Tutkimustuotoksia vuodessa
Tutkimustuotoksia vuodessa
Henkilökohtainen profiili
Tutkimusalue
I work on computational biology and probabilistic machine learning with applications in biomedicine.
Asiantuntemus YK:n kestävän kehityksen tavoitteista
Vuonna 2015 YK:n jäsenvaltiot sopivat 17 maailmanlaajuisesta kestävän kehityksen tavoitteesta köyhyyden poistamiseksi, planeetan suojelemiseksi ja vaurauden takaamiseksi kaikille. Tämän henkilön työ edistää seuraavia kestävän kehityksen tavoitteita:
Keywords
- Bioinformatics
- Computational systems biology
- Machine learning
- Probabilistic modelling
- Data mining
Sormenjälki
Sukella tutkimusaiheisiin, joissa Harri Lähdesmäki on aktiivinen. Nämä aihemerkinnät ovat peräisin tämän henkilön teoksista. Yhdessä ne muodostavat ainutlaatuisen sormenjäljen.
- 1 Samanlaiset profiilit
Yhteistyöt ja huippututkimusalueet viimeisiltä viideltä vuodelta
Viimeisin maa-/aluetasolla toteutettu yhteistyö. Saat tarkempia lisätietoja pisteitä napauttamalla, tai
Tutkimustuotos
-
Single-cell analysis of aplastic anemia reveals a convergence of NK and NK-like CD8+ T cells with a disease-associated TCR signature
Lundgren, S., Huuhtanen, J., Keränen, M., Feng, X., Patel, B. A., Ryland, G. L., Fox, L. C., Bravo-Perez, C., Clemente, M., Kerr, C., Walldin, G., Dufva, O., Zaimoku, Y., Tuononen, T., Myllymäki, M., Ebeling, F., Jokinen, E., Heinonen, M., Kasanen, T. & Klievink, J. & 14 muuta, , 26 helmik. 2025, julkaisussa: SCIENCE TRANSLATIONAL MEDICINE. 17, 787, s. 1-17 17 Sivumäärä, eadl6758.Tutkimustuotos: Lehtiartikkeli › Article › Scientific › vertaisarvioitu
1 Lataukset (Pure) -
A comparative study of clinical trial and real-world data in patients with diabetic kidney disease
Kurki, S., Halla-aho, V., Haussmann, M., Lähdesmäki, H., Leinonen, J. V. & Koskinen, M., 19 tammik. 2024, julkaisussa: Scientific Reports. 14, 1, 1731.Tutkimustuotos: Lehtiartikkeli › Article › Scientific › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto7 Sitaatiot (Scopus)20 Lataukset (Pure) -
Estimating treatment effects from single-arm trials via latent-variable modeling
Haussmann, M., Le, T. M. S., Halla-aho, V., Kurki, S., Leinonen, J., Koskinen, M., Kaski, S. & Lähdesmäki, H., 2024, Proceedings of the 27th International Conference on Artificial Intelligence and Statistics . JMLR, Vuosikerta 238. s. 2926-2934 (Proceedings of Machine Learning Research; Vuosikerta 238).Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussa › Conference article in proceedings › Scientific › vertaisarvioitu
Open access -
Latent variable model for high-dimensional point process with structured missingness
Sinelnikov, M., Haussmann, M. & Lähdesmäki, H., 2024, julkaisussa: Proceedings of Machine Learning Research. 235, s. 45525-45543 19 SivumääräTutkimustuotos: Lehtiartikkeli › Conference article › Scientific › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto19 Lataukset (Pure) -
Learning conditional variational autoencoders with missing covariates
Ramchandran, S., Tikhonov, G., Lönnroth, O., Tiikkainen, P. & Lähdesmäki, H., maalisk. 2024, julkaisussa: Pattern Recognition. 147, 110113.Tutkimustuotos: Lehtiartikkeli › Article › Scientific › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto6 Sitaatiot (Scopus)113 Lataukset (Pure)
-
AI assisted Health Lähdesmäki: Trustworthy AI-assisted phenotyping, prediction and treatment design using large-scale health data
Lähdesmäki, H. (Vastuullinen tutkija)
01/01/2024 → 31/12/2026
Projekti: Academy of Finland: Other research funding
-
-: Suomen tekoälykeskus
Lähdesmäki, H. (Vastuullinen tutkija)
01/01/2023 → 31/12/2026
Projekti: Academy of Finland: Other research funding
-
Heal-Art jatko: Immunoregulation and Therapeutic Precision in Rheumatoid Arthritis
Lähdesmäki, H. (Vastuullinen tutkija)
01/01/2021 → 31/12/2022
Projekti: Academy of Finland: Other research funding
-
-: Todellisuuskuilun ylitys autonomisessa oppimisessa
Lähdesmäki, H. (Vastuullinen tutkija)
01/01/2020 → 31/12/2022
Projekti: Academy of Finland: Other research funding
-
FCAI: Suomen tekoälykeskus
Lähdesmäki, H. (Vastuullinen tutkija)
01/01/2019 → 31/12/2022
Projekti: Academy of Finland: Other research funding
Tietoaineistot
-
Analyzing Th17 cell differentiation dynamics using a novel integrative modeling framework for time-course RNA sequencing data
Intosalmi, J. (Contributor), Ahlfors, H. (Contributor), Rautio, S. (Contributor), Mannerström, H. (Creator), Chen, Z. (Contributor), Lahesmaa, R. (Contributor), Stockinger, B. (Contributor) & Lähdesmäki, H. (Contributor), figshare, 1 tammik. 2015
DOI - pysyväislinkki: 10.6084/m9.figshare.c.3612158.v1, https://figshare.com/collections/Analyzing_Th17_cell_differentiation_dynamics_using_a_novel_integrative_modeling_framework_for_time-course_RNA_sequencing_data/3612158/1
Tietoaineisto: Dataset
-
Identification of global regulators of T-helper cell lineage specification
Kanduri, K. (Creator), Tripathi, S. (Creator), Larjo, A. (Creator), Mannerström, H. (Creator), Ullah, U. (Creator), Lund, R. (Creator), Hawkins, D. (Creator), Ren, B. (Creator), Lähdesmäki, H. (Creator) & Lahesmaa, R. (Creator), figshare, 1 tammik. 2015
DOI - pysyväislinkki: 10.6084/m9.figshare.c.3642353.v1, https://figshare.com/collections/Identification_of_global_regulators_of_T-helper_cell_lineage_specification/3642353/1
Tietoaineisto: Dataset
-
Modeling binding specificities of transcription factor pairs with random forests
Antikainen, A. A. (Creator), Heinonen, M. (Creator) & Lähdesmäki, H. (Creator), figshare, 2022
DOI - pysyväislinkki: 10.6084/m9.figshare.c.6031779.v1, https://springernature.figshare.com/collections/Modeling_binding_specificities_of_transcription_factor_pairs_with_random_forests/6031779/1 ja vielä 2 linkkiä, https://doi.org/10.6084/m9.figshare.20003418.v1, https://doi.org/10.6084/m9.figshare.20003421.v1 (näytä vähemmän)
Tietoaineisto: Dataset
-
Additional file 2 of Modeling binding specificities of transcription factor pairs with random forests
Antikainen, A. A. (Creator), Heinonen, M. (Creator) & Lähdesmäki, H. (Creator), figshare, 6 kesäk. 2022
DOI - pysyväislinkki: 10.6084/m9.figshare.20003421, https://springernature.figshare.com/articles/dataset/Additional_file_2_of_Modeling_binding_specificities_of_transcription_factor_pairs_with_random_forests/20003421
Tietoaineisto: Dataset
-
Additional file 2 of LuxHMM: DNA methylation analysis with genome segmentation via hidden Markov model
Malonzo, M. H. (Creator) & Lähdesmäki, H. (Creator), figshare, 13 huhtik. 2023
DOI - pysyväislinkki: 10.6084/m9.figshare.22610645.v1, https://springernature.figshare.com/articles/dataset/Additional_file_2_of_LuxHMM_DNA_methylation_analysis_with_genome_segmentation_via_hidden_Markov_model/22610645/1
Tietoaineisto: Dataset
Palkinnot
-
Elias Tillandz prize 2012 for article
Lähdesmäki, H. (Recipient), 2012
Palkinto: Palkinto tai huomionosoitus tuotoksesta
-
Elias Tillandz prize 2013 for article
Lähdesmäki, H. (Recipient), 2013
Palkinto: Palkinto tai huomionosoitus tuotoksesta
-
IARIA Best Paper Award for our paper
Lähdesmäki, H. (Recipient), 2008
Palkinto: Palkinto tai huomionosoitus tuotoksesta
-
Tampere Science Foundation award for the best doctoral thesis
Lähdesmäki, H. (Recipient), 2005
Palkinto: Palkinto tai huomionosoitus tuotoksesta
-
The Þrst position in the 5th Dialogue for Reverse Engineering Assessments and Methods (DREAM), Transcription-Factor/DNA-Motif Recognition Challenge, 2010, presented in New York, NY, USA, November 16, 2010 The DREAM Project - Dream initiative, USA
Lähdesmäki, H. (Recipient), 16 marrask. 2010
Palkinto: Palkinto tai huomionosoitus tuotoksesta
Aktiviteetit
-
Faster Bayesian inference in Joint Species Distribution Models
Tikhonov, G. (Puhuja), Vanhatalo, J. (Kontribuuttori), Ovaskainen, O. (Kontribuuttori) & Lähdesmäki, H. (Kontribuuttori)
22 kesäk. 2020 → 26 kesäk. 2020Aktiviteetti: Konferenssiesitelmä
-
Foreign Organisation
Lähdesmäki, H. (Visiting researcher)
30 maalisk. 2016 → 3 huhtik. 2016Aktiviteetti: Vierailu ulkomaiseen yliopistoon
-
Foreign Organisation
Lähdesmäki, H. (Visiting researcher)
17 toukok. 2016Aktiviteetti: Vierailu ulkomaiseen yliopistoon
-
Evaluator of a docent application, at University of Helsinki
Lähdesmäki, H. (Tarkastaja)
2016Aktiviteetti: Dosentuurin hakijan arviointitehtävä
-
Foreign Organisation
Lähdesmäki, H. (Visiting researcher)
18 toukok. 2016Aktiviteetti: Vierailu ulkomaiseen yliopistoon
Lehtileikkeet
-
Research Findings from Aalto University Update Understanding of Machine Learning (EPIC-TRACE: predicting TCR binding to unseen epitopes using attention and contextualized embeddings)
27/12/2023
1 kohde/ Medianäkyvyys
Lehdistö/media: Esiintyminen mediassa
-
University of Turku and Abo Akademi University Researchers Target Type 1 Diabetes (Serum APOC1 levels are decreased in young autoantibody positive children who rapidly progress to type 1 diabetes)
10/10/2023
1 kohde/ Medianäkyvyys
Lehdistö/media: Esiintyminen mediassa
-
Research Data from University of Turku and Abo Akademi University Update Understanding of Data Analytics (Permutation-based significance analysis reduces the type 1 error rate in bisulphite sequencing data analysis of human umbilical cord blood ...)
05/10/2023
1 kohde/ Medianäkyvyys
Lehdistö/media: Esiintyminen mediassa
-
Aalto University: Scientists Unravel The Effects Of New Medication For Advanced Melanoma With The Help Of AI
03/03/2023
1 kohde/ Medianäkyvyys
Lehdistö/media: Esiintyminen mediassa
-
Scientists unravel the effects of new medication for advanced melanoma with the help of AI
02/03/2023
2 kohdetta/ Medianäkyvyys
Lehdistö/media: Esiintyminen mediassa