Harri Lähdesmäki

  • Aalto SCI Computer Science Konemiehentie 2

20082020

Tutkimustuotoksia vuodessa

Jos olet muokannut tietoja Puressa, ne näkyvät pian tässä.

Tutkimustuotos

2020

A personalised approach for identifying disease-relevant pathways in heterogeneous diseases

Somani, J., Ramchandran, S. & Lähdesmäki, H., 1 joulukuuta 2020, julkaisussa : npj Systems Biology and Applications. 6, 1, 17.

Tutkimustuotos: LehtiartikkeliArticleScientificvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
6 Lataukset (Pure)

Enhancer prediction in the human genome by probabilistic modelling of the chromatin feature patterns

Osmala, M. & Lähdesmäki, H., 20 heinäkuuta 2020, julkaisussa : BMC Bioinformatics. 21, 1, 37 Sivumäärä

Tutkimustuotos: LehtiartikkeliArticleScientificvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
51 Lataukset (Pure)
2019

A Mathematical Model for Enhancer Activation Kinetics During Cell Differentiation

Nousiainen, K., Intosalmi, J. & Lähdesmäki, H., 1 tammikuuta 2019, Algorithms for Computational Biology - 6th International Conference, AlCoB 2019, Proceedings. Vega-Rodríguez, M. A., Holmes, I. & Martín-Vide, C. (toim.). s. 191-202 12 Sivumäärä (Lecture Notes in Computer Science (including subseries Lecture Notes in Artificial Intelligence and Lecture Notes in Bioinformatics); Vuosikerta 11488 LNBI).

Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussaConference contributionScientificvertaisarvioitu

An additive Gaussian process regression model for interpretable non-parametric analysis of longitudinal data

Cheng, L., Ramchandran, S., Vatanen, T., Lietzén, N., Lahesmaa, R., Vehtari, A. & Lähdesmäki, H., 17 huhtikuuta 2019, julkaisussa : Nature Communications. 10, 1, s. 1-11 11 Sivumäärä, 1798.

Tutkimustuotos: LehtiartikkeliArticleScientificvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
4 Sitaatiot (Scopus)
146 Lataukset (Pure)

Bayesian metabolic flux analysis reveals intracellular flux couplings

Heinonen, M., Osmala, M., Mannerström, H., Wallenius, J., Kaski, S., Rousu, J. & Lähdesmäki, H., 15 heinäkuuta 2019, julkaisussa : Bioinformatics. 35, 14, s. i548-i557 btz315.

Tutkimustuotos: LehtiartikkeliArticleScientificvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
1 Sitaatiot (Scopus)
90 Lataukset (Pure)

Data-driven multiscale modeling reveals the role of metabolic coupling for the spatio-temporal growth dynamics of yeast colonies

Intosalmi, J., Scott, A. C., Hays, M., Flann, N., Yli-Harja, O., Lähdesmäki, H., Dudley, A. M. & Skupin, A., 19 joulukuuta 2019, julkaisussa : BMC Molecular and Cell Biology. 20, 1, 59.

Tutkimustuotos: LehtiartikkeliArticleScientificvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
28 Lataukset (Pure)

Deep learning with differential Gaussian process flows

Hegde, P., Heinonen, M., Lähdesmäki, H. & Kaski, S., huhtikuuta 2019, The 22nd International Conference on Artificial Intelligence and Statistic. Vuosikerta 89. s. 1-15 16 Sivumäärä (Proceedings of Machine Learning Research; Vuosikerta 89).

Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussaConference contributionScientificvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
30 Lataukset (Pure)

Early detection of peripheral blood cell signature in children developing β-cell autoimmunity at a young age

Kallionpää, H., Somani, J., Tuomela, S., Ullah, U., De Albuquerque, R., Lönnberg, T., Komsi, E., Siljander, H., Honkanen, J., Härkönen, T., Peet, A., Tillmann, V., Chandra, V., Anagandula, M. K., Frisk, G., Otonkoski, T., Rasool, O., Lund, R., Lähdesmäki, H., Knip, M. & 1 muuta, Lahesmaa, R., 1 lokakuuta 2019, julkaisussa : DIABETES. 68, 10, s. 2024-2034 11 Sivumäärä

Tutkimustuotos: LehtiartikkeliArticleScientificvertaisarvioitu

3 Sitaatiot (Scopus)

Enhancer prediction in the human genome by probabilistic modeling of the chromatin feature patterns

Osmala, M. & Lähdesmäki, H., 17 lokakuuta 2019, (Jätetty) julkaisussa : Springer.

Tutkimustuotos: LehtiartikkeliArticleScientificvertaisarvioitu

Genomic variation and strain-specific functional adaptation in the human gut microbiome during early life

Vatanen, T., Plichta, D. R., Somani, J., Münch, P. C., Arthur, T. D., Hall, A. B., Rudolf, S., Oakeley, E. J., Ke, X., Young, R. A., Haiser, H. J., Kolde, R., Yassour, M., Luopajärvi, K., Siljander, H., Virtanen, S. M., Ilonen, J., Uibo, R., Tillmann, V., Mokurov, S. & 8 muuta, Dorshakova, N., Porter, J. A., McHardy, A. C., Lähdesmäki, H., Vlamakis, H., Huttenhower, C., Knip, M. & Xavier, R. J., 1 maaliskuuta 2019, julkaisussa : Nature Microbiology. 4, 3, s. 470-479

Tutkimustuotos: LehtiartikkeliArticleScientificvertaisarvioitu

24 Sitaatiot (Scopus)

ODE2VAE: Deep generative second order ODEs with Bayesian neural networks

Yildiz, C., Heinonen, M. & Lähdesmäki, H., 2019, 33rd Conference on Neural Information Processing Systems: NeurIPS 2019 . Neural Information Processing Systems Foundation, (Advances in Neural Information Processing Systems; Vuosikerta 32).

Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussaConference contributionScientificvertaisarvioitu

Open access

Peripheral blood DNA methylation differences in twin pairs discordant for Alzheimer's disease

Konki, M., Malonzo, M., Karlsson, I. K., Lindgren, N., Ghimire, B., Smolander, J., Scheinin, N. M., Ollikainen, M., Laiho, A., Elo, L. L., Lonnberg, T., Roytta, M., Pedersen, N. L., Kaprio, J., Lahdesmaki, H., Rinne, J. O. & Lund, R. J., 2 syyskuuta 2019, julkaisussa : Clinical epigenetics. 11, 1, 12 Sivumäärä, 130.

Tutkimustuotos: LehtiartikkeliArticleScientificvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
2 Sitaatiot (Scopus)
47 Lataukset (Pure)
2018

A Nonparametric Spatio-temporal SDE Model

Yildiz, C., Heinonen, M. & Lähdesmäki, H., 2018, NIPS 2018 Spatiotemporal Workshop: 32nd Conference on Neural Information Processing Systems (NIPS 2018), Montréal, Canada. Neural Information Processing Systems Foundation, s. 1-5

Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussaConference contributionProfessional

Atopic asthma after rhinovirus-induced wheezing is associated with DNA methylation change in the SMAD3 gene promoter

Lund, R. J., Osmala, M., Malonzo, M., Lukkarinen, M., Leino, A., Salmi, J., Vuorikoski, S., Turunen, R., Vuorinen, T., Akdis, C., Lähdesmäki, H., Lahesmaa, R. & Jartti, T., 5 toukokuuta 2018, julkaisussa : Allergy. 73, 8, s. 1735-1740 6 Sivumäärä

Tutkimustuotos: LehtiartikkeliArticleScientificvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
16 Sitaatiot (Scopus)
136 Lataukset (Pure)

Characterization and non-parametric modeling of the developing serum proteome during infancy and early childhood

Lietzén, N., Cheng, L., Moulder, R., Siljander, H., Laajala, E., Härkönen, T., Peet, A., Vehtari, A., Tillmann, V., Knip, M., Lähdesmäki, H. & Lahesmaa, R., 1 joulukuuta 2018, julkaisussa : Scientific Reports. 8, 1, s. 1-13 5883.

Tutkimustuotos: LehtiartikkeliArticleScientificvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
3 Sitaatiot (Scopus)
150 Lataukset (Pure)

Generative models for quantification of DNA modifications

Äijö, T., Bonneau, R. & Lähdesmäki, H., 1 tammikuuta 2018, Methods in Molecular Biology. s. 37-50 14 Sivumäärä (Methods in Molecular Biology; Vuosikerta 1807).

Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussaChapterScientificvertaisarvioitu

1 Sitaatiot (Scopus)

Learning Stochastic Differential Equations With Gaussian Processes Without Gradient Matching

Yildiz, C., Heinonen, M., Intosalmi, J., Mannerström, H. & Lähdesmäki, H., 2018, IEEE International Workshop on Machine Learning for Signal Processing. IEEE, 6 Sivumäärä 8516991

Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussaConference contributionScientificvertaisarvioitu

3 Sitaatiot (Scopus)

Learning unknown ODE models with Gaussian processes

Heinonen, M., Yildiz, C., Mannerström, H., Intosalmi, J. & Lähdesmäki, H., 2018, Proceedings of the 35th International Conference on Machine Learning, ICML 2018. Vuosikerta 5. s. 3120-3132 13 Sivumäärä (Proceedings of Machine Learning Research; Vuosikerta 80).

Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussaConference contributionScientificvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
1 Sitaatiot (Scopus)
23 Lataukset (Pure)

MGPfusion: Predicting protein stability changes with Gaussian process kernel learning and data fusion

Jokinen, E., Heinonen, M. & Lähdesmäki, H., 1 heinäkuuta 2018, julkaisussa : Bioinformatics. 34, 13, s. i274-i283

Tutkimustuotos: LehtiartikkeliArticleScientificvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
7 Sitaatiot (Scopus)
75 Lataukset (Pure)

Quantitative proteomic characterization and comparison of T helper 17 and induced regulatory T cells

Mohammad, I., Nousiainen, K., Bhosale, S. D., Starskaia, I., Moulder, R., Rokka, A., Cheng, F., Mohanasundaram, P., Eriksson, J. E., Goodlett, D. R., Lähdesmäki, H. & Chen, Z., 31 toukokuuta 2018, julkaisussa : PLoS Biology. 16, 5, e2004194.

Tutkimustuotos: LehtiartikkeliArticleScientificvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
3 Sitaatiot (Scopus)
135 Lataukset (Pure)

snpEnrichR: analyzing co-localization of SNPs and their proxies in genomic regions

Nousiainen, K., Kanduri, K., Ricaño-Ponce, I., Wijmenga, C., Lahesmaa, R., Kumar, V. & Lähdesmäki, H., 1 joulukuuta 2018, julkaisussa : Bioinformatics (Oxford, England). 34, 23, s. 4112-4114 3 Sivumäärä

Tutkimustuotos: LehtiartikkeliArticleScientificvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
88 Lataukset (Pure)

The human gut microbiome in early-onset type 1 diabetes from the TEDDY study

Vatanen, T., Franzosa, E. A., Schwager, R., Tripathi, S., Arthur, T. D., Vehik, K., Lernmark, Å., Hagopian, W. A., Rewers, M. J., She, J. X., Toppari, J., Ziegler, A. G., Akolkar, B., Krischer, J. P., Stewart, C. J., Ajami, N. J., Petrosino, J. F., Gevers, D., Lähdesmäki, H., Vlamakis, H. & 2 muuta, Huttenhower, C. & Xavier, R. J., 25 lokakuuta 2018, julkaisussa : Nature. 562, 7728, s. 589-594 6 Sivumäärä

Tutkimustuotos: LehtiartikkeliLetterScientificvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
126 Sitaatiot (Scopus)
424 Lataukset (Pure)

Time-resolved transcriptome and proteome landscape of human regulatory T cell (Treg) differentiation reveals novel regulators of FOXP3

Schmidt, A., Marabita, F., Kiani, N. A., Gross, C. C., Johansson, H. J., Éliás, S., Rautio, S., Eriksson, M., Fernandes, S. J., Silberberg, G., Ullah, U., Bhatia, U., Lähdesmäki, H., Lehtiö, J., Gomez-Cabrero, D., Wiendl, H., Lahesmaa, R. & Tegnér, J., 7 toukokuuta 2018, julkaisussa : BMC Biology. 16, 1, s. 1-35 47.

Tutkimustuotos: LehtiartikkeliArticleScientificvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
6 Sitaatiot (Scopus)
177 Lataukset (Pure)

Transcriptional Repressor HIC1 Contributes to Suppressive Function of Human Induced Regulatory T Cells

Ubaid Ullah, U., Andrabi, S. B. A., Tripathi, S. K., Dirasantha, O., Kanduri, K., Rautio, S., Gross, C. C., Lehtimäki, S., Bala, K., Tuomisto, J., Bhatia, U., Chakroborty, D., Elo, L. L., Lähdesmäki, H., Wiendl, H., Rasool, O. & Lahesmaa, R., 20 helmikuuta 2018, julkaisussa : Cell Reports. 22, 8, s. 2094-2106 13 Sivumäärä

Tutkimustuotos: LehtiartikkeliArticleScientificvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
12 Sitaatiot (Scopus)
137 Lataukset (Pure)
2017

Acquired Somatic Mutations in T Cells in Patients with Aplastic Anemia and Hypoplastic Myelodysplastic Syndromes

Lundgren, S., Keränen, M., Nousiainen, K., Eldfors, S., Hannula, S., Hannunen, T., Ellonen, P., Walldin, G., Clemente, M., Ebeling, F., Rajala, H., Maciejewski, J. P., Lähdesmäki, H., Hellstrom-Lindberg, E. & Mustjoki, S., 2017, julkaisussa : BLOOD. 130, Suppl 1, s. 1169-1169 1 Sivumäärä

Tutkimustuotos: LehtiartikkeliArticleScientificvertaisarvioitu

Efficient statistical methods for detecting differential methylation

Halla-aho, V. & Lähdesmäki, H., 22 heinäkuuta 2017.

Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussaKonferenssiesitysScientific

Tiedosto
19 Lataukset (Pure)

Genome-wide Analysis of STAT3-Mediated Transcription during Early Human Th17 Cell Differentiation

Tripathi, S. K., Chen, Z., Larjo, A., Kanduri, K., Nousiainen, K., Äijo, T., Ricaño-Ponce, I., Hrdlickova, B., Tuomela, S., Laajala, E., Salo, V., Kumar, V., Wijmenga, C., Lähdesmäki, H. & Lahesmaa, R., 30 toukokuuta 2017, julkaisussa : Cell Reports. 19, 9, s. 1888-1901 14 Sivumäärä

Tutkimustuotos: LehtiartikkeliArticleScientificvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
21 Sitaatiot (Scopus)
154 Lataukset (Pure)

RNA Polymerase III Subunit POLR3G Regulates Specific Subsets of PolyA+ and SmallRNA Transcriptomes and Splicing in Human Pluripotent Stem Cells

Lund, R. J., Rahkonen, N., Malonzo, M., Kauko, L., Emani, M. R., Kivinen, V., Närvä, E., Kemppainen, E., Laiho, A., Skottman, H., Hovatta, O., Rasool, O., Nykter, M., Lähdesmäki, H. & Lahesmaa, R., 9 toukokuuta 2017, julkaisussa : Stem Cell Reports. 8, 5, s. 1442-1454 13 Sivumäärä

Tutkimustuotos: LehtiartikkeliArticleScientificvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
2 Sitaatiot (Scopus)
103 Lataukset (Pure)

TET2 and 3 proteins control iNKT cell lineage specification and TCR mediated expansion

Tsagaratou, A., Avalos, E. G., Rautio, S., Browne, J. S., Togher, S., Pastor, W., Rothenberg, E. V., Lahdesmaki, H. & Rao, A., 2017, julkaisussa : JOURNAL OF IMMUNOLOGY. 198, 1, Supplement, s. 215.11

Tutkimustuotos: LehtiartikkeliArticleScientificvertaisarvioitu

TET proteins regulate the lineage specification and TCR-mediated expansion of iNKT cells

Tsagaratou, A., González-Avalos, E., Rautio, S., Scott-Browne, J. P., Togher, S., Pastor, W. A., Rothenberg, E. V., Chavez, L., Lähdesmäki, H. & Rao, A., 2017, julkaisussa : NATURE IMMUNOLOGY. 18, 1, s. 45-53

Tutkimustuotos: LehtiartikkeliArticleScientificvertaisarvioitu

46 Sitaatiot (Scopus)
2016

A probabilistic generative model for quantification of DNA modifications enables analysis of demethylation pathways

Äijö, T., Huang, Y., Mannerström, H., Chavez, L., Tsagaratou, A., Rao, A. & Lähdesmäki, H., 14 maaliskuuta 2016, julkaisussa : GENOME BIOLOGY. 17, 1, s. 1-22 49.

Tutkimustuotos: LehtiartikkeliArticleScientificvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
11 Sitaatiot (Scopus)
177 Lataukset (Pure)

A subpopulation model to analyze heterogeneous cell differentiation dynamics

Chan, Y. H., Intosalmi, J., Rautio, S. & Lähdesmäki, H., 1 marraskuuta 2016, julkaisussa : Bioinformatics. 32, 21, s. 3306-3313 8 Sivumäärä

Tutkimustuotos: LehtiartikkeliArticleScientificvertaisarvioitu

2 Sitaatiot (Scopus)

Comparative analysis of human and mouse transcriptomes of Th17 cell priming

Tuomela, S., Rautio, S., Ahlfors, H., Oling, V., Salo, V., Ullah, U., Chen, Z., Hämälistö, S., Tripathi, S., Äijö, T., Rasool, O., Soueidan, H., Wessels, L., Stockinger, B., Lähdesmäki, H. & Lahesmaa, R., toukokuuta 2016, julkaisussa : SCANDINAVIAN JOURNAL OF IMMUNOLOGY. 83, 5, s. 380-380 1 Sivumäärä

Tutkimustuotos: LehtiartikkeliKokousabstraktiScientific

Comparative analysis of human and mouse transcriptomes of Th17 cell priming

Tuomela, S., Rautio, S., Ahlfors, H., Öling, V., Salo, V., Ullah, U., Chen, Z., Hämälistö, S., Tripathi, S. K., Äijö, T., Rasool, O., Soueidan, H., Wessels, L., Stockinger, B., Lähdesmäki, H. & Lahesmaa, R., 22 maaliskuuta 2016, julkaisussa : ONCOTARGET. 7, 12, s. 13416-13428 13 Sivumäärä

Tutkimustuotos: LehtiartikkeliArticleScientificvertaisarvioitu

13 Sitaatiot (Scopus)

Control of Foxp3 stability through modulation of TET activity

Yue, X., Trifari, S., Äijö, T., Tsagaratou, A., Pastor, W. A., Zepeda-Martínez, J. A., Lio, C. W. J., Li, X., Huang, Y., Vijayanand, P., Lähdesmäki, H. & Rao, A., 2016, julkaisussa : JOURNAL OF EXPERIMENTAL MEDICINE. 213, 3, s. 377-397 21 Sivumäärä

Tutkimustuotos: LehtiartikkeliArticleScientificvertaisarvioitu

124 Sitaatiot (Scopus)

Data-driven mechanistic analysis method to reveal dynamically evolving regulatory networks

Intosalmi, J., Nousiainen, K., Ahlfors, H. & Lähdesmäki, H., 15 kesäkuuta 2016, julkaisussa : Bioinformatics. 32, 12, s. 288-296

Tutkimustuotos: LehtiartikkeliArticleScientificvertaisarvioitu

4 Sitaatiot (Scopus)

Enterovirus-associated changes in plasma proteome of children with genetic susceptibility to type 1 diabetes

Lietzen, N., Cheng, L., Oikarinen, S., Goo, Y. A., Goodlett, D., Toppari, J., Ilonen, J., Veijola, R., Knip, M., Lähdesmäki, H., Hyöty, H. & Lahesmaa, R., toukokuuta 2016, julkaisussa : SCANDINAVIAN JOURNAL OF IMMUNOLOGY. 83, 5, s. 381-381 1 Sivumäärä

Tutkimustuotos: LehtiartikkeliKokousabstraktiScientificvertaisarvioitu

Epigenetic Silencing of the Key Antioxidant Enzyme Catalase in Karyotypically Abnormal Human Pluripotent Stem Cells

Konki, M., Pasumarthy, K., Malonzo, M., Sainio, A., Valensisi, C., Söderström, M., Emani, M. R., Stubb, A., Närvä, E., Ghimire, B., Laiho, A., Järveläinen, H., Lahesmaa, R., Lähdesmäki, H., Hawkins, R. D. & Lund, R. J., 25 helmikuuta 2016, julkaisussa : Scientific Reports. 6, 22190.

Tutkimustuotos: LehtiartikkeliArticleScientificvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
12 Sitaatiot (Scopus)
125 Lataukset (Pure)

Generating data to improve protein stability prediction

Heinonen, M., Jokinen, E., Kaski, S., Rousu, J. & Lähdesmäki, H., 2016, Patenttinumero Provisional US 62/361511

Tutkimustuotos: PatenttiPatent

Identification of global regulators of T-helper cell lineage specification

Kanduri, K., Tripathi, S., Larjo, A., Mannerström, H., Ullah, U., Lund, R., Hawkins, R. D., Ren, B., Lähdesmäki, H. & Lahesmaa, R., toukokuuta 2016, julkaisussa : SCANDINAVIAN JOURNAL OF IMMUNOLOGY. 83, 5, s. 379-379 1 Sivumäärä

Tutkimustuotos: LehtiartikkeliKokousabstraktiScientificvertaisarvioitu

LuxGLM: A probabilistic covariate model for quantification of DNA methylation modifications with complex experimental designs

Äijö, T., Yue, X., Rao, A. & Lähdesmäki, H., 1 syyskuuta 2016, julkaisussa : Bioinformatics. 32, 17, s. i511-i519

Tutkimustuotos: LehtiartikkeliArticleScientificvertaisarvioitu

6 Sitaatiot (Scopus)

Mature Let-7 miRNAs fine tune expression of LIN28B in pluripotent human embryonic stem cells

Rahkonen, N., Stubb, A., Malonzo, M., Edelman, S., Emani, M. R., Närvä, E., Lähdesmäki, H., Ruohola-Baker, H., Lahesmaa, R. & Lund, R., 1 marraskuuta 2016, julkaisussa : STEM CELL RESEARCH. 17, 3, s. 498-503 6 Sivumäärä

Tutkimustuotos: LehtiartikkeliArticleScientificvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
9 Sitaatiot (Scopus)
330 Lataukset (Pure)

Non-Stationary Gaussian Process Regression with Hamiltonian Monte Carlo

Heinonen, M., Mannerström, H., Rousu, J., Kaski, S. & Lähdesmäki, H., 2016, Proceedings of the 19th International Conference on Artificial Intelligence and Statistics: JMLR: W&CP. JMLR, s. 732-740 9 Sivumäärä ( JMLR: Workshop and Conference Proceedings; Vuosikerta 51).

Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussaConference contributionScientificvertaisarvioitu

Selected proceedings of Machine Learning in Systems Biology: MLSB 2016

van Dijk, A. D. J., Lähdesmäki, H., de Ridder, D. & Rousu, J., 13 joulukuuta 2016, julkaisussa : BMC Bioinformatics. 17, Supplement 16, 2 Sivumäärä

Tutkimustuotos: LehtiartikkeliEditorialScientific

Open access
Tiedosto
3 Sitaatiot (Scopus)
55 Lataukset (Pure)

Selected proceedings of Machine Learning in Systems Biology: MLSB 2016

van Dijk, A. D. J., Lähdesmäki, H., de Ridder, D. & Rousu, J., joulukuuta 2016, julkaisussa : BMC Bioinformatics. 17

Tutkimustuotos: LehtiartikkeliSpecial issueScientificvertaisarvioitu

Synthetic transcription amplifier system for orthogonal control of gene expression in saccharomyces cerevisiae

Rantasalo, A., Czeizler, E., Virtanen, R., Rousu, J., Lähdesmäki, H., Penttilä, M., Jäntti, J. & Mojzita, D., 1 helmikuuta 2016, julkaisussa : PloS one. 11, 2, s. 1-19 e0148320.

Tutkimustuotos: LehtiartikkeliArticleScientificvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
16 Sitaatiot (Scopus)
234 Lataukset (Pure)

The landscape of copy number variations in Finnish families with autism spectrum disorders

Kanduri, C., Kantojärvi, K., Salo, P. M., Vanhala, R., Buck, G., Blancher, C., Lähdesmäki, H. & Järvelä, I., 1 tammikuuta 2016, julkaisussa : AUTISM RESEARCH. 9, 1, s. 9-16 8 Sivumäärä

Tutkimustuotos: LehtiartikkeliArticleScientificvertaisarvioitu

17 Sitaatiot (Scopus)

Variation in Microbiome LPS Immunogenicity Contributes to Autoimmunity in Humans

Vatanen, T., Kostic, A. D., D'Hennezel, E., Siljander, H., Franzosa, E. A., Yassour, M., Kolde, R., Vlamakis, H., Arthur, T. D., Hämäläinen, A. M., Peet, A., Tillmann, V., Uibo, R., Mokurov, S., Dorshakova, N., Ilonen, J., Virtanen, S. M., Szabo, S. J., Porter, J. A., Lähdesmäki, H. & 5 muuta, Huttenhower, C., Gevers, D., Cullen, T. W., Knip, M. & Xavier, R. J., 5 toukokuuta 2016, julkaisussa : CELL. 165, 4, s. 842-853 12 Sivumäärä

Tutkimustuotos: LehtiartikkeliArticleScientificvertaisarvioitu

389 Sitaatiot (Scopus)
2015

Analyzing Th17 cell differentiation dynamics using a novel integrative modeling framework for time-course RNA sequencing data

Intosalmi, J., Ahlfors, H., Rautio, S., Mannerström, H., Chen, Z., Lahesmaa, R., Stockinger, B. & Lähdesmäki, H., 2015, julkaisussa : BMC SYSTEMS BIOLOGY. 9, 81, 12 Sivumäärä

Tutkimustuotos: LehtiartikkeliArticleScientificvertaisarvioitu

5 Sitaatiot (Scopus)