Hiroshi Mamitsuka

FiDiPro professor

  • Puhelin+358504301880
  • Aalto SCI Computer Science Konemiehentie 2

20152020

Tutkimustuotoksia vuodessa

Jos olet muokannut tietoja Puressa, ne näkyvät pian tässä.

Tutkimustuotos

Suodatin
Article
2020

FullMeSH: Improving large-scale MeSH indexing with full text

Dai, S., You, R., Lu, Z., Huang, X., Mamitsuka, H. & Zhu, S., 1 maaliskuuta 2020, julkaisussa : Bioinformatics. 36, 5, s. 1533-1541 9 Sivumäärä

Tutkimustuotos: LehtiartikkeliArticleScientificvertaisarvioitu

1 Sitaatiot (Scopus)

HPOLabeler: improving prediction of human protein-phenotype associations by learning to rank

Liu, L., Huang, X., Mamitsuka, H. & Zhu, S., 15 elokuuta 2020, julkaisussa : Bioinformatics (Oxford, England). 36, 14, s. 4180-4188 9 Sivumäärä

Tutkimustuotos: LehtiartikkeliArticleScientificvertaisarvioitu

2019

ADAPTIVE: LeArning DAta-dePendenT, concIse molecular VEctors for fast, accurate metabolite identification from tandem mass spectra

Nguyen, D. H., Nguyen, C. H. & Mamitsuka, H., 15 heinäkuuta 2019, julkaisussa : Bioinformatics. 35, 14, s. i164-i172 btz319.

Tutkimustuotos: LehtiartikkeliArticleScientificvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
5 Sitaatiot (Scopus)
68 Lataukset (Pure)

Community assessment to advance computational prediction of cancer drug combinations in a pharmacogenomic screen

Kaski, S. & Marttinen, P., 17 kesäkuuta 2019, julkaisussa : Nature Communications. 10, 1, s. 1-17 17 Sivumäärä, 2674.

Tutkimustuotos: LehtiartikkeliArticleScientificvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
30 Sitaatiot (Scopus)
98 Lataukset (Pure)

HPOAnnotator: improving large-scale prediction of HPO annotations by low-rank approximation with HPO semantic similarities and multiple PPI networks

Gao, J., Liu, L., Yao, S., Huang, X., Mamitsuka, H. & Zhu, S., 23 joulukuuta 2019, julkaisussa : BMC Medical Genomics . 12, 14 Sivumäärä, 187.

Tutkimustuotos: LehtiartikkeliArticleScientificvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
20 Lataukset (Pure)
Open access
Tiedosto
145 Lataukset (Pure)

Modelling G×E with historical weather information improves genomic prediction in new environments

Gillberg, J., Marttinen, P., Mamitsuka, H. & Kaski, S., 15 lokakuuta 2019, julkaisussa : Bioinformatics (Oxford, England). 35, 20, s. 4045-4052 8 Sivumäärä

Tutkimustuotos: LehtiartikkeliArticleScientificvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
1 Sitaatiot (Scopus)
45 Lataukset (Pure)

NetGO: improving large-scale protein function prediction with massive network information

You, R., Yao, S., Xiong, Y., Huang, X., Sun, F., Mamitsuka, H. & Zhu, S., 2 heinäkuuta 2019, julkaisussa : Nucleic Acids Research. 47, W1, s. W379-W387

Tutkimustuotos: LehtiartikkeliArticleScientificvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
8 Sitaatiot (Scopus)
66 Lataukset (Pure)

Recent advances and prospects of computational methods for metabolite identification: a review with emphasis on machine learning approaches

Nguyen, D. H., Nguyen, C. H. & Mamitsuka, H., 27 marraskuuta 2019, julkaisussa : BRIEFINGS IN BIOINFORMATICS. 20, 6, s. 2028-2043 16 Sivumäärä

Tutkimustuotos: LehtiartikkeliArticleScientificvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
26 Lataukset (Pure)
2018

GOLabeler: Improving sequence-based large-scale protein function prediction by learning to rank

You, R., Zhang, Z., Xiong, Y., Sun, F., Mamitsuka, H. & Zhu, S., 15 heinäkuuta 2018, julkaisussa : Bioinformatics. 34, 14, s. 2465-2473 9 Sivumäärä

Tutkimustuotos: LehtiartikkeliArticleScientificvertaisarvioitu

26 Sitaatiot (Scopus)

SIMPLE Sparse Interaction Model over Peaks of moLEcules for fast, interpretable metabolite identification from tandem mass spectra

Nguyen, D. H., Nguyen, C. H. & Mamitsuka, H., 1 heinäkuuta 2018, julkaisussa : Bioinformatics. 34, 13, s. i323-i332 10 Sivumäärä

Tutkimustuotos: LehtiartikkeliArticleScientificvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
6 Sitaatiot (Scopus)
54 Lataukset (Pure)

Ultra High-Dimensional Nonlinear Feature Selection for Big Biological Data

Yamada, M., Tang, J., Lugo-Martinez, J., Hodzic, E., Shrestha, R., Saha, A., Ouyang, H., Yin, D., Mamitsuka, H., Sahinalp, C., Radivojac, P., Menczer, F. & Chang, Y., 1 heinäkuuta 2018, julkaisussa : IEEE Transactions on Knowledge and Data Engineering. 30, 7, s. 1352-1365 14 Sivumäärä

Tutkimustuotos: LehtiartikkeliArticleScientificvertaisarvioitu

16 Sitaatiot (Scopus)
2017

A Community Challenge for Inferring Genetic Predictors of Gene Essentialities through Analysis of a Functional Screen of Cancer Cell Lines

Gönen, M., Weir, B. A., Cowley, G. S., Vazquez, F., Guan, Y., Jaiswal, A., Karasuyama, M., Uzunangelov, V., Wang, T., Tsherniak, A., Howell, S., Marbach, D., Hoff, B., Norman, T. C., Airola, A., Bivol, A., Bunte, K., Carlin, D., Chopra, S., Deran, A. & 25 muuta, Ellrott, K., Gopalacharyulu, P., Graim, K., Kaski, S., Khan, S. A., Newton, Y., Ng, S., Pahikkala, T., Paull, E., Sokolov, A., Tang, H., Tang, J., Wennerberg, K., Xie, Y., Zhan, X., Zhu, F., Aittokallio, T., Mamitsuka, H., Stuart, J. M., Boehm, J. S., Root, D. E., Xiao, G., Stolovitzky, G., Hahn, W. C. & Margolin, A. A., 2017, julkaisussa : Cell Systems. 5, 5, s. 485-497

Tutkimustuotos: LehtiartikkeliArticleScientificvertaisarvioitu

8 Sitaatiot (Scopus)

Adaptive edge weighting for graph-based learning algorithms

Karasuyama, M. & Mamitsuka, H., 2017, julkaisussa : Machine Learning. 106, 2, s. 307-335

Tutkimustuotos: LehtiartikkeliArticleScientificvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
8 Sitaatiot (Scopus)
414 Lataukset (Pure)

Generalized Sparse Learning of Linear Models Over the Complete Subgraph Feature Set

Takigawa, I. & Mamitsuka, H., 13 helmikuuta 2017, julkaisussa : IEEE Transactions on Pattern Analysis and Machine Intelligence. 39, 3, s. 617-624 8 Sivumäärä, 7469410.

Tutkimustuotos: LehtiartikkeliArticleScientificvertaisarvioitu

3 Sitaatiot (Scopus)
2016

DeepMeSH: Deep semantic representation for improving large-scale MeSH indexing

Peng, S., You, R., Wang, H., Zhai, C., Mamitsuka, H. & Zhu, S., 15 kesäkuuta 2016, julkaisussa : Bioinformatics. 32, 12, s. i70-i79 10 Sivumäärä

Tutkimustuotos: LehtiartikkeliArticleScientificvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
38 Sitaatiot (Scopus)
106 Lataukset (Pure)

DrugE-Rank: Improving drug-target interaction prediction of new candidate drugs or targets by ensemble learning to rank

Yuan, Q., Gao, J., Wu, D., Zhang, S., Mamitsuka, H. & Zhu, S., 15 kesäkuuta 2016, julkaisussa : Bioinformatics. 32, 12, s. i18-i27 10 Sivumäärä

Tutkimustuotos: LehtiartikkeliArticleScientificvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
56 Sitaatiot (Scopus)
75 Lataukset (Pure)