• Aalto SCI Computer Science Konemiehentie 2

20062020

Tutkimustuotoksia vuodessa

Jos olet muokannut tietoja Puressa, ne näkyvät pian tässä.

Henkilökohtainen profiili

Tutkimusalue

I am interested in developing principled machine learning methods, models and tools for computational and data science. My methods toolbox is primarily built on regularised learning, kernels and sparsity, as well as efficient convex/non-convex optimisation methods. My favourite topics include learning with multiple and structured targets, multiple views and ensembles. Applications of interest include metabolomics, biomedicine, pharmacology and synthetic biology.

Koulutus / tieteellinen pätevyys

Fil. toht., tietojenkäsittelytiede

Keywords

  • Algorithms
  • Metabolomics
  • Graph and network data
  • Structured prediction
  • Kernel methods
  • Machine learning

Sormenjälki Sukella tutkimusaiheisiin, joissa Juho Rousu on aktiivinen. Nämä aihemerkinnät ovat peräisin tämän henkilön teoksista. Yhdessä ne muodostavat ainutlaatuisen sormenjäljen.

  • 1 Samanlaiset profiilit

Verkko Viimeisin maatasolla toteutettu yhteistyö. Saat syvempiä lisätietoja pisteitä napsauttamalla.

Tutkimustuotos

Bayesian metabolic flux analysis reveals intracellular flux couplings

Heinonen, M., Osmala, M., Mannerström, H., Wallenius, J., Kaski, S., Rousu, J. & Lähdesmäki, H., 15 heinäkuuta 2019, julkaisussa : Bioinformatics. 35, 14, s. i548-i557 btz315.

Tutkimustuotos: LehtiartikkeliArticleScientificvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
  • 86 Lataukset (Pure)

    Improved Small Molecule Identification through Learning Combinations of Kernel Regression Models

    Brouard, C., Basse, A., d'Alche-Buc, F. & Rousu, J., elokuuta 2019, julkaisussa : METABOLITES. 9, 8, 14 Sivumäärä, 160.

    Tutkimustuotos: LehtiartikkeliArticleScientificvertaisarvioitu

    Open access
    Tiedosto
    1 Sitaatiot (Scopus)
    116 Lataukset (Pure)

    Large-Scale Sparse Kernel Canonical Correlation Analysis

    Uurtio, V., Bhadra, S. & Rousu, J., 2019, 36th International Conference on Machine Learning, ICML 2019. s. 6383-6391 9 Sivumäärä (Proceedings of Machine Learning Research; Vuosikerta 97).

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussaConference contributionScientificvertaisarvioitu

    Open access
    Tiedosto
  • 7 Lataukset (Pure)

    SIRIUS 4: a rapid tool for turning tandem mass spectra into metabolite structure information

    Dührkop, K., Fleischauer, M., Ludwig, M., Aksenov, A. A., Melnik, A. V., Meusel, M., Dorrestein, P. C., Rousu, J. & Böcker, S., 1 huhtikuuta 2019, julkaisussa : Nature Methods. 16, 4, s. 299-302 4 Sivumäärä

    Tutkimustuotos: LehtiartikkeliArticleScientificvertaisarvioitu

    Open access
    Tiedosto
  • 57 Sitaatiot (Scopus)
    310 Lataukset (Pure)

    Analysis of fluxomic experiments with principal metabolic flux mode analysis

    Bhadra, S. & Rousu, J., 1 tammikuuta 2018, Methods in Molecular Biology. Mamitsuka, H. (toim.). s. 141-161 21 Sivumäärä (Methods in Molecular Biology; Vuosikerta 1807).

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussaChapterScientificvertaisarvioitu

  • Projektit

    Koneoppimismenetelmät antibioottiresistenssin digitaalisessa diagnoosissa

    Rousu, J., Huusari, R. & Xiang, W.

    01/01/202031/12/2022

    Projekti: Academy of Finland: Other research funding

    Koneoppimismenetelmät laskennallisessa metabolomiikassa

    Rousu, J., Bach, E., Brouard, C., Sabzevari, M. & Huusari, R.

    01/09/201731/08/2021

    Projekti: Academy of Finland: Other research funding

    AI4SynBio: Artificial Intelligence for SynBio Powerhouse

    Rousu, J. & Sabzevari, M.

    01/07/201831/12/2019

    Projekti: Other external funding: Other public funding

    Tensoripohjainen koneoppiminen biolääketieteessä

    Rousu, J., Mapar, P., Uurtio, V., Shadbahr, T., Sabzevari, M. & Julkunen, H.

    01/01/201831/12/2019

    Projekti: Academy of Finland: Other research funding

    Datalähtöinen päätöksenteko digitaalisessa terveydenhuollossa

    Rousu, J., Mapar, P., Sivula, T., Cichonska, A., Nguyen Van, L., Brouard, C., Szedmak, S. & Julkunen, H.

    01/01/201621/09/2018

    Projekti: Academy of Finland: Other research funding

    Palkinnot

  • PhD thesis award

    Juho Rousu (Supervisor) & Huibin Shen (Recipient), 11 toukokuuta 2018

    Palkinto: Palkinto tai huomionosoitus tuotoksesta

  • Second place in Critical Assesment of Metabolite Identification (CASMI) contest 2016

    Juho Rousu (Recipient), Kai Duehrkop (Recipient), Sebastian Böcker (Recipient), Huibin Shen (Recipient) & Marvin Meusel (Recipient), 6 toukokuuta 2016

    Palkinto: Sijoittuminen kilpailussa tai osallistuminen kutsukilpailuun

  • Semi-Finalist in Helsinki Challenge competition

    Juho Rousu (Recipient), 2017

    Palkinto: Sijoittuminen kilpailussa tai osallistuminen kutsukilpailuun

    Winner in Critical Assesment of Metabolite Identification (CASMI) contest 2016

    Juho Rousu (Recipient), Celine Brouard (Recipient), Huibin Shen (Recipient), Sebastian Böcker (Recipient) & Kai Duehrkop (Recipient), 6 toukokuuta 2016

    Palkinto: Sijoittuminen kilpailussa tai osallistuminen kutsukilpailuun

  • Aktiviteetit

    Predicting Drug Interactions with Kernel Methods

    Juho Rousu (Puhuja)
    27 toukokuuta 2019

    Aktiviteetti: Julkinen esitelmä

    Sparse Non-linear Canonical Correlation Analysis

    Juho Rousu (Puhuja)
    2 toukokuuta 2019

    Aktiviteetti: Julkinen esitelmä

    Predicting multi-view and structured data with kernel methods

    Juho Rousu (Puhuja)
    1 toukokuuta 2019

    Aktiviteetti: Julkinen esitelmä

    Predicting multi-view and structured data with kernel methods

    Juho Rousu (Puhuja)
    10 toukokuuta 2019

    Aktiviteetti: Julkinen esitelmä

    University of Glasgow

    Juho Rousu (Visiting researcher)
    8 huhtikuuta 201920 kesäkuuta 2019

    Aktiviteetti: Vierailu ulkomaille

    Lehtileikkeet

    Principal Metabolic Flux Mode Analysis

    Juho Rousu

    06/02/2018

    1 kohde/ Medianäkyvyys

    Lehdistö/media: Esiintyminen mediassa

    UEF researchers compete in semi-finals of Helsinki Challenge

    Juho Rousu

    19/01/2017

    1 kohde/ Medianäkyvyys

    Lehdistö/media: Esiintyminen mediassa

    Big Data can help leukemia patients and prematurely born babies

    Juho Rousu

    16/01/2016

    1 kohde/ Medianäkyvyys

    Lehdistö/media: Esiintyminen mediassa

    Search engine for more accurate and fast recognition of metabolites

    Juho Rousu

    01/10/2015

    2 kohdetta/ Medianäkyvyys

    Lehdistö/media: Esiintyminen mediassa