Tutkimustuotoksia vuodessa
Tutkimustuotoksia vuodessa
Henkilökohtainen profiili
Tutkimusalue
I work on computational biology and probabilistic machine learning with applications in biomedicine.
Asiantuntemus YK:n kestävän kehityksen tavoitteista
Vuonna 2015 YK:n jäsenvaltiot sopivat 17 maailmanlaajuisesta kestävän kehityksen tavoitteesta köyhyyden poistamiseksi, planeetan suojelemiseksi ja vaurauden takaamiseksi kaikille. Tämän henkilön työ edistää seuraavia kestävän kehityksen tavoitteita:
Keywords
- Bioinformatics
- Computational systems biology
- Machine learning
- Probabilistic modelling
- Data mining
Sormenjälki
Sukella tutkimusaiheisiin, joissa Harri Lähdesmäki on aktiivinen. Nämä aihemerkinnät ovat peräisin tämän henkilön teoksista. Yhdessä ne muodostavat ainutlaatuisen sormenjäljen.
- 1 Samanlaiset profiilit
Verkko
Viimeisin maa-/aluetasolla toteutettu yhteistyö. Saat tarkempia lisätietoja pisteitä napauttamalla, tai
-
Bayesian inference of ODEs with Gaussian processes
Hegde, P., Yıldız, Ç., Lähdesmäki, H., Kaski, S. & Heinonen, M., 2021, (Julkaisematon) julkaisussa: arXiv.Tutkimustuotos: Lehtiartikkeli › Article › Scientific
-
Congruent microbiome signatures in fibrosis-prone autoimmune diseases: IgG4-related disease and systemic sclerosis
Plichta, D. R., Somani, J., Pichaud, M., Wallace, Z. S., Fernandes, A. D., Perugino, C. A., Lähdesmäki, H., Stone, J. H., Vlamakis, H., Chung, D. C., Khanna, D., Pillai, S. & Xavier, R. J., joulukuuta 2021, julkaisussa: GENOME MEDICINE. 13, 1, 14 Sivumäärä, 35.Tutkimustuotos: Lehtiartikkeli › Article › Scientific › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto5 Sitaatiot (Scopus)22 Lataukset (Pure) -
Continuous-time Model-based Reinforcement Learning
Yildiz, C., Heinonen, M. & Lähdesmäki, H., 21 heinäkuuta 2021, Proceedings of the 38th International Conference on Machine Learning, ICML 2021. s. 12009-12018 (Proceedings of Machine Learning Research; Vuosikerta 139).Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussa › Conference contribution › Scientific › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto12 Lataukset (Pure) -
Latent Gaussian process with composite likelihoods and numerical quadrature
Ramchandran, S., Koskinen, M. & Lahdesmaki, H., 2021, 24TH INTERNATIONAL CONFERENCE ON ARTIFICIAL INTELLIGENCE AND STATISTICS (AISTATS). Banerjee, A. & Fukumizu, K. (toim.). MICROTOME PUBLISHING, 10 Sivumäärä (Proceedings of Machine Learning Research; Vuosikerta 130).Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussa › Conference contribution › Scientific › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto3 Lataukset (Pure) -
Learning continuous-time PDEs from sparse data with graph neural networks
Iakovlev, V., Heinonen, M. & Lähdesmäki, H., 2021, International Conference on Learning Representations. 15 SivumääräTutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussa › Conference contribution › Professional
Open access
-
Immuunivasteen säätely ja hoidon kohdennus reumataudeissa
Lähdesmäki, H., Jokinen, E., Halla-aho, V., Dumitrescu, A., Lankinen, A. & Osmala, M.
01/01/2021 → 31/12/2022
Projekti: Academy of Finland: Other research funding
-
Todellisuuskuilun ylitys autonomisessa oppimisessa
Lähdesmäki, H., Iakovlev, V. & Laajala, E.
01/01/2020 → 31/12/2022
Projekti: Academy of Finland: Other research funding
-
FCAI: Suomen tekoälykeskus
01/01/2019 → 31/12/2022
Projekti: Academy of Finland: Other research funding
-
Tensoripohjainen koneoppiminen biolääketieteessä
Lähdesmäki, H., Gadd, C., Iakovlev, V. & Tikhonov, G.
01/01/2018 → 31/12/2019
Projekti: Academy of Finland: Other research funding
-
Immuunivasteen säätely ja hoidon kohdennus reumataudeissa
Jokinen, E., Lähdesmäki, H., Osmala, M., Somani, J. & Dumitrescu, A.
01/01/2018 → 31/12/2020
Projekti: Academy of Finland: Other research funding
Tietoaineistot
-
A probabilistic generative model for quantification of DNA modifications enables analysis of demethylation pathways
Äijö, T. (Contributor), Huang, Y. (Contributor), Mannerström, H. (Contributor), Chavez, L. (Contributor), Tsagaratou, A. (Contributor), Rao, A. (Contributor) & Lähdesmäki, H. (Contributor), 1 tammikuuta 2016
DOI - pysyväislinkki: 10.6084/m9.figshare.c.3604346.v1, https://figshare.com/collections/A_probabilistic_generative_model_for_quantification_of_DNA_modifications_enables_analysis_of_demethylation_pathways/3604346/1
Tietoaineisto: Dataset
-
Identification of global regulators of T-helper cell lineage specification
Kanduri, K. (Contributor), Tripathi, S. (Contributor), Larjo, A. (Contributor), Mannerström, H. (Contributor), Ullah, U. (Contributor), Lund, R. (Contributor), Hawkins, D. (Contributor), Ren, B. (Contributor), Lähdesmäki, H. (Contributor) & Lahesmaa, R. (Contributor), 1 tammikuuta 2015
DOI - pysyväislinkki: 10.6084/m9.figshare.c.3642353.v1, https://figshare.com/collections/Identification_of_global_regulators_of_T-helper_cell_lineage_specification/3642353/1
Tietoaineisto: Dataset
-
Analyzing Th17 cell differentiation dynamics using a novel integrative modeling framework for time-course RNA sequencing data
Intosalmi, J. (Contributor), Ahlfors, H. (Contributor), Rautio, S. (Contributor), Mannerström, H. (Creator), Chen, Z. (Contributor), Lahesmaa, R. (Contributor), Stockinger, B. (Contributor) & Lähdesmäki, H. (Contributor), 1 tammikuuta 2015
DOI - pysyväislinkki: 10.6084/m9.figshare.c.3612158.v1, https://figshare.com/collections/Analyzing_Th17_cell_differentiation_dynamics_using_a_novel_integrative_modeling_framework_for_time-course_RNA_sequencing_data/3612158/1
Tietoaineisto: Dataset
Palkinnot
-
Elias Tillandz prize 2012 for article
Lähdesmäki, Harri (Recipient), 2012
Palkinto: Palkinto tai huomionosoitus tuotoksesta
-
Elias Tillandz prize 2013 for article
Lähdesmäki, Harri (Recipient), 2013
Palkinto: Palkinto tai huomionosoitus tuotoksesta
-
IARIA Best Paper Award for our paper
Lähdesmäki, Harri (Recipient), 2008
Palkinto: Palkinto tai huomionosoitus tuotoksesta
-
Tampere Science Foundation award for the best doctoral thesis
Lähdesmäki, Harri (Recipient), 2005
Palkinto: Palkinto tai huomionosoitus tuotoksesta
-
The Þrst position in the 5th Dialogue for Reverse Engineering Assessments and Methods (DREAM), Transcription-Factor/DNA-Motif Recognition Challenge, 2010, presented in New York, NY, USA, November 16, 2010 The DREAM Project - Dream initiative, USA
Lähdesmäki, Harri (Recipient), 16 marraskuuta 2010
Palkinto: Palkinto tai huomionosoitus tuotoksesta
Aktiviteetit
-
Faster Bayesian inference in Joint Species Distribution Models
Gleb Tikhonov (Puhuja), Jarno Vanhatalo (Kontribuuttori), Otso Ovaskainen (Kontribuuttori) & Harri Lähdesmäki (Kontribuuttori)
22 kesäkuuta 2020 → 26 kesäkuuta 2020Aktiviteetti: Konferenssiesitelmä
-
Perustieteiden korkeakoulu (Yksikkö)
Harri Lähdesmäki (Jäsen)
maaliskuuta 2016 → tammikuuta 2017Aktiviteetti: Nimitetty asiantuntija- tai luottamustehtävä akateemisessa yhteisössä
-
Foreign Organisation
Harri Lähdesmäki (Visiting researcher)
30 maaliskuuta 2016 → 3 huhtikuuta 2016Aktiviteetti: Vierailu ulkomaille
-
Evaluator of a docent application, at University of Helsinki
Harri Lähdesmäki (Examiner)
2016Aktiviteetti: Dosentuurin hakijan arviointitehtävä
-
INTERNATIONAL WORKSHOP ON MACHINE LEARNING IN SYSTEMS BIOLOGY
Harri Lähdesmäki (Member)
3 syyskuuta 2016 → 4 syyskuuta 2016Aktiviteetti: Konferenssin tai seminaarin järjestelytoimikunnan jäsenyys
Lehtileikkeet
-
Suomalaistutkijoiden kehittämä tekoäly ennustaa, mikä puolustusjärjestelmän avain sopii koronaviruksen lukkoihin
Emmi Jokinen & Harri Lähdesmäki
22/04/2021
1 kohde/ Medianäkyvyys
Lehdistö/media: Esiintyminen mediassa
-
Suomalaistutkijat kehittivät tekoälyn auttamaan koronataistelussa – ”Malli on sovellettavissa periaatteessa kaikkia kohtaamiamme taudinaiheuttajia vastaan”
Emmi Jokinen & Harri Lähdesmäki
22/04/2021
1 kohde/ Medianäkyvyys
Lehdistö/media: Esiintyminen mediassa
-
Biologisten mekanismien alkulähteillä
16/05/2019
1 kohde/ Medianäkyvyys
Lehdistö/media: Esiintyminen mediassa