Dogu Baran Aydogan

Tutkimustuotoksia vuodessa

Asiantuntemus YK:n kestävän kehityksen tavoitteista

Vuonna 2015 YK:n jäsenvaltiot sopivat 17 maailmanlaajuisesta kestävän kehityksen tavoitteesta köyhyyden poistamiseksi, planeetan suojelemiseksi ja vaurauden takaamiseksi kaikille. Tämän henkilön työ edistää seuraavia kestävän kehityksen tavoitteita:

Koulutus / tieteellinen pätevyys

Doctoral degree, Engineering and Technology, Tampere University of Technology

Myöntöpäivä: 13 elok. 2014

Sormenjälki

Sukella tutkimusaiheisiin, joissa Dogu Baran Aydogan on aktiivinen. Nämä aihemerkinnät ovat peräisin tämän henkilön teoksista. Yhdessä ne muodostavat ainutlaatuisen sormenjäljen.

1 Samanlaiset profiilit

25 Article
13 Conference article in proceedings
2 Konferenssiesitys
1 Doctoral Thesis

Real-Time Tractography-Assisted Neuronavigation for Transcranial Magnetic Stimulation
Aydogan, D. B., Souza, V. H., Matsuda, R. H., Lioumis, P. & Ilmoniemi, R. J., tammik. 2025, julkaisussa: Human Brain Mapping. 46, 1, e70122.
Tutkimustuotos: Lehtiartikkeli › Article › Scientific › vertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
6 Lataukset (Pure)
brainlife.io : a decentralized and open-source cloud platform to support neuroscience research
Hayashi, S., Caron, B. A., Heinsfeld, A. S., Vinci-Booher, S., McPherson, B., Bullock, D. N., Bertò, G., Niso, G., Hanekamp, S., Levitas, D., Ray, K., MacKenzie, A., Avesani, P., Kitchell, L., Leong, J. K., Nascimento-Silva, F., Koudoro, S., Willis, H., Jolly, J. K. & Pisner, D. & 44 muuta, Zuidema, T. R., Kurzawski, J. W., Mikellidou, K., Bussalb, A., Chaumon, M., George, N., Rorden, C., Victory, C., Bhatia, D., Aydogan, D. B., Yeh, F. C. F., Delogu, F., Guaje, J., Veraart, J., Fischer, J., Faskowitz, J., Fabrega, R., Hunt, D., McKee, S., Brown, S. T., Heyman, S., Iacovella, V., Mejia, A. F., Marinazzo, D., Craddock, R. C., Olivetti, E., Hanson, J. L., Garyfallidis, E., Stanzione, D., Carson, J., Henschel, R., Hancock, D. Y., Stewart, C. A., Schnyer, D., Eke, D. O., Poldrack, R. A., Bollman, S., Stewart, A., Bridge, H., Sani, I., Freiwald, W. A., Puce, A., Port, N. L. & Pestilli, F., toukok. 2024, julkaisussa: Nature Methods. 21, 5, s. 809-813 5 Sivumäärä
Tutkimustuotos: Lehtiartikkeli › Article › Scientific › vertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
8 Sitaatiot (Scopus)

27 Lataukset (Pure)
DELMEP : a deep learning algorithm for automated annotation of motor evoked potential latencies
Milardovich, D., Souza, V. H., Zubarev, I., Tugin, S., Nieminen, J. O., Bigoni, C., Hummel, F. C., Korhonen, J. T., Aydogan, D. B., Lioumis, P., Taherinejad, N., Grasser, T. & Ilmoniemi, R. J., jouluk. 2023, julkaisussa: Scientific Reports. 13, 1, s. 1-11 11 Sivumäärä, 8225.
Tutkimustuotos: Lehtiartikkeli › Article › Scientific › vertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
1 Sitaatiot (Scopus)

57 Lataukset (Pure)
Depression core network-based individualized targeting for transcranial magnetic stimulation
Raij, T. T., Komulainen, E., Aydogan, D. B., Pamilo, S., Isometsä, E. & Raij, T., 1 maalisk. 2023, julkaisussa: Brain Stimulation. 16, 2, s. 619-627 9 Sivumäärä
Tutkimustuotos: Lehtiartikkeli › Article › Scientific › vertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
5 Sitaatiot (Scopus)

112 Lataukset (Pure)
FreeSurfer 7 quality control : Key problem areas and importance of manual corrections
Vahermaa, V., Aydogan, D. B., Raij, T., Armio, R.-L., Laurikainen, H., Saramäki, J. & Suvisaari, J., lokak. 2023, julkaisussa: NeuroImage. 279, s. 1-6 6 Sivumäärä, 120306.
Tutkimustuotos: Lehtiartikkeli › Article › Scientific › vertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
4 Sitaatiot (Scopus)

273 Lataukset (Pure)

1 Aktiivinen
2 Päättynyt

ConnectToBrain: Connecting to the Networks of the Human Brain
Ilmoniemi, R. (Vastuullinen tutkija), Aydogan, D. B. (Projektin jäsen), Sinisalo, H. (Projektin jäsen), Li, L. (Projektin jäsen), Mäkinen, A. (Projektin jäsen), Pankka, H. (Projektin jäsen), Souza, V. (Projektin jäsen), Makkonen, M. (Projektin jäsen), Nieminen, A. (Projektin jäsen), Nissilä, I. (Projektin jäsen), Laine, M. (Projektin jäsen), Parvin, S. (Projektin jäsen), Rissanen, I. (Projektin jäsen), Kicic, D. (Projektin jäsen), Lioumis, P. (Projektin jäsen), Koistinen, L. (Projektin jäsen), Kahilakoski, O.-P. (Projektin jäsen), Raij, T. (Projektin jäsen), Soto de la Cruz, A. (Projektin jäsen), Tommila, T. (Projektin jäsen), Ylöstalo, T. (Projektin jäsen), Ukharova, E. (Projektin jäsen), Metsomaa, J. (Projektin jäsen), Vaalto, S. (Projektin jäsen), Granö, I. (Projektin jäsen), Koponen, M. (Projektin jäsen), Roine, T. (Projektin jäsen), Ahola, O. (Projektin jäsen) & Hakulinen, K. (Projektin jäsen)
01/08/2019 → 31/08/2026
Projekti: EU: ERC grants
Sähköisesti ja robotilla säädettävä aivostimulaatioskanneri
Ilmoniemi, R. (Vastuullinen tutkija), Koponen, L. (Projektin jäsen), Aydogan, D. B. (Projektin jäsen), Sinisalo, H. (Projektin jäsen), Soto de la Cruz, A. (Projektin jäsen), Vaalto, S. (Projektin jäsen), Lioumis, P. (Projektin jäsen), Souza, V. (Projektin jäsen), Granö, I. (Projektin jäsen), Lehto, I. (Projektin jäsen) & Salo, K. (Projektin jäsen)
01/09/2017 → 28/02/2022
Projekti: Academy of Finland: Other research funding
Proprioseptiikka aivojen sensorimotorisessa integraatiossa-terveillä, CP lapsilla ja kuntoutuvilla aivohalvauspotilailla
Piitulainen, H. (Vastuullinen tutkija), Nurmi, T. (Projektin jäsen), Aydogan, D. B. (Projektin jäsen) & Matilainen, N. (Projektin jäsen)
01/09/2016 → 31/08/2019
Projekti: Academy of Finland: Other research funding

Code used in article "Detecting corticospinal tract impairment in tumor patients with fiber density and tensor-based metrics".
Fekonja, L. S. (Creator), Wang, Z. (Creator), Aydogan, D. B. (Creator), Roine, T. (Creator), Engelhardt, M. (Creator), Dreyer, F. R. (Creator), Vajkoczy, P. (Creator) & Picht, T. (Creator), Zenodo, 2020
DOI - pysyväislinkki: 10.5281/zenodo.3732348
Tietoaineisto: Ohjelmisto tai koodi
DELMEP: A deep learning algorithm for automated annotation of motor evoked potential latencies
Milardovich, D. (Creator), Souza, V. H. (Creator), Zubarev, I. (Creator), Tugin, S. (Creator), Nieminen, J. O. (Creator), Bigoni, C. (Creator), Hummel, F. C. (Creator), Korhonen, J. T. (Creator), Aydogan, D. B. (Creator), Lioumis, P. (Creator), Taherinejad, N. (Creator), Grasser, T. (Creator) & Ilmoniemi, R. J. (Creator), Zenodo, 10 toukok. 2023
DOI - pysyväislinkki: 10.5281/zenodo.7920466, https://zenodo.org/record/7920467
Tietoaineisto: Ohjelmisto tai koodi
Trekker
Aydogan, D. B. (Creator), GitHub, 9 toukok. 2019
https://github.com/dmritrekker/trekker
Tietoaineisto: Ohjelmisto tai koodi

Diffusion MRI processing pipeline for real-time tractography-based nTMS
Aydogan, D. B. (Recipient), Souza, V. (Recipient) & Ilmoniemi, R. (Recipient), 9 marrask. 2019
Palkinto: Palkinto tai huomionosoitus tuotoksesta
ISBI 3-D Validation of Tractography with Experimental MRI (3D VoTEM)
Aydogan, D. (Recipient), 2018
Palkinto: Sijoittuminen kilpailussa tai osallistuminen kutsukilpailuun
ISMRM Tractography-reproducibility Challenge with Empirical Data (TraCED)
Aydogan, D. (Recipient), 2017
Palkinto: Sijoittuminen kilpailussa tai osallistuminen kutsukilpailuun
MICCAI CDMRI'21 DiSCo Tractography Challenge
Aydogan, D. B. (Recipient), 2021
Palkinto: Sijoittuminen kilpailussa tai osallistuminen kutsukilpailuun
MICCAI IronTract Tractography Challenge 2019 (Round 1)
Aydogan, D. B. (Recipient), 2019
Palkinto: Sijoittuminen kilpailussa tai osallistuminen kutsukilpailuun

4 Konferenssin tai seminaarin tieteellisen tai ohjelmatoimikunnan jäsenyys
3 Konferenssin tai seminaarin järjestelytoimikunnan jäsenyys
1 Väitöskirjan esitarkastajana tai vastaväittäjänä toimiminen tai jäsenyys tohtorikoulutusneuvostossa
1 Nimitetty asiantuntija- tai luottamustehtävä akateemisessa yhteisössä

ISMRM Study Group on MRI of Neuromodulation (Ulkoinen yksikkö)
Aydogan, D. B. (Jäsen)
2024
Aktiviteetti: Nimitetty asiantuntija- tai luottamustehtävä akateemisessa yhteisössä
ISMRM Workshop on MRI of Neuromodulation
Aydogan, D. B. (Member)
17 lokak. 2022 → 19 lokak. 2022
Aktiviteetti: Konferenssin tai seminaarin järjestelytoimikunnan jäsenyys
Opponent of Doctoral Thesis
Aydogan, D. B. (Examiner)
2022
Aktiviteetti: Väitöskirjan esitarkastajana tai vastaväittäjänä toimiminen tai jäsenyys tohtorikoulutusneuvostossa
MICCAI International Workshop on Computational Diffusion MRI
Aydogan, D. B. (Member)
2021
Aktiviteetti: Konferenssin tai seminaarin tieteellisen tai ohjelmatoimikunnan jäsenyys
MICCAI International Workshop on Computational Diffusion MRI
Aydogan, D. B. (Member)
2020
Aktiviteetti: Konferenssin tai seminaarin tieteellisen tai ohjelmatoimikunnan jäsenyys

Dogu Baran Aydogan

Henkilökohtainen profiili

Asiantuntemus YK:n kestävän kehityksen tavoitteista

Koulutus / tieteellinen pätevyys

Sormenjälki

Yhteistyöt ja huippututkimusalueet viimeisiltä viideltä vuodelta

Sukella yksityiskohtiin

Real-Time Tractography-Assisted Neuronavigation for Transcranial Magnetic Stimulation

brainlife.io : a decentralized and open-source cloud platform to support neuroscience research

DELMEP : a deep learning algorithm for automated annotation of motor evoked potential latencies

Depression core network-based individualized targeting for transcranial magnetic stimulation

FreeSurfer 7 quality control : Key problem areas and importance of manual corrections

ConnectToBrain: Connecting to the Networks of the Human Brain

Sähköisesti ja robotilla säädettävä aivostimulaatioskanneri

Proprioseptiikka aivojen sensorimotorisessa integraatiossa-terveillä, CP lapsilla ja kuntoutuvilla aivohalvauspotilailla

Code used in article "Detecting corticospinal tract impairment in tumor patients with fiber density and tensor-based metrics".

DELMEP: A deep learning algorithm for automated annotation of motor evoked potential latencies

Trekker

Diffusion MRI processing pipeline for real-time tractography-based nTMS

ISBI 3-D Validation of Tractography with Experimental MRI (3D VoTEM)

ISMRM Tractography-reproducibility Challenge with Empirical Data (TraCED)

MICCAI CDMRI'21 DiSCo Tractography Challenge

MICCAI IronTract Tractography Challenge 2019 (Round 1)

ISMRM Study Group on MRI of Neuromodulation (Ulkoinen yksikkö)

ISMRM Workshop on MRI of Neuromodulation

Opponent of Doctoral Thesis

MICCAI International Workshop on Computational Diffusion MRI

MICCAI International Workshop on Computational Diffusion MRI

Dogu Baran Aydogan

Henkilökohtainen profiili

Asiantuntemus YK:n kestävän kehityksen tavoitteista

Koulutus / tieteellinen pätevyys

Sormenjälki

Yhteistyöt ja huippututkimusalueet viimeisiltä viideltä vuodelta

Tutkimustuotos

Projektit

Tietoaineistot

Palkinnot

Aktiviteetit