FiDiPro professor Hiroshi Mamitsuka

Vieraileva professori

Tutkimustuotokset

  1. 2020
  2. Julkaistu

    Scaled coupled norms and coupled higher-order tensor completion

    Wimalawarne, K., Yamada, M. & Mamitsuka, H., 1 helmikuuta 2020, julkaisussa : Neural Computation. 32, 2, s. 447-484 38 Sivumäärä

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkeli

  3. 2019
  4. Julkaistu

    HPOAnnotator: improving large-scale prediction of HPO annotations by low-rank approximation with HPO semantic similarities and multiple PPI networks

    Gao, J., Liu, L., Yao, S., Huang, X., Mamitsuka, H. & Zhu, S., 23 joulukuuta 2019, julkaisussa : BMC Medical Genomics . 12, 14 Sivumäärä, 187.

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkeli

  5. Julkaistu

    Recent advances and prospects of computational methods for metabolite identification: a review with emphasis on machine learning approaches

    Nguyen, D. H., Nguyen, C. H. & Mamitsuka, H., 27 marraskuuta 2019, julkaisussa : BRIEFINGS IN BIOINFORMATICS. 20, 6, s. 2028-2043 16 Sivumäärä

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkeli

  6. Julkaistu
  7. Julkaistu

    ADAPTIVE: LeArning DAta-dePendenT, concIse molecular VEctors for fast, accurate metabolite identification from tandem mass spectra

    Nguyen, D. H., Nguyen, C. H. & Mamitsuka, H., 15 heinäkuuta 2019, julkaisussa : Bioinformatics. 35, 14, s. i164-i172 btz319.

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkeli

  8. Julkaistu

    NetGO: improving large-scale protein function prediction with massive network information

    You, R., Yao, S., Xiong, Y., Huang, X., Sun, F., Mamitsuka, H. & Zhu, S., 2 heinäkuuta 2019, julkaisussa : Nucleic Acids Research. 47, W1, s. W379-W387

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkeli

  9. Julkaistu

    Community assessment to advance computational prediction of cancer drug combinations in a pharmacogenomic screen

    AstraZeneca-Sanger Drug Combination DREAM Consortium, Kaski, S. & Marttinen, P., 17 kesäkuuta 2019, julkaisussa : Nature Communications. 10, 1, s. 1-17 17 Sivumäärä, 2674.

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkeli

  10. Julkaistu

    Machine Learning for Marketing

    Mamitsuka, H., 9 kesäkuuta 2019, 237 Sivumäärä

    Tutkimustuotos: Kirja

  11. Julkaistu

    CalCleaveMKL: a Tool for Calpain Cleavage Prediction

    duVerle, D. A. & Mamitsuka, H., 1 tammikuuta 2019, Calpain. s. 121-147 27 Sivumäärä (Methods in molecular biology; painos 1915).

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussavertaisarvioitu

  12. Julkaistu

    Fast and Robust Multi-View Multi-Task Learning via Group Sparsity

    Sun, L., Nguyen, C. H. & Mamitsuka, H., 2019, Proceedings of the Twenty-Eighth International Joint Conference on Artificial Intelligence, IJCAI 2019, Macao, China, August 10-16, 2019. s. 3499-3505 7 Sivumäärä

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussavertaisarvioitu

  13. Julkaistu
  14. Julkaistu

    Multiplicative Sparse Feature Decomposition for Efficient Multi-View Multi-Task Learning

    Sun, L., Nguyen, C. H. & Mamitsuka, H., 2019, Proceedings of the 28th International Joint Conference on Artificial Intelligence, IJCAI 2019. s. 3506-3512 7 Sivumäärä

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussavertaisarvioitu

  15. 2018
  16. Julkaistu

    Convex Coupled Matrix and tensor completion

    Wimalawarne, K., Yamada, M. & Mamitsuka, H., 1 marraskuuta 2018, julkaisussa : Neural Computation. 30, 11, s. 3095-3127 33 Sivumäärä

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkeli

  17. Julkaistu
  18. Julkaistu

    GOLabeler: Improving sequence-based large-scale protein function prediction by learning to rank

    You, R., Zhang, Z., Xiong, Y., Sun, F., Mamitsuka, H. & Zhu, S., 15 heinäkuuta 2018, julkaisussa : Bioinformatics. 34, 14, s. 2465-2473 9 Sivumäärä

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkeli

  19. Julkaistu

    SIMPLE Sparse Interaction Model over Peaks of moLEcules for fast, interpretable metabolite identification from tandem mass spectra

    Nguyen, D. H., Nguyen, C. H. & Mamitsuka, H., 1 heinäkuuta 2018, julkaisussa : Bioinformatics. 34, 13, s. i323-i332 10 Sivumäärä

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkeli

  20. Julkaistu

    Ultra High-Dimensional Nonlinear Feature Selection for Big Biological Data

    Yamada, M., Tang, J., Lugo-Martinez, J., Hodzic, E., Shrestha, R., Saha, A., Ouyang, H., Yin, D., Mamitsuka, H., Sahinalp, C. & 3 muuta, Radivojac, P., Menczer, F. & Chang, Y., 1 heinäkuuta 2018, julkaisussa : IEEE Transactions on Knowledge and Data Engineering. 30, 7, s. 1352-1365 14 Sivumäärä

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkeli

  21. Julkaistu

    Data Mining for Systems Biology: Methods and Protocols

    Mamitsuka, H. (toim.), 1 tammikuuta 2018, 2nd toim. (Methods in Molecular Biology; painos 1807)

    Tutkimustuotos: Kirja

  22. Julkaistu

    DrugE-rank: Predicting drug-target interactions by learning to rank

    Deng, J., Yuan, Q., Mamitsuka, H. & Zhu, S., 1 tammikuuta 2018, Methods in Molecular Biology. s. 195-202 8 Sivumäärä (Methods in Molecular Biology; painos 1807).

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussavertaisarvioitu

  23. Julkaistu

    MeSHLabeler and DeepMeSH: Recent progress in large-scale MeSH indexing

    Peng, S., Mamitsuka, H. & Zhu, S., 1 tammikuuta 2018, Methods in Molecular Biology. s. 203-209 7 Sivumäärä (Methods in Molecular Biology; painos 1807).

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussavertaisarvioitu

  24. Julkaistu

    Preface

    Mamitsuka, H., 1 tammikuuta 2018, Data Mining for Systems Biology: Methods and Protocols. 2 toim. s. v-vi (Methods in Molecular Biology; painos 1807).

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussavertaisarvioitu

  25. Julkaistu

    SiBIC: A tool for generating a network of biclusters captured by maximal frequent itemset mining

    Takahashi, K. I., duVerle, D. A., Yotsukura, S., Takigawa, I. & Mamitsuka, H., 1 tammikuuta 2018, Methods in Molecular Biology. s. 95-111 17 Sivumäärä (Methods in Molecular Biology; painos 1807).

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussavertaisarvioitu

  26. Julkaistu

    AiProAnnotator: Low-rank Approximation with network side information for high-performance, large-scale human Protein abnormality Annotator

    Gao, J., Yao, S., Mamitsuka, H. & Zhu, S., 2018, Proceedings - 2018 IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine, BIBM 2018. s. 13-20 8 Sivumäärä 8621517

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussavertaisarvioitu

  27. Julkaistu

    Efficient Convex Completion of Coupled Tensors using Coupled Nuclear Norms

    Wimalawarne, K. & Mamitsuka, H., 2018, s. 6902-6910. 9 Sivumäärä.

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussaKonferenssiesitysvertaisarvioitu

  28. Julkaistu

    Factor Analysis on a Graph

    Karasuyama, M. & Mamitsuka, H., 2018, Proceedings of the Twenty-First International Conference on Artificial Intelligence and Statistics. Storkey, A. & Perez-Cruz, F. (toim.). s. 1117-1126 (Proceedings of Machine Learning Research; painos 84).

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussavertaisarvioitu

  29. 2017
  30. Julkaistu

    Convex factorization machine for toxicogenomics prediction

    Yamada, M., Lian, W., Goyal, A., Chen, J., Wimalawarne, K., Khan, S. A., Kaski, S., Mamitsuka, H. & Chang, Y., 13 elokuuta 2017, KDD 2017 - Proceedings of the 23rd ACM SIGKDD International Conference on Knowledge Discovery and Data Mining. ACM, s. 1215-1224 10 Sivumäärä

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussavertaisarvioitu

  31. Julkaistu

    Generalized Sparse Learning of Linear Models Over the Complete Subgraph Feature Set

    Takigawa, I. & Mamitsuka, H., 13 helmikuuta 2017, julkaisussa : IEEE Transactions on Pattern Analysis and Machine Intelligence. 39, 3, s. 617-624 8 Sivumäärä, 7469410.

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkeli

  32. Julkaistu

    A Community Challenge for Inferring Genetic Predictors of Gene Essentialities through Analysis of a Functional Screen of Cancer Cell Lines

    Gönen, M., Weir, B. A., Cowley, G. S., Vazquez, F., Guan, Y., Jaiswal, A., Karasuyama, M., Uzunangelov, V., Wang, T., Tsherniak, A. & 35 muuta, Howell, S., Marbach, D., Hoff, B., Norman, T. C., Airola, A., Bivol, A., Bunte, K., Carlin, D., Chopra, S., Deran, A., Ellrott, K., Gopalacharyulu, P., Graim, K., Kaski, S., Khan, S. A., Newton, Y., Ng, S., Pahikkala, T., Paull, E., Sokolov, A., Tang, H., Tang, J., Wennerberg, K., Xie, Y., Zhan, X., Zhu, F., Aittokallio, T., Mamitsuka, H., Stuart, J. M., Boehm, J. S., Root, D. E., Xiao, G., Stolovitzky, G., Hahn, W. C. & Margolin, A. A., 2017, julkaisussa : Cell Systems. 5, 5, s. 485-497

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkeli

  33. Julkaistu

    Adaptive edge weighting for graph-based learning algorithms

    Karasuyama, M. & Mamitsuka, H., 2017, julkaisussa : Machine Learning. 106, 2, s. 307-335

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkeli

  34. 2016
  35. Julkaistu

    A Robust Convex Formulation for Ensemble Clustering

    Gao, J., Yamada, M., Kaski, S., Mamitsuka, H. & Zhu, S., heinäkuuta 2016, Proceedings of the Twenty-Fifth International Joint Conference on Artificial Intelligence (IJCAI-16). Kambhampati, S. (toim.). 2275 East Bayshore Road, Suite 160, Palo Alto CA 94303 USA: AAAI PRESS, s. 1476-1482 6 Sivumäärä

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussavertaisarvioitu

  36. Julkaistu

    DeepMeSH: Deep semantic representation for improving large-scale MeSH indexing

    Peng, S., You, R., Wang, H., Zhai, C., Mamitsuka, H. & Zhu, S., 15 kesäkuuta 2016, julkaisussa : Bioinformatics. 32, 12, s. i70-i79 10 Sivumäärä

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkeli

  37. Julkaistu

    DrugE-Rank: Improving drug-target interaction prediction of new candidate drugs or targets by ensemble learning to rank

    Yuan, Q., Gao, J., Wu, D., Zhang, S., Mamitsuka, H. & Zhu, S., 15 kesäkuuta 2016, julkaisussa : Bioinformatics. 32, 12, s. i18-i27 10 Sivumäärä

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkeli

  38. Julkaistu

    New Resistance Distances with Global Information on Large Graphs

    Nguyen, C. H. & Mamitsuka, H., toukokuuta 2016, Proceedings of the 19th International Conference on Artificial Intelligence and Statistics. Gretton, A. & Robert, C. C. (toim.). s. 639-647 (JMLR: Workshop and Conference Proceedings; painos 51).

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussavertaisarvioitu

ID: 74804