Professorship Rousu J.

Yksikkö: Tutkimusryhmä

Tutkimustuotokset

  1. 2019
  2. Julkaistu

    Improved Small Molecule Identification through Learning Combinations of Kernel Regression Models

    Brouard, C., Basse, A., d'Alche-Buc, F. & Rousu, J., elokuuta 2019, julkaisussa : METABOLITES. 9, 8, 14 Sivumäärä, 160.

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  3. Julkaistu

    Bayesian metabolic flux analysis reveals intracellular flux couplings

    Heinonen, M., Osmala, M., Mannerström, H., Wallenius, J., Kaski, S., Rousu, J. & Lähdesmäki, H., 15 heinäkuuta 2019, julkaisussa : Bioinformatics. 35, 14, s. i548-i557 btz315.

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  4. Julkaistu

    SIRIUS 4: a rapid tool for turning tandem mass spectra into metabolite structure information

    Dührkop, K., Fleischauer, M., Ludwig, M., Aksenov, A. A., Melnik, A. V., Meusel, M., Dorrestein, P. C., Rousu, J. & Böcker, S., 1 huhtikuuta 2019, julkaisussa : Nature Methods. 16, 4, s. 299-302 4 Sivumäärä

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  5. Julkaistu

    Clustering Diagnostic Profiles of Patients

    Hollmén, J. & Papapetrou, P., 1 tammikuuta 2019, Artificial Intelligence Applications and Innovations - 15th IFIP WG 12.5 International Conference, AIAI 2019, Proceedings. Iliadis, L., Pimenidis, E., MacIntyre, J. & Maglogiannis, I. (toim.). s. 120-126 7 Sivumäärä (IFIP Advances in Information and Communication Technology; painos 559).

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussavertaisarvioitu

  6. Julkaistu

    Hidden sources like saline flushes make a significant contribution to the fluid intake of very low birthweight infants during the first postnatal week

    Mäkelä, P. M., Immeli, L., Leskinen, M., Rinta-Koski, O. P., Sund, R., Andersson, S. & Luukkainen, P., 1 tammikuuta 2019, julkaisussa : Acta Paediatrica, International Journal of Paediatrics.

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  7. Julkaistu

    Large-Scale Sparse Kernel Canonical Correlation Analysis

    Uurtio, V., Bhadra, S. & Rousu, J., 2019, Proceedings of the 36th International Conference on Machine Learning. s. 6383-6391 9 Sivumäärä (Proceedings of Machine Learning Research; painos 97).

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussavertaisarvioitu

  8. 2018
  9. Julkaistu

    Liquid-chromatography retention order prediction for metabolite identification

    Bach, E., Szedmak, S., Brouard, C., Boecker, S. & Rousu, J., 1 syyskuuta 2018, julkaisussa : Bioinformatics. 34, 17, s. 875-883 9 Sivumäärä

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  10. Julkaistu

    Learning with multiple pairwise kernels for drug bioactivity prediction

    Cichonska, A., Pahikkala, T., Szedmak, S., Julkunen, H., Airola, A., Heinonen, M., Aittokallio, T. & Rousu, J., 1 heinäkuuta 2018, julkaisussa : Bioinformatics. 34, 13, s. i509-i518

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  11. Julkaistu

    Exploring epistaxis as an adverse effect of anti-thrombotic drugs and outdoor temperature

    Hollmén, J., Boström, H., Asker, L., Karlsson, I., Papapetrou, P., Wikner, B. N. & Ohman, I., 26 kesäkuuta 2018, Proceedings of the 11th PErvasive Technologies Related to Assistive Environments Conference, PETRA 2018. s. 1-4 4 Sivumäärä

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussavertaisarvioitu

  12. Julkaistu

    A survey of evaluation methods for personal route and destination prediction from mobility traces

    Stegmann, R. A., Žliobaitė, I., Tolvanen, T., Hollmén, J. & Read, J., 1 maaliskuuta 2018, julkaisussa : Wiley Interdisciplinary Reviews: Data Mining and Knowledge Discovery. 8, 2, s. 1-18 e1237.

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  13. Julkaistu

    Analysis of fluxomic experiments with principal metabolic flux mode analysis

    Bhadra, S. & Rousu, J., 1 tammikuuta 2018, Methods in Molecular Biology. Mamitsuka, H. (toim.). s. 141-161 21 Sivumäärä (Methods in Molecular Biology; painos 1807).

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussavertaisarvioitu

  14. Julkaistu

    Analyzing business process changes using influence analysis

    Lehto, T., Hinkka, M. & Hollmén, J., 1 tammikuuta 2018, julkaisussa : CEUR Workshop Proceedings. 2270, s. 32-46 15 Sivumäärä

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  15. Julkaistu

    Gaussian process classification for prediction of in-hospital mortality among preterm infants

    Rinta-Koski, O. P., Särkkä, S., Hollmén, J., Leskinen, M. & Andersson, S., 2018, julkaisussa : Neurocomputing. 298, s. 134-141

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  16. Julkaistu

    Integrating Multi-Purpose Natural Language Understanding, Robot's Memory, and Symbolic Planning for Task Execution in Humanoid Robots

    Wächter, M., Ovchinnikova, E., Wittenbeck, V., Kaiser, P., Szedmak, S., Mustafa, W., Kraft, D., Krüger, N., Piater, J. & Asfour, T., 2018, julkaisussa : Robotics and Autonomous Systems. 99, s. 148-165

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  17. Julkaistu

    Machine Learning for Systems Pharmacology

    Cichońska, A., 2018, Aalto University. 190 Sivumäärä

    Tutkimustuotos

  18. Julkaistu

    Machine learning in neonatal intensive care

    Rinta-Koski, O-P., 2018, Aalto University. 128 Sivumäärä

    Tutkimustuotos

  19. Julkaistu

    Principal metabolic flux mode analysis

    Bhadra, S., Blomberg, P., Castillo, S. & Rousu, J., 2018, julkaisussa : Bioinformatics. 34, 14, s. 2409-2417

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  20. Julkaistu

    Sparse Non-linear CCA through Hilbert-Schmidt Independence Criterion

    Uurtio, V., Bhadra, S. & Rousu, J., 2018, 2018 IEEE International Conference on Data Mining, ICDM 2018. IEEE, s. 1278-1283 6 Sivumäärä 8594981

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussavertaisarvioitu

  21. 2017
  22. Julkaistu

    Effects of precipitation and temperature on the growth variation of Scots pine-A case study at two extreme sites in Finland

    Nojd, P., Korpela, M., Hari, P., Rannik, U., Sulkava, M., Hollmen, J. & Makinen, H., joulukuuta 2017, julkaisussa : DENDROCHRONOLOGIA. 46, s. 35-45 11 Sivumäärä

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  23. Julkaistu

    Magnitude-Preserving Ranking for Structured Outputs

    Brouard, C., Bach, E., Böcker, S. & Rousu, J., 3 marraskuuta 2017, Proceedings of the Ninth Asian Conference on Machine Learning. Zhang, M-L. & Noh, Y-K. (toim.). s. 407-422 16 Sivumäärä (Proceedings of Machine Learning Research; painos 77).

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussavertaisarvioitu

  24. Julkaistu

    Machine Learning and Knowledge Discovery in Databases: European Conference, ECML PKDD 2017, Skopje, Macedonia, September 18–22, 2017, Proceedings, Part I

    Ceci, M., Hollmen, J., Todorovski, L., Vens, C. & Džeroski, S., 18 syyskuuta 2017, Springer International Publishing. 852 Sivumäärä ( Lecture Notes in Computer Science; painos 10534)

    Tutkimustuotos: Kirja

  25. Julkaistu

    Machine Learning and Knowledge Discovery in Databases: European Conference, ECML PKDD 2017, Skopje, Macedonia, September 18–22, 2017, Proceedings, Part II

    Ceci, M., Hollmen, J., Todorovski, L., Vens, C. & Džeroski, S., 18 syyskuuta 2017, 866 Sivumäärä ( Lecture Notes in Computer Science; painos 10535)

    Tutkimustuotos: Kirja

  26. Julkaistu

    Computational-experimental approach to drug-target interaction mapping: A case study on kinase inhibitors

    Cichonska, A., Ravikumar, B., Parri, E., Timonen, S., Pahikkala, T., Airola, A., Wennerberg, K., Rousu, J. & Aittokallio, T., 1 elokuuta 2017, julkaisussa : PLoS computational biology. 13, 8, s. 1-28 e1005678.

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  27. Julkaistu

    Decreasing Uncertainty in Planning with State Prediction

    Krivic, S., Cashmore, M., Magazzeni, D., Ridder, B., Szedmak, S. & Piater, J., elokuuta 2017, Proceedings of the Twenty-Sixth International Joint Conference on Artificial Intelligence (IJCAI-17). Sierra, C. (toim.). s. 2032-2038

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussavertaisarvioitu

  28. Julkaistu

    BLPA: Bayesian learn-predict-adjust method for online detection of recurrent changepoints

    Maslov, A., Pechenizkiy, M., Pel, Y., Zliobaite, I., Shklyaev, A., Karkkainen, T. & Hollmen, J., 30 kesäkuuta 2017, 2017 International Joint Conference on Neural Networks, IJCNN 2017 - Proceedings. Institute of Electrical and Electronics Engineers, s. 1916-1923 8 Sivumäärä 7966085. (Proceedings of International Joint Conference on Neural Networks).

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussavertaisarvioitu

  29. Julkaistu

    Newtonian boreal forest ecology: The Scots pine ecosystem as an example

    Hari, P., Aakala, T., Aalto, J., Bäck, J., Hollmén, J., Jõgiste, K., Koupaei, K. K., Kähkönen, M. A., Korpela, M., Kulmala, L. & 6 muuta, Nikinmaa, E., Pumpanen, J., Salkinoja-Salonen, M., Schiestl-Aalto, P., Simojoki, A. & Havimo, M., 1 kesäkuuta 2017, julkaisussa : PloS one. 12, 6, s. 1-27 e0177927.

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  30. Julkaistu

    Reliability of temperature signal in various climate indicators from northern Europe

    Hari, P., Aakala, T., Hilasvuori, E., Hakkinen, R., Korhola, A., Korpela, M., Linkosalo, T., Makinen, H., Nikinmaa, E., Nöjd, P. & 6 muuta, Seppa, H., Sulkava, M., Terhivuo, J., Tuomenvirta, H., Weckstrom, J. & Hollmen, J., 1 kesäkuuta 2017, julkaisussa : PloS one. 12, 6, s. 1-20 e0180042.

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  31. Julkaistu

    Multi-view kernel completion

    Bhadra, S., Kaski, S. & Rousu, J., toukokuuta 2017, julkaisussa : Machine Learning. 106, 5, s. 713–739

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  32. Julkaistu

    Improved postnatal growth of extremely low-birthweight boys over the last two decades

    Immeli, L., Andersson, S., Leskinen, M., Vuorinen, E., Rinta-Koski, O. P. & Luukkainen, P., huhtikuuta 2017, julkaisussa : Acta Paediatrica. 106, 4, s. 676–679

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  33. Julkaistu

    Critical Assessment of Small Molecule Identification 2016: automated methods

    Schymanski, E. L., Ruttkies, C., Krauss, M., Brouard, C., Kind, T., Dührkop, K., Allen, F., Vaniya, A., Verdegem, D., Böcker, S. & 7 muuta, Rousu, J., Shen, H., Tsugawa, H., Sajed, T., Fiehn, O., Ghesquière, B. & Neumann, S., 27 maaliskuuta 2017, julkaisussa : JOURNAL OF CHEMINFORMATICS. 9, 1, 22.

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  34. Julkaistu

    A 5.3 pJ/op approximate TTA VLIW tailored for machine learning

    Teittinen, J., Hiienkari, M., Zliobaite, I., Hollmen, J., Berg, H., Heiskala, J., Viitanen, T., Simonsson, J. & Koskinen, L., 1 maaliskuuta 2017, julkaisussa : Microelectronics Journal. 61, s. 106-113 8 Sivumäärä

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  35. Julkaistu

    Multi-label methods for prediction with sequential data

    Read, J., Martino, L. & Hollmén, J., 1 maaliskuuta 2017, julkaisussa : Pattern Recognition. 63, s. 45-55 11 Sivumäärä

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  36. Julkaistu

    Identifying the main drivers for the production and maturation of Scots pine tracheids along a temperature gradient

    Kulmala, L., Read, J., Nöjd, P., Rathgeber, C. B. K., Cuny, H. E., Hollmén, J. & Mäkinen, H., 15 tammikuuta 2017, julkaisussa : Agricultural and Forest Meteorology. 232, s. 210-224 15 Sivumäärä

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  37. Julkaistu

    Initial state prediction in planning

    Krivic, S., Cashmore, M., Ridder, B., Magazzeni, D., Szedmak, S. & Piater, J., 1 tammikuuta 2017, WS-17-01: Artificial Intelligence and Operations Research for Social Good; WS-17-02: Artificial Intelligence, Ethics, and Society; WS-17-03: Artificial Intelligence for Connected and Automated Vehicles; WS-17-04: Artificial Intelligence for Cyber Security; WS-17-05: Artificial Intelligence for Smart Grids and Buildings; WS-17-06: Computer Poker and Imperfect Information Games; WS-17-07: Crowdsourcing, Deep Learning and Artificial Intelligence Agents; WS-17-08: Distributed Machine Learning; WS-17-09: Joint Workshop on Health Intelligence; WS-17-10: Human-Aware Artificial Intelligence; WS-17-11: Human-Machine Collaborative Learning; WS-17-12: Knowledge-Based Techniques for Problem Solving and Reasoning; WS-17-13: Plan, Activity, and Intent Recognition; WS-17-14: Symbolic Inference and Optimization; WS-17-15: What's Next for AI in Games?. s. 750-757 8 Sivumäärä

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussavertaisarvioitu

  38. Julkaistu

    Magnitude-preserving ranking for structured outputs

    Brouard, C., Bach, E., Böcker, S. & Rousu, J., 1 tammikuuta 2017, julkaisussa : Journal of Machine Learning Research. 77, s. 407-422 16 Sivumäärä

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  39. Julkaistu

    A Tutorial on Canonical Correlation Methods

    Uurtio, V., Monteiro, J. M., Kandola, J., Shawe-Taylor, J., Fernandez-Reyes, D. & Rousu, J., 2017, julkaisussa : ACM COMPUTING SURVEYS. 50, 6, s. 1-33 95.

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  40. Julkaistu

    CamOptimus: a tool for exploiting complex adaptive evolution to optimize experiments and processes in biotechnology

    Cankorur-Cetinkaya, A., Dias, J. M. L., Kludas, J., Slater, N. K. H., Rousu, J., Oliver, S. G. & Dikicioglu, D., 2017, julkaisussa : MICROBIOLOGY. 163, 6, s. 829-839 11 Sivumäärä

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  41. Julkaistu

    Focusing business process lead time improvements using influence analysis

    Lehto, T., Hinkka, M. & Hollmén, J., 2017, Data-driven Process Discovery and Analysis: Proceedings of the 7th International Symposium on Data-driven Process Discovery and Analysis (SIMPDA 2017), Neuchatel, Switzerland, December 6-8, 2017. Ceravolo, P., Van Keulen, M. & Stoffel, K. (toim.). CEUR, s. 54-67 14 Sivumäärä (CEUR Workshop Proceedings ; painos 2016). (CEUR Workshop Proceedings).

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussavertaisarvioitu

  42. Julkaistu

    Machine Learning for Small Molecule Identification

    Shen, H., 2017, Aalto University. 160 Sivumäärä

    Tutkimustuotos

  43. Julkaistu

    Predicting Protein Producibility In Filamentous Fungi

    Dykstra, K., Rousu, J. & Arvas, M., 2017, s. 1-18.

    Tutkimustuotos: Työpaperi

  44. Julkaistu

    Prediction of major complications affecting very low birth weight infants

    Rinta-Koski, O-P., Särkkä, S., Hollmen, J., Leskinen, M., Rantakari, K. & Andersson, S., 2017, 2017 IEEE LIFE SCIENCES CONFERENCE (LSC). IEEE, s. 186-189 4 Sivumäärä

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussavertaisarvioitu

  45. Julkaistu

    Principal Metabolic Flux Mode Analysis

    Bhadra, S., Blomberg, P., Castillo, S. & Rousu, J., 2017, julkaisussa : bioRxiv. s. 163055 7 Sivumäärä

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkeli

  46. Julkaistu

    Utilising Kronecker Decomposition and Tensor-based Multi-view Learning to predict where people are looking in images

    Pasupa, K. & Szedmak, S., 2017, julkaisussa : Neurocomputing. 248, s. 80–93

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  47. 2016
  48. Julkaistu

    Selected proceedings of Machine Learning in Systems Biology: MLSB 2016

    van Dijk, A. D. J., Lähdesmäki, H., de Ridder, D. & Rousu, J., 13 joulukuuta 2016, julkaisussa : BMC Bioinformatics. 17, Supplement 16, 2 Sivumäärä

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkeli

  49. Julkaistu

    Selected proceedings of Machine Learning in Systems Biology: MLSB 2016

    van Dijk, A. D. J., Lähdesmäki, H., de Ridder, D. & Rousu, J., joulukuuta 2016, julkaisussa : BMC Bioinformatics. 17

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  50. Julkaistu

    Explaining mixture models through semantic pattern mining and banded matrix visualization

    Adhikari, P. R., Vavpetič, A., Kralj, J., Lavrač, N. & Hollmén, J., lokakuuta 2016, julkaisussa : Machine Learning. 105, 1, s. 3-39 36 Sivumäärä

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  51. Julkaistu

    Soft Kernel Target Alignment for Two-stage Multiple Kernel Learning

    Shen, H., Szedmak, S., Brouard, C. & Rousu, J., lokakuuta 2016, Discovery Science: 19th International Conference, DS 2016, Bari, Italy, October 19–21, 2016, Proceedings. Calders, T., Ceci, M. & Malerba, D. (toim.). 1 toim. Springer International Publishing, Vuosikerta 9956. s. 427-441 (Lecture Notes in Artificial Intelligence; painos 9956).

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussavertaisarvioitu

  52. Julkaistu

    Resource frequency prediction in healthcare: Machine learning approach

    Vieira, D. & Hollmen, J., 16 elokuuta 2016, Proceedings - IEEE 29th International Symposium on Computer-Based Medical Systems, CBMS 2016. Institute of Electrical and Electronics Engineers, Vuosikerta 2016-August. s. 88-93 6 Sivumäärä 7545963

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussavertaisarvioitu

  53. Julkaistu

    An ecometric analysis of the fossil mammal record of the Turkana basin

    Fortelius, M., Zliobaite, I., Kaya, F., Bibi, F., Bobe, R., Leakey, L., Leakey, M., Patterson, D., Rannikko, J. & Werdelin, L., 5 heinäkuuta 2016, julkaisussa : PHILOSOPHICAL TRANSACTIONS OF THE ROYAL SOCIETY B: BIOLOGICAL SCIENCES. 371, 1698, 13 Sivumäärä, 20150232.

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  54. Julkaistu

    Machine learning of protein interactions in fungal secretory pathways

    Kludas, J., Arvas, M., Castillo, S., Pakula, T., Oja, M., Brouard, C., Jäntti, J., Penttilä, M. & Rousu, J., 1 heinäkuuta 2016, julkaisussa : PloS one. 11, 7, s. 1-20 20 Sivumäärä, e0159302.

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

Edellinen 1 2 Seuraava

ID: 4319611