Tutkimustuotoksia vuodessa
Tutkimustuotoksia vuodessa
Henkilökohtainen profiili
Keywords
- Bioinformatics
- Computational systems biology
- Machine learning
- Probabilistic modelling
- Data mining
Sormenjälki
Sukella tutkimusaiheisiin, joissa Harri Lähdesmäki on aktiivinen. Nämä aihemerkinnät ovat peräisin tämän henkilön teoksista. Yhdessä ne muodostavat ainutlaatuisen sormenjäljen.
- 6 Samanlaiset profiilit
Verkko
Viimeisin maatasolla toteutettu yhteistyö. Saat syvempiä lisätietoja pisteitä napsauttamalla.
Tutkimustuotos
-
Congruent microbiome signatures in fibrosis-prone autoimmune diseases: IgG4-related disease and systemic sclerosis
Plichta, D. R., Somani, J., Pichaud, M., Wallace, Z. S., Fernandes, A. D., Perugino, C. A., Lähdesmäki, H., Stone, J. H., Vlamakis, H., Chung, D. C., Khanna, D., Pillai, S. & Xavier, R. J., joulukuuta 2021, julkaisussa: GENOME MEDICINE. 13, 1, 14 Sivumäärä, 35.Tutkimustuotos: Lehtiartikkeli › Article › Scientific › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto -
lgpr: an interpretable non-parametric method for inferring covariate effects from longitudinal data
Timonen, J., Mannerström, H., Vehtari, A. & Lähdesmäki, H., 21 tammikuuta 2021, julkaisussa: Bioinformatics.Tutkimustuotos: Lehtiartikkeli › Article › Scientific › vertaisarvioitu
Open access -
Predicting recognition between T cell receptors and epitopes with TCRGP
Jokinen, E., Huuhtanen, J., Mustjoki, S., Heinonen, M. & Lähdesmäki, H., 1 maaliskuuta 2021, julkaisussa: PLoS computational biology. 17, 3, s. 1-27 27 Sivumäärä, e1008814.Tutkimustuotos: Lehtiartikkeli › Article › Scientific › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto -
Somatic mutations in lymphocytes in patients with immune-mediated aplastic anemia
Lundgren, S., Keränen, M. A. I., Kankainen, M., Huuhtanen, J., Walldin, G., Kerr, C. M., Clemente, M., Ebeling, F., Rajala, H., Brück, O., Lähdesmäki, H., Hannula, S., Hannunen, T., Ellonen, P., Young, N. S., Ogawa, S., Maciejewski, J. P., Hellström-Lindberg, E. & Mustjoki, S., 2021, julkaisussa: Leukemia.Tutkimustuotos: Lehtiartikkeli › Article › Scientific › vertaisarvioitu
Open access -
Adult-Onset Anti-Citrullinated Peptide Antibody-Negative Destructive Rheumatoid Arthritis Is Characterized by a Disease-Specific CD8+ T Lymphocyte Signature
Kelkka, T., Savola, P., Bhattacharya, D., Huuhtanen, J., Lönnberg, T., Kankainen, M., Paalanen, K., Tyster, M., Lepistö, M., Ellonen, P., Smolander, J., Eldfors, S., Yadav, B., Khan, S., Koivuniemi, R., Sjöwall, C., Elo, L. L., Lähdesmäki, H., Maeda, Y., Nishikawa, H. & 3 muuta, , 19 marraskuuta 2020, julkaisussa: FRONTIERS IN IMMUNOLOGY. 11, 12 Sivumäärä, 578848.Tutkimustuotos: Lehtiartikkeli › Article › Scientific › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto
Projektit
-
Immuunivasteen säätely ja hoidon kohdennus reumataudeissa
01/01/2021 → 31/12/2022
Projekti: Academy of Finland: Other research funding
-
Todellisuuskuilun ylitys autonomisessa oppimisessa
Lähdesmäki, H. & Iakovlev, V.
01/01/2020 → 31/12/2022
Projekti: Academy of Finland: Other research funding
-
FCAI: Suomen tekoälykeskus
01/01/2019 → 31/12/2022
Projekti: Academy of Finland: Other research funding
-
Molekyylimekanismien analysointi yhden solun tasolla
Lähdesmäki, H., Intosalmi, J., Somani, J., Gadd, C., Lankinen, A., Osmala, M., Iakovlev, V., Dumitrescu, A. & Laajala, E.
01/09/2017 → 31/08/2021
Projekti: Academy of Finland: Other research funding
-
FGCI: Suomen Hila- ja Pilvilaskenta Vaihe 2: datatieteen mahdollistaminen
01/01/2018 → 31/12/2019
Projekti: Academy of Finland: Other research funding
Tietoaineistot
-
A probabilistic generative model for quantification of DNA modifications enables analysis of demethylation pathways
Äijö, T. (Contributor), Huang, Y. (Contributor), Mannerström, H. (Contributor), Chavez, L. (Contributor), Tsagaratou, A. (Contributor), Rao, A. (Contributor) & Lähdesmäki, H. (Contributor), 1 tammikuuta 2016
DOI - pysyväislinkki: 10.6084/m9.figshare.c.3604346.v1, https://figshare.com/collections/A_probabilistic_generative_model_for_quantification_of_DNA_modifications_enables_analysis_of_demethylation_pathways/3604346/1
Tietoaineisto: Dataset
-
Identification of global regulators of T-helper cell lineage specification
Kanduri, K. (Contributor), Tripathi, S. (Contributor), Larjo, A. (Contributor), Mannerström, H. (Contributor), Ullah, U. (Contributor), Lund, R. (Contributor), Hawkins, D. (Contributor), Ren, B. (Contributor), Lähdesmäki, H. (Contributor) & Lahesmaa, R. (Contributor), 1 tammikuuta 2015
DOI - pysyväislinkki: 10.6084/m9.figshare.c.3642353.v1, https://figshare.com/collections/Identification_of_global_regulators_of_T-helper_cell_lineage_specification/3642353/1
Tietoaineisto: Dataset
-
Analyzing Th17 cell differentiation dynamics using a novel integrative modeling framework for time-course RNA sequencing data
Intosalmi, J. (Contributor), Ahlfors, H. (Contributor), Rautio, S. (Contributor), Mannerström, H. (Creator), Chen, Z. (Contributor), Lahesmaa, R. (Contributor), Stockinger, B. (Contributor) & Lähdesmäki, H. (Contributor), 1 tammikuuta 2015
DOI - pysyväislinkki: 10.6084/m9.figshare.c.3612158.v1, https://figshare.com/collections/Analyzing_Th17_cell_differentiation_dynamics_using_a_novel_integrative_modeling_framework_for_time-course_RNA_sequencing_data/3612158/1
Tietoaineisto: Dataset
Palkinnot
-
Elias Tillandz prize 2012 for article
Lähdesmäki, Harri (Recipient), 2012
Palkinto: Palkinto tai huomionosoitus tuotoksesta
-
Elias Tillandz prize 2013 for article
Lähdesmäki, Harri (Recipient), 2013
Palkinto: Palkinto tai huomionosoitus tuotoksesta
-
IARIA Best Paper Award for our paper
Lähdesmäki, Harri (Recipient), 2008
Palkinto: Palkinto tai huomionosoitus tuotoksesta
-
Tampere Science Foundation award for the best doctoral thesis
Lähdesmäki, Harri (Recipient), 2005
Palkinto: Palkinto tai huomionosoitus tuotoksesta
-
The Þrst position in the 5th Dialogue for Reverse Engineering Assessments and Methods (DREAM), Transcription-Factor/DNA-Motif Recognition Challenge, 2010, presented in New York, NY, USA, November 16, 2010 The DREAM Project - Dream initiative, USA
Lähdesmäki, Harri (Recipient), 16 marraskuuta 2010
Palkinto: Palkinto tai huomionosoitus tuotoksesta
Aktiviteetit
-
Faster Bayesian inference in Joint Species Distribution Models
Gleb Tikhonov (Puhuja), Jarno Vanhatalo (Kontribuuttori), Otso Ovaskainen (Kontribuuttori) & Harri Lähdesmäki (Kontribuuttori)
22 kesäkuuta 2020 → 26 kesäkuuta 2020Aktiviteetti: Konferenssiesitelmä
-
INTERNATIONAL WORKSHOP ON MACHINE LEARNING IN SYSTEMS BIOLOGY
Harri Lähdesmäki (Member)
3 syyskuuta 2016 → 4 syyskuuta 2016Aktiviteetti: Konferenssin tai seminaarin järjestelytoimikunnan jäsenyys
-
Foreign Organisation
Harri Lähdesmäki (Visiting researcher)
30 maaliskuuta 2016 → 3 huhtikuuta 2016Aktiviteetti: Vierailu ulkomaille
-
Foreign Organisation
Harri Lähdesmäki (Visiting researcher)
17 toukokuuta 2016Aktiviteetti: Vierailu ulkomaille
-
Perustieteiden korkeakoulu (Yksikkö)
Harri Lähdesmäki (Jäsen)
maaliskuuta 2016 → tammikuuta 2017Aktiviteetti: Nimitetty asiantuntija- tai luottamustehtävä akateemisessa yhteisössä
Lehtileikkeet
-
Suomalaistutkijoiden kehittämä tekoäly ennustaa, mikä puolustusjärjestelmän avain sopii koronaviruksen lukkoihin
Emmi Jokinen & Harri Lähdesmäki
22/04/2021
1 kohde/ Medianäkyvyys
Lehdistö/media: Esiintyminen mediassa
-
Suomalaistutkijat kehittivät tekoälyn auttamaan koronataistelussa – ”Malli on sovellettavissa periaatteessa kaikkia kohtaamiamme taudinaiheuttajia vastaan”
Emmi Jokinen & Harri Lähdesmäki
22/04/2021
1 kohde/ Medianäkyvyys
Lehdistö/media: Esiintyminen mediassa
-
Biologisten mekanismien alkulähteillä
16/05/2019
1 kohde/ Medianäkyvyys
Lehdistö/media: Esiintyminen mediassa