Professorship Lähdesmäki H.

Tutkimustuotos

2020

Accounting for environmental variation in co-occurrence modelling reveals the importance of positive interactions in root-associated fungal communities

Abrego, N., Roslin, T., Huotari, T., Tack, A. J. M., Lindahl, B. D., Tikhonov, G., Somervuo, P., Schmidt, N. M. & Ovaskainen, O., 1 tammikuuta 2020, julkaisussa : MOLECULAR ECOLOGY.

Tutkimustuotos: LehtiartikkeliArticleScientificvertaisarvioitu

Open access

A personalised approach for identifying disease-relevant pathways in heterogeneous diseases

Somani, J., Ramchandran, S. & Lähdesmäki, H., 1 joulukuuta 2020, julkaisussa : npj Systems Biology and Applications. 6, 1, 17.

Tutkimustuotos: LehtiartikkeliArticleScientificvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
6 Lataukset (Pure)

Computationally efficient joint species distribution modeling of big spatial data

Tikhonov, G., Duan, L., Abrego, N., Newell, G., White, M., Dunson, D. & Ovaskainen, O., helmikuuta 2020, julkaisussa : ECOLOGY. 101, 2, e02929.

Tutkimustuotos: LehtiartikkeliArticleScientificvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
3 Sitaatiot (Scopus)
30 Lataukset (Pure)

Deep Convolutional Gaussian Processes

Blomqvist, K., Kaski, S. & Heinonen, M., 1 tammikuuta 2020, Machine Learning and Knowledge Discovery in Databases - European Conference, ECML PKDD 2019, Proceedings. Brefeld, U., Fromont, E., Hotho, A., Knobbe, A., Maathuis, M. & Robardet, C. (toim.). s. 582-597 16 Sivumäärä (Lecture Notes in Computer Science (including subseries Lecture Notes in Artificial Intelligence and Lecture Notes in Bioinformatics); Vuosikerta 11907 LNAI).

Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussaConference contributionScientificvertaisarvioitu

Enhancer prediction in the human genome by probabilistic modelling of the chromatin feature patterns

Osmala, M. & Lähdesmäki, H., 20 heinäkuuta 2020, julkaisussa : BMC Bioinformatics. 21, 1, 37 Sivumäärä

Tutkimustuotos: LehtiartikkeliArticleScientificvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
51 Lataukset (Pure)

Higher host plant specialization of root-associated endophytes than mycorrhizal fungi along an arctic elevational gradient

Abrego, N., Huotari, T., Tack, A. J. M., Lindahl, B. D., Tikhonov, G., Somervuo, P., Martin Schmidt, N., Ovaskainen, O. & Roslin, T., 2020, julkaisussa : ECOLOGY AND EVOLUTION. 14 Sivumäärä

Tutkimustuotos: LehtiartikkeliArticleScientificvertaisarvioitu

Open access

Learning spectrograms with convolutional spectral kernels

Shen, Z., Heinonen, M. & Kaski, S., 2020, (Hyväksytty/In press) The 23rd International Conference on Artificial Intelligence and Statistic. (Proceedings of Machine Learning Research).

Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussaConference contributionScientificvertaisarvioitu

Likelihood-Free Inference with Deep Gaussian Processes

Aushev, A., Pesonen, H., Heinonen, M., Corander, J. & Kaski, S., 18 kesäkuuta 2020, (Jätetty).

Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussaKonferenssiesitysScientific

2019

A Mathematical Model for Enhancer Activation Kinetics During Cell Differentiation

Nousiainen, K., Intosalmi, J. & Lähdesmäki, H., 1 tammikuuta 2019, Algorithms for Computational Biology - 6th International Conference, AlCoB 2019, Proceedings. Vega-Rodríguez, M. A., Holmes, I. & Martín-Vide, C. (toim.). s. 191-202 12 Sivumäärä (Lecture Notes in Computer Science (including subseries Lecture Notes in Artificial Intelligence and Lecture Notes in Bioinformatics); Vuosikerta 11488 LNBI).

Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussaConference contributionScientificvertaisarvioitu

An additive Gaussian process regression model for interpretable non-parametric analysis of longitudinal data

Cheng, L., Ramchandran, S., Vatanen, T., Lietzén, N., Lahesmaa, R., Vehtari, A. & Lähdesmäki, H., 17 huhtikuuta 2019, julkaisussa : Nature Communications. 10, 1, s. 1-11 11 Sivumäärä, 1798.

Tutkimustuotos: LehtiartikkeliArticleScientificvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
4 Sitaatiot (Scopus)
146 Lataukset (Pure)

Bayesian metabolic flux analysis reveals intracellular flux couplings

Heinonen, M., Osmala, M., Mannerström, H., Wallenius, J., Kaski, S., Rousu, J. & Lähdesmäki, H., 15 heinäkuuta 2019, julkaisussa : Bioinformatics. 35, 14, s. i548-i557 btz315.

Tutkimustuotos: LehtiartikkeliArticleScientificvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
1 Sitaatiot (Scopus)
90 Lataukset (Pure)

Data-driven multiscale modeling reveals the role of metabolic coupling for the spatio-temporal growth dynamics of yeast colonies

Intosalmi, J., Scott, A. C., Hays, M., Flann, N., Yli-Harja, O., Lähdesmäki, H., Dudley, A. M. & Skupin, A., 19 joulukuuta 2019, julkaisussa : BMC Molecular and Cell Biology. 20, 1, 59.

Tutkimustuotos: LehtiartikkeliArticleScientificvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
28 Lataukset (Pure)

Deep learning with differential Gaussian process flows

Hegde, P., Heinonen, M., Lähdesmäki, H. & Kaski, S., huhtikuuta 2019, The 22nd International Conference on Artificial Intelligence and Statistic. Vuosikerta 89. s. 1-15 16 Sivumäärä (Proceedings of Machine Learning Research; Vuosikerta 89).

Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussaConference contributionScientificvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
30 Lataukset (Pure)

Early detection of peripheral blood cell signature in children developing β-cell autoimmunity at a young age

Kallionpää, H., Somani, J., Tuomela, S., Ullah, U., De Albuquerque, R., Lönnberg, T., Komsi, E., Siljander, H., Honkanen, J., Härkönen, T., Peet, A., Tillmann, V., Chandra, V., Anagandula, M. K., Frisk, G., Otonkoski, T., Rasool, O., Lund, R., Lähdesmäki, H., Knip, M. & 1 muuta, Lahesmaa, R., 1 lokakuuta 2019, julkaisussa : DIABETES. 68, 10, s. 2024-2034 11 Sivumäärä

Tutkimustuotos: LehtiartikkeliArticleScientificvertaisarvioitu

3 Sitaatiot (Scopus)

Enhancer prediction in the human genome by probabilistic modeling of the chromatin feature patterns

Osmala, M. & Lähdesmäki, H., 17 lokakuuta 2019, (Jätetty) julkaisussa : Springer.

Tutkimustuotos: LehtiartikkeliArticleScientificvertaisarvioitu

Genomic variation and strain-specific functional adaptation in the human gut microbiome during early life

Vatanen, T., Plichta, D. R., Somani, J., Münch, P. C., Arthur, T. D., Hall, A. B., Rudolf, S., Oakeley, E. J., Ke, X., Young, R. A., Haiser, H. J., Kolde, R., Yassour, M., Luopajärvi, K., Siljander, H., Virtanen, S. M., Ilonen, J., Uibo, R., Tillmann, V., Mokurov, S. & 8 muuta, Dorshakova, N., Porter, J. A., McHardy, A. C., Lähdesmäki, H., Vlamakis, H., Huttenhower, C., Knip, M. & Xavier, R. J., 1 maaliskuuta 2019, julkaisussa : Nature Microbiology. 4, 3, s. 470-479

Tutkimustuotos: LehtiartikkeliArticleScientificvertaisarvioitu

24 Sitaatiot (Scopus)

Joint species distribution modelling with the R-package Hmsc

Tikhonov, G., Opedal, Ø. H., Abrego, N., Lehikoinen, A., de Jonge, M. M. J., Oksanen, J. & Ovaskainen, O., 25 joulukuuta 2019, julkaisussa : Methods in Ecology and Evolution. 11, 3, s. 442-447

Tutkimustuotos: LehtiartikkeliArticleScientificvertaisarvioitu

Open access
12 Sitaatiot (Scopus)

ODE2VAE: Deep generative second order ODEs with Bayesian neural networks

Yildiz, C., Heinonen, M. & Lähdesmäki, H., 2019, 33rd Conference on Neural Information Processing Systems: NeurIPS 2019 . Neural Information Processing Systems Foundation, (Advances in Neural Information Processing Systems; Vuosikerta 32).

Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussaConference contributionScientificvertaisarvioitu

Open access

Peripheral blood DNA methylation differences in twin pairs discordant for Alzheimer's disease

Konki, M., Malonzo, M., Karlsson, I. K., Lindgren, N., Ghimire, B., Smolander, J., Scheinin, N. M., Ollikainen, M., Laiho, A., Elo, L. L., Lonnberg, T., Roytta, M., Pedersen, N. L., Kaprio, J., Lahdesmaki, H., Rinne, J. O. & Lund, R. J., 2 syyskuuta 2019, julkaisussa : Clinical epigenetics. 11, 1, 12 Sivumäärä, 130.

Tutkimustuotos: LehtiartikkeliArticleScientificvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
1 Sitaatiot (Scopus)
45 Lataukset (Pure)

TimeRank: A random walk approach for community discovery in dynamic networks

Sarantopoulos, I., Papatheodorou, D., Vogiatzis, D., Tzortzis, G. & Paliouras, G., 1 tammikuuta 2019, Complex Networks and Their Applications VII - Volume 1 Proceedings The 7th International Conference on Complex Networks and their Applications COMPLEX NETWORKS 2018. Lambiotte, R., Rocha, L. M., Lió, P., Cherifi, H., Aiello, L. M. & Cherifi, C. (toim.). s. 338-350 13 Sivumäärä (Studies in Computational Intelligence; Vuosikerta 812).

Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussaConference contributionScientificvertaisarvioitu

1 Sitaatiot (Scopus)
2018

A Nonparametric Spatio-temporal SDE Model

Yildiz, C., Heinonen, M. & Lähdesmäki, H., 2018, NIPS 2018 Spatiotemporal Workshop: 32nd Conference on Neural Information Processing Systems (NIPS 2018), Montréal, Canada. Neural Information Processing Systems Foundation, s. 1-5

Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussaConference contributionProfessional

Asynchronous Stochastic Quasi-Newton MCMC for Non-Convex Optimization

Simsekli, U., Yildiz, C., Nguyen, T. H., Richard, G. & Cemgil, A. T., 2018, Proceedings of the 35th International Conference on Machine Learning. s. 4681-4690 (Proceedings of Machine Learning Research; Vuosikerta 80).

Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussaConference contributionScientificvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
4 Lataukset (Pure)

Asynchronous stochastic Quasi-Newton MCMC for non-convex optimization supplementary document

Simsekli, U., Yildiz, C., Nguyen, T. H., Richard, G. & Cemgil, A. T., 1 tammikuuta 2018, 35th International Conference on Machine Learning, ICML 2018. Krause, A. & Dy, J. (toim.). Vuosikerta 11. s. 4674-4683 8 Sivumäärä (Proceedings of Machine Learning Research; Vuosikerta 80).

Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussaConference contributionScientificvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
12 Lataukset (Pure)

Atopic asthma after rhinovirus-induced wheezing is associated with DNA methylation change in the SMAD3 gene promoter

Lund, R. J., Osmala, M., Malonzo, M., Lukkarinen, M., Leino, A., Salmi, J., Vuorikoski, S., Turunen, R., Vuorinen, T., Akdis, C., Lähdesmäki, H., Lahesmaa, R. & Jartti, T., 5 toukokuuta 2018, julkaisussa : Allergy. 73, 8, s. 1735-1740 6 Sivumäärä

Tutkimustuotos: LehtiartikkeliArticleScientificvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
16 Sitaatiot (Scopus)
136 Lataukset (Pure)

Characterization and non-parametric modeling of the developing serum proteome during infancy and early childhood

Lietzén, N., Cheng, L., Moulder, R., Siljander, H., Laajala, E., Härkönen, T., Peet, A., Vehtari, A., Tillmann, V., Knip, M., Lähdesmäki, H. & Lahesmaa, R., 1 joulukuuta 2018, julkaisussa : Scientific Reports. 8, 1, s. 1-13 5883.

Tutkimustuotos: LehtiartikkeliArticleScientificvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
3 Sitaatiot (Scopus)
149 Lataukset (Pure)

Flex ddG: Rosetta Ensemble-Based Estimation of Changes in Protein–Protein Binding Affinity upon Mutation

Barlow, K., Conchuir, S., Thompson, S., Suresh, P., Lucas, J., Heinonen, M. & Kortemme, T., 31 toukokuuta 2018, julkaisussa : Journal of Physical Chemistry B. 122, 21, s. 5389-5399 11 Sivumäärä

Tutkimustuotos: LehtiartikkeliArticleScientificvertaisarvioitu

26 Sitaatiot (Scopus)

Generative models for quantification of DNA modifications

Äijö, T., Bonneau, R. & Lähdesmäki, H., 1 tammikuuta 2018, Methods in Molecular Biology. s. 37-50 14 Sivumäärä (Methods in Molecular Biology; Vuosikerta 1807).

Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussaChapterScientificvertaisarvioitu

1 Sitaatiot (Scopus)

Learning Stochastic Differential Equations With Gaussian Processes Without Gradient Matching

Yildiz, C., Heinonen, M., Intosalmi, J., Mannerström, H. & Lähdesmäki, H., 2018, IEEE International Workshop on Machine Learning for Signal Processing. IEEE, 6 Sivumäärä 8516991

Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussaConference contributionScientificvertaisarvioitu

3 Sitaatiot (Scopus)

Learning unknown ODE models with Gaussian processes

Heinonen, M., Yildiz, C., Mannerström, H., Intosalmi, J. & Lähdesmäki, H., 2018, Proceedings of the 35th International Conference on Machine Learning, ICML 2018. Vuosikerta 5. s. 3120-3132 13 Sivumäärä (Proceedings of Machine Learning Research; Vuosikerta 80).

Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussaConference contributionScientificvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
1 Sitaatiot (Scopus)
23 Lataukset (Pure)

Learning with multiple pairwise kernels for drug bioactivity prediction

Cichonska, A., Pahikkala, T., Szedmak, S., Julkunen, H., Airola, A., Heinonen, M., Aittokallio, T. & Rousu, J., 1 heinäkuuta 2018, julkaisussa : Bioinformatics. 34, 13, s. i509-i518

Tutkimustuotos: LehtiartikkeliArticleScientificvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
4 Sitaatiot (Scopus)
82 Lataukset (Pure)

MGPfusion: Predicting protein stability changes with Gaussian process kernel learning and data fusion

Jokinen, E., Heinonen, M. & Lähdesmäki, H., 1 heinäkuuta 2018, julkaisussa : Bioinformatics. 34, 13, s. i274-i283

Tutkimustuotos: LehtiartikkeliArticleScientificvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
7 Sitaatiot (Scopus)
74 Lataukset (Pure)

Quantitative proteomic characterization and comparison of T helper 17 and induced regulatory T cells

Mohammad, I., Nousiainen, K., Bhosale, S. D., Starskaia, I., Moulder, R., Rokka, A., Cheng, F., Mohanasundaram, P., Eriksson, J. E., Goodlett, D. R., Lähdesmäki, H. & Chen, Z., 31 toukokuuta 2018, julkaisussa : PLoS Biology. 16, 5, e2004194.

Tutkimustuotos: LehtiartikkeliArticleScientificvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
3 Sitaatiot (Scopus)
135 Lataukset (Pure)

snpEnrichR: analyzing co-localization of SNPs and their proxies in genomic regions

Nousiainen, K., Kanduri, K., Ricaño-Ponce, I., Wijmenga, C., Lahesmaa, R., Kumar, V. & Lähdesmäki, H., 1 joulukuuta 2018, julkaisussa : Bioinformatics (Oxford, England). 34, 23, s. 4112-4114 3 Sivumäärä

Tutkimustuotos: LehtiartikkeliArticleScientificvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
88 Lataukset (Pure)

Temporal clustering analysis of endothelial cell gene expression following exposure to a conventional radiotherapy dose fraction using Gaussian process clustering

Heinonen, M., Milliat, F., Benadjaoud, M. A., François, A., Buard, V., Tarlet, G., D'Alché-Buc, F. & Guipaud, O., 1 lokakuuta 2018, julkaisussa : PloS one. 13, 10, s. 1-31 e0204960.

Tutkimustuotos: LehtiartikkeliArticleScientificvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
137 Lataukset (Pure)

The human gut microbiome in early-onset type 1 diabetes from the TEDDY study

Vatanen, T., Franzosa, E. A., Schwager, R., Tripathi, S., Arthur, T. D., Vehik, K., Lernmark, Å., Hagopian, W. A., Rewers, M. J., She, J. X., Toppari, J., Ziegler, A. G., Akolkar, B., Krischer, J. P., Stewart, C. J., Ajami, N. J., Petrosino, J. F., Gevers, D., Lähdesmäki, H., Vlamakis, H. & 2 muuta, Huttenhower, C. & Xavier, R. J., 25 lokakuuta 2018, julkaisussa : Nature. 562, 7728, s. 589-594 6 Sivumäärä

Tutkimustuotos: LehtiartikkeliLetterScientificvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
124 Sitaatiot (Scopus)
424 Lataukset (Pure)

Time-resolved transcriptome and proteome landscape of human regulatory T cell (Treg) differentiation reveals novel regulators of FOXP3

Schmidt, A., Marabita, F., Kiani, N. A., Gross, C. C., Johansson, H. J., Éliás, S., Rautio, S., Eriksson, M., Fernandes, S. J., Silberberg, G., Ullah, U., Bhatia, U., Lähdesmäki, H., Lehtiö, J., Gomez-Cabrero, D., Wiendl, H., Lahesmaa, R. & Tegnér, J., 7 toukokuuta 2018, julkaisussa : BMC Biology. 16, 1, s. 1-35 47.

Tutkimustuotos: LehtiartikkeliArticleScientificvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
6 Sitaatiot (Scopus)
177 Lataukset (Pure)

Transcriptional Repressor HIC1 Contributes to Suppressive Function of Human Induced Regulatory T Cells

Ubaid Ullah, U., Andrabi, S. B. A., Tripathi, S. K., Dirasantha, O., Kanduri, K., Rautio, S., Gross, C. C., Lehtimäki, S., Bala, K., Tuomisto, J., Bhatia, U., Chakroborty, D., Elo, L. L., Lähdesmäki, H., Wiendl, H., Rasool, O. & Lahesmaa, R., 20 helmikuuta 2018, julkaisussa : Cell Reports. 22, 8, s. 2094-2106 13 Sivumäärä

Tutkimustuotos: LehtiartikkeliArticleScientificvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
12 Sitaatiot (Scopus)
137 Lataukset (Pure)

Variational zero-inflated Gaussian processes with sparse kernels

Hegde, P., Heinonen, M. & Kaski, S., 2018, 34th Conference on Uncertainty in Artificial Intelligence 2018, UAI 2018. AUAI Press, Vuosikerta 1. s. 361-371 148

Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussaConference contributionScientificvertaisarvioitu

Open access
2017

Acquired Somatic Mutations in T Cells in Patients with Aplastic Anemia and Hypoplastic Myelodysplastic Syndromes

Lundgren, S., Keränen, M., Nousiainen, K., Eldfors, S., Hannula, S., Hannunen, T., Ellonen, P., Walldin, G., Clemente, M., Ebeling, F., Rajala, H., Maciejewski, J. P., Lähdesmäki, H., Hellstrom-Lindberg, E. & Mustjoki, S., 2017, julkaisussa : BLOOD. 130, Suppl 1, s. 1169-1169 1 Sivumäärä

Tutkimustuotos: LehtiartikkeliArticleScientificvertaisarvioitu

A Mutually-Dependent Hadamard Kernel for Modelling Latent Variable Couplings

Remes, S., Heinonen, M. & Kaski, S., marraskuuta 2017, Proceedings of the 9th Asian Conference on Machine Learning. Zhang, M-L. & Noh, Y-K. (toim.). s. 455-470 16 Sivumäärä (Proceedings of Machine Learning Research; Vuosikerta 77).

Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussaConference contributionScientificvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
37 Lataukset (Pure)

Efficient statistical methods for detecting differential methylation

Halla-aho, V. & Lähdesmäki, H., 22 heinäkuuta 2017.

Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussaKonferenssiesitysScientific

Tiedosto
19 Lataukset (Pure)

Genome-wide Analysis of STAT3-Mediated Transcription during Early Human Th17 Cell Differentiation

Tripathi, S. K., Chen, Z., Larjo, A., Kanduri, K., Nousiainen, K., Äijo, T., Ricaño-Ponce, I., Hrdlickova, B., Tuomela, S., Laajala, E., Salo, V., Kumar, V., Wijmenga, C., Lähdesmäki, H. & Lahesmaa, R., 30 toukokuuta 2017, julkaisussa : Cell Reports. 19, 9, s. 1888-1901 14 Sivumäärä

Tutkimustuotos: LehtiartikkeliArticleScientificvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
20 Sitaatiot (Scopus)
154 Lataukset (Pure)

High-throughput automated microfluidic sample preparation for accurate microbial genomics

Kim, S., De Jonghe, J., Kulesa, A. B., Feldman, D., Vatanen, T., Bhattacharyya, R. P., Berdy, B., Gomez, J., Nolan, J., Epstein, S. & Blainey, P. C., 27 tammikuuta 2017, julkaisussa : Nature Communications. 8, s. 1-10 13919.

Tutkimustuotos: LehtiartikkeliArticleScientificvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
40 Sitaatiot (Scopus)
160 Lataukset (Pure)

Metagenomic analyses of the human gut microbiome reveal connections to the immune system

Vatanen, T., 2017, Aalto University. 154 Sivumäärä

Tutkimustuotos: Doctoral ThesisCollection of Articles

Open access

Non-Stationary Spectral Kernels

Remes, S., Heinonen, M. & Kaski, S., 2017, Advances in Neural Information Processing Systems 30: Proceedings of NIPS2017. Curran Associates, Inc., s. 4645-4654 (Advances in Neural Information Processing Systems; Vuosikerta 30).

Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussaConference contributionScientificvertaisarvioitu

Open access
13 Sitaatiot (Scopus)

RNA Polymerase III Subunit POLR3G Regulates Specific Subsets of PolyA+ and SmallRNA Transcriptomes and Splicing in Human Pluripotent Stem Cells

Lund, R. J., Rahkonen, N., Malonzo, M., Kauko, L., Emani, M. R., Kivinen, V., Närvä, E., Kemppainen, E., Laiho, A., Skottman, H., Hovatta, O., Rasool, O., Nykter, M., Lähdesmäki, H. & Lahesmaa, R., 9 toukokuuta 2017, julkaisussa : Stem Cell Reports. 8, 5, s. 1442-1454 13 Sivumäärä

Tutkimustuotos: LehtiartikkeliArticleScientificvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
2 Sitaatiot (Scopus)
103 Lataukset (Pure)

TET2 and 3 proteins control iNKT cell lineage specification and TCR mediated expansion

Tsagaratou, A., Avalos, E. G., Rautio, S., Browne, J. S., Togher, S., Pastor, W., Rothenberg, E. V., Lahdesmaki, H. & Rao, A., 2017, julkaisussa : JOURNAL OF IMMUNOLOGY. 198, 1, Supplement, s. 215.11

Tutkimustuotos: LehtiartikkeliArticleScientificvertaisarvioitu

TET proteins regulate the lineage specification and TCR-mediated expansion of iNKT cells

Tsagaratou, A., González-Avalos, E., Rautio, S., Scott-Browne, J. P., Togher, S., Pastor, W. A., Rothenberg, E. V., Chavez, L., Lähdesmäki, H. & Rao, A., 2017, julkaisussa : NATURE IMMUNOLOGY. 18, 1, s. 45-53

Tutkimustuotos: LehtiartikkeliArticleScientificvertaisarvioitu

46 Sitaatiot (Scopus)
2016

A probabilistic generative model for quantification of DNA modifications enables analysis of demethylation pathways

Äijö, T., Huang, Y., Mannerström, H., Chavez, L., Tsagaratou, A., Rao, A. & Lähdesmäki, H., 14 maaliskuuta 2016, julkaisussa : GENOME BIOLOGY. 17, 1, s. 1-22 49.

Tutkimustuotos: LehtiartikkeliArticleScientificvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
11 Sitaatiot (Scopus)
177 Lataukset (Pure)