Soininen, P., Gröhn, O., Hallikainen, M., Soininen, H., Kaski, K., Laatikainen, R. & 2 muuta, Pirttilä, T. & Ala-Korpela, M., 2007, (The 29th Finnis NMR Symposium, June 13-15, Turku, Finland, 2007).

    Tutkimustuotos: Työpaperi

  32. Julkaistu
  33. Julkaistu

    Complex turing patterns in non-linearly coupled systems

    Kyttä, K., Kaski, K. & Barrio, R. A., 2007, julkaisussa : Physica A: Statistical Mechanics and its Applications. 385, 1, s. 105-114

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkeli

  34. Julkaistu

    Compositional and metabolic associations of lipids in VLDL, IDL, LDL, HDL2 and HDL3 by self-organising maps

    Kumpula, L. S., Mäkelä, S., Mäkinen, V-P., Savolainen, M. J., Kaski, K., Hannuksela, M. L. & Ala-Korpela, M., 2007, s. 212. 1 Sivumäärä.

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussaKonferenssiesitys

  35. Julkaistu

    Detailed phospholipid lollow-up during atherogenic modifications of lipoprotein particle by 1H NMR at 800 MHz

    Soininen, P., Öörni, K., Maaheimo, H., Laatikainen, R., Kovanen, P. T., Kaski, K. & Ala-Korpela, M., 2007, (The 29th Finnish NMR Symposium, June 13-15, Turku, Finland, 2007).

    Tutkimustuotos: Työpaperi

  36. Julkaistu

    Emergence of communities in weighted complex networks

    Kumpula, J. M., Onnela, J-P., Saramäki, J., Kaski, K. & Kertész, J., 2007, julkaisussa : Physical Review Letters. 99, 228701

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkeli

  37. Julkaistu

    Emergence of self-sustained patterns in small-world excitable media

    Sinha, S., Saramäki, J. & Kaski, K., 2007, julkaisussa : Physical Review E. 76, 1, s. 015101 4 Sivumäärä

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkeli

  38. Julkaistu
  39. Julkaistu

    Identification of lipoprotein subclass profile characteristic to metabolic syndrome by proton NMR metabonomics of serum

    Ala-Korpela, M., Suna, T., Salminen, A., Brezmes, J., Soininen, P., Tynkkynen, T., Mäkelä, S. M., Lankinen, N., Peltola, T., Kumpula, L. S. & 8 muuta, Mäkinen, V-P., Savolainen, M. J., Correig, X., Laatikainen, R., Taskinen, M-R., Jauhiainen, M., Hannuksela, M. L. & Kaski, K., 2007, The 76th Annual Congress of the European Atherosclerosis Society (EAS), June 8-9, Turku, Finland, 2007.

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussavertaisarvioitu

  40. Julkaistu
  41. Julkaistu

    Limited resolution and multiresolution methods in complex networks community detection

    Kumpula, J., Saramäki, J., Kaski, K. & Kertész, J., 2007, Noise and Stochastics in Complex Systems and Finance, 20.-24.5.2007, Firenze, Italia. Kertész et al, J. (toim.).

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussavertaisarvioitu

  42. Julkaistu
  43. Julkaistu

    Molecular dynamics simulations of temperature-induced structural transitions at twist boundaries in silicon

    Von Alfthan, S., Kaski, K. & Sutton, A. P., 2007, julkaisussa : Physical Review B. 76, 24, 245317.

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkeli

  44. Julkaistu

    Multi-metabolite characterisation of the diabetic state by 1H NMR metabonomics - application of self-organising maps

    Mäkinen, V-P., Soininen, P., Kaski, K., Groop, P-H. & Ala-Korpela, M., 2007, (The Conferentia Chemometrica 2007 (2007), September 2-5, Budapest, Hungary).

    Tutkimustuotos: Työpaperi

  45. Julkaistu

    Multi-metabolite characterization of the diabetic state by 1H NMR metabonomics

    Mäkinen, V-P., Soininen, P., Forsblom, C., Parkkonen, M., Ingman, P., Kaski, K. & Groop, P-H., 2007, The 29th Finnish NMR Symposium June 13-15, Turku, Finland, 2007.

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussavertaisarvioitu

  46. Julkaistu

    Proton NMR metabonomics of serum to identify lipoprotein subclass distribution in the borkerline of health and disease: case metabolic sydrome

    Ala-Korpela, M., Brezmes, J., Tynkkynen, T., Mäkelä, S. M., Soininen, P., Salminen, A., Suna, T., Lankinen, N., Peltola, T., Kumpula, L. S. & 8 muuta, Mäkinen, V-P., Savolainen, M. J., Correig-Blanchar, X., Laatikainen, R., Taskinen, M-R., Jauhiainen, M., Hannuksela, M. L. & Kaski, K., 2007, (The 2nd International Congress on Prediabetes and the Metabolic Syndrome, April 25-28, Barcelona, Spain, 2007).

    Tutkimustuotos: Työpaperi

  47. Julkaistu

    Proton NMR metabonomics of type 1 diabetes reveals multivariate biochemical characteristics of diabetic complications

    Mäkinen, V-P., Soininen, P., Forsblom, C., Parkkonen, M., Ingman, P., Kaski, K., Ala-Korpela, M. & Groop, P-H., 2007, julkaisussa : Diabetologia. 50, 1, S466

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkeli

  48. Julkaistu

    Proton NMR metabonomics of type 1 diabetes reveals multivariate biochemical characteristics of diabetic complications

    Mäkinen, V-P., Soininen, P., Forsblom, C., Parkkonen, M., Ingman, P., Kaski, K., Ala-Korpela, M. & Groop, P-H., 2007, (The Netherlands, 2007).

    Tutkimustuotos: Työpaperi

  49. Julkaistu
  50. Julkaistu

    Structure and tie strengths in mobile communication networks

    Onnela, J-P., Saramäki, J., Hyvönen, J., Szabó, G., Lazer, D., Kaski, K., Kertész, J. & Barabási, A-L., 2007, julkaisussa : Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 104, 7332

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkeli

  51. Julkaistu

    Temperature-induced structural transitions at twist boundaries in silicon

    von Alfthan, S., Sutton, A. & Kaski, K., 2007, julkaisussa : Physical Review B. 76

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkeli

  52. Julkaistu

    The inherent accuracy of H-1 NMR spectroscopy to quantify plasma lipoproteins is subclass dependent

    Ala-Korpela, M., Lankinen, N., Salminen, A., Suna, T., Soininen, P., Laatikainen, R., Ingman, P., Jauhiainen, M., Taskinen, M-R., Héberger, K. & 1 muuta, Kaski, K., 2007, julkaisussa : Atherosclerosis. 190, 2, s. 352–358

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkeli

ID: 66086