Tutkimustuotos

2018

Biosignals reflect pair-dynamics in collaborative work: EDA and ECG study of pair-programming in a classroom environment

Ahonen, L., Cowley, B. U., Hellas, A. & Puolamäki, K., 1 joulukuuta 2018, julkaisussa : Scientific Reports. 8, 1, s. 1-16 3138.

Tutkimustuotos: LehtiartikkeliArticleScientificvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
14 Sitaatiot (Scopus)
144 Lataukset (Pure)

Bottom-Up Attention Guidance for Recurrent Image Recognition

Rezazadegan Tavakoli, H., Borji, A., Anwer, R., Rahtu, E. & Kannala, J., 2018, 2018 IEEE International Conference on Image Processing, ICIP 2018 - Proceedings. IEEE, s. 3004-3008 5 Sivumäärä 8451537

Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussaConference contributionScientificvertaisarvioitu

1 Sitaatiot (Scopus)

Characteristic functions of quantum heat with baths at different temperatures

Aurell, E., 7 kesäkuuta 2018, julkaisussa : Physical Review E. 97, 6, s. 1-9 062117.

Tutkimustuotos: LehtiartikkeliArticleScientificvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
5 Sitaatiot (Scopus)
125 Lataukset (Pure)

Convex Coupled Matrix and tensor completion

Wimalawarne, K., Yamada, M. & Mamitsuka, H., 1 marraskuuta 2018, julkaisussa : Neural Computation. 30, 11, s. 3095-3127 33 Sivumäärä

Tutkimustuotos: LehtiartikkeliLetterScientificvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
3 Sitaatiot (Scopus)
103 Lataukset (Pure)

Correlation-compressed direct-coupling analysis

Gao, C. Y., Zhou, H. J. & Aurell, E., 11 syyskuuta 2018, julkaisussa : Physical Review E. 98, 3, s. 1-15 032407.

Tutkimustuotos: LehtiartikkeliArticleScientificvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
3 Sitaatiot (Scopus)
177 Lataukset (Pure)

Counting Linear Extensions in Practice: MCMC Versus Exponential Monte Carlo

Talvitie, T., Kangas, J-K., Niinimäki, T. & Koivisto, M., 2018, 32nd AAAI Conference on Artificial Intelligence, AAAI 2018. AAAI PRESS, s. 1431-1438 8 Sivumäärä (Proceedings of the AAAI Conference on Artificial Intelligence).

Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussaConference contributionScientificvertaisarvioitu

Open access
2 Sitaatiot (Scopus)

Data Mining for Systems Biology: Methods and Protocols

Mamitsuka, H. (toim.), 1 tammikuuta 2018, 2nd toim. (Methods in Molecular Biology; Vuosikerta 1807)

Tutkimustuotos: KirjaBookProfessional

DeepCaption: PyTorch-based framework for image captioning research using deep learning

Sjöberg, M., Polis, A., Surikuchi, A. & Laaksonen, J., 5 joulukuuta 2018

Tutkimustuotos: Taiteellinen julkaisu ja ICT-julkaisuSoftwareScientific

Deep Transfer Learning of Representations for Differentially Private Learning

Niinimäki, T., Heikkilä, M., Kaski, S. & Honkela, A., 2018.

Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussaKonferenssiesitysScientificvertaisarvioitu

Depression, depressive symptoms and treatments in women who have recently given birth: UK cohort study

Petersen, I., Peltola, T., Kaski, S., Walters, K. R. & Hardoon, S., 24 lokakuuta 2018, julkaisussa : BMJ Open. 8, 10, s. 1-8 8 Sivumäärä, e02215.

Tutkimustuotos: LehtiartikkeliArticleScientificvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
4 Sitaatiot (Scopus)
102 Lataukset (Pure)

Domain Adaptation for Resume Classification Using Convolutional Neural Networks

Sayfullina, L., Malmi, E., Liao, Y. & Jung, A., 2018, Analysis of Images, Social Networks and Texts: 6th International Conference, AIST 2017, Moscow, Russia, July 27--29, 2017, Revised Selected Papers. van der Aalst, W. M. P., Ignatov, D. I., Khachay, M., Kuznetsov, S. O., Lempitsky, V., Lomazova, I. A., Loukachevitch, N., Napoli, A., Panchenko, A., Pardalos, P. M., Savchenko, A. V. & Wasserman, S. (toim.). Cham, s. 82-93 12 Sivumäärä (Lecture Notes in Computer Science; Vuosikerta 10716).

Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussaConference contributionScientificvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
1 Sitaatiot (Scopus)
39 Lataukset (Pure)

DrugE-rank: Predicting drug-target interactions by learning to rank

Deng, J., Yuan, Q., Mamitsuka, H. & Zhu, S., 1 tammikuuta 2018, Methods in Molecular Biology. s. 195-202 8 Sivumäärä (Methods in Molecular Biology; Vuosikerta 1807).

Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussaChapterScientificvertaisarvioitu

1 Sitaatiot (Scopus)

Effect of spatial connectivity on host resistance in a highly fragmented natural pathosystem

Höckerstedt, L. M., Siren, J. P. & Laine, A. L., kesäkuuta 2018, julkaisussa : Journal of Evolutionary Biology. 31, 6, s. 844-852

Tutkimustuotos: LehtiartikkeliArticleScientificvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
1 Sitaatiot (Scopus)
135 Lataukset (Pure)

Efficient Convex Completion of Coupled Tensors using Coupled Nuclear Norms

Wimalawarne, K. & Mamitsuka, H., 2018, s. 6902-6910. 9 Sivumäärä.

Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussaKonferenssiesitysScientificvertaisarvioitu

Efficient differentially private learning improves drug sensitivity prediction

Honkela, A., Das, M., Nieminen, A., Dikmen, O. & Kaski, S., 6 helmikuuta 2018, julkaisussa : BIOLOGY DIRECT. 13, 1, s. 1-12

Tutkimustuotos: LehtiartikkeliArticleScientificvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
4 Sitaatiot (Scopus)
119 Lataukset (Pure)

ELFI: Engine for likelihood-free inference

Lintusaari, J., Vuollekoski, H., Kangasrääsiö, A., Skytén, K., Järvenpää, M., Marttinen, P., Gutmann, M. U., Vehtari, A., Corander, J. & Kaski, S., 1 elokuuta 2018, julkaisussa : Journal of Machine Learning Research. 19, s. 1-7 7 Sivumäärä

Tutkimustuotos: LehtiartikkeliArticleScientificvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
8 Sitaatiot (Scopus)
45 Lataukset (Pure)

Factor Analysis on a Graph

Karasuyama, M. & Mamitsuka, H., 2018, Proceedings of the Twenty-First International Conference on Artificial Intelligence and Statistics. Storkey, A. & Perez-Cruz, F. (toim.). s. 1117-1126 (Proceedings of Machine Learning Research; Vuosikerta 84).

Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussaConference contributionScientificvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
2 Lataukset (Pure)

Film mood and its quantitative determinants in different types of scenes

Tarvainen, J., Laaksonen, J. & Takala, T., 8 tammikuuta 2018, julkaisussa : IEEE Transactions on Affective Computing.

Tutkimustuotos: LehtiartikkeliArticleScientificvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
1 Sitaatiot (Scopus)
143 Lataukset (Pure)

Gaussian process modelling in approximate bayesian computation to estimate horizontal gene transfer in Bacteria

Järvenpää, M., Gutmann, M. U., Vehtari, A. K. I. & Marttinen, P., 1 joulukuuta 2018, julkaisussa : Annals of Applied Statistics. 12, 4, s. 2228-2251 24 Sivumäärä

Tutkimustuotos: LehtiartikkeliArticleScientificvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
6 Sitaatiot (Scopus)
112 Lataukset (Pure)

Gaussian Process Modelling of Genome-wide High-throughput Sequencing Time Series

Topa, H., 2018, Aalto University. 186 Sivumäärä

Tutkimustuotos: Doctoral ThesisCollection of Articles

Open access

Global Estimates of Errors in Quantum Computation by the Feynman–Vernon Formalism

Aurell, E., 2018, julkaisussa : Journal of Statistical Physics. 171, 5, s. 745–767 23 Sivumäärä

Tutkimustuotos: LehtiartikkeliArticleScientificvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
4 Sitaatiot (Scopus)
123 Lataukset (Pure)

GOLabeler: Improving sequence-based large-scale protein function prediction by learning to rank

You, R., Zhang, Z., Xiong, Y., Sun, F., Mamitsuka, H. & Zhu, S., 15 heinäkuuta 2018, julkaisussa : Bioinformatics. 34, 14, s. 2465-2473 9 Sivumäärä

Tutkimustuotos: LehtiartikkeliArticleScientificvertaisarvioitu

25 Sitaatiot (Scopus)

Image and Video Captioning with Augmented Neural Architectures

Shetty, R., Rezazadegan Tavakoli, H. & Laaksonen, J., 2018, julkaisussa : IEEE Multimedia. 25, 2, s. 34-46 13 Sivumäärä

Tutkimustuotos: LehtiartikkeliArticleScientificvertaisarvioitu

Improving genomics-based predictions for precision medicine through active elicitation of expert knowledge

Sundin, I., Peltola, T., Micallef, L., Afrabandpey, H., Soare, M., Majumder, M. M., Daee, P., He, C., Serim, B., Havulinna, A., Heckman, C., Jacucci, G., Marttinen, P. & Kaski, S., 27 kesäkuuta 2018, julkaisussa : Bioinformatics. 34, 13, s. i395-i403

Tutkimustuotos: LehtiartikkeliArticleScientificvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
2 Sitaatiot (Scopus)
81 Lataukset (Pure)

Information Visualization Evaluation Using Crowdsourcing

Borgo, R., Micallef, L., Bach, B., McGee, F. & Lee, B., 2018, julkaisussa : Computer Graphics Forum. 37, 3, s. 573-595 23 Sivumäärä

Tutkimustuotos: LehtiartikkeliReview ArticleScientificvertaisarvioitu

13 Sitaatiot (Scopus)

Interactive Intent Modeling for Exploratory Search

Ruotsalo, T., Peltonen, J., Eugster, M. JA., Glowacka, D., Floréen, P., Myllymäki, P., Jacucci, G. & Kaski, S., 2018, julkaisussa : ACM TRANSACTIONS ON INFORMATION SYSTEMS. 36, 4, s. 1-46 44.

Tutkimustuotos: LehtiartikkeliArticleScientificvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
11 Sitaatiot (Scopus)
21 Lataukset (Pure)

Interactive visual data exploration with subjective feedback: An information-theoretic approach

Puolamaki, K., Oikarinen, E., Kang, B., Lijffijt, J. & De Bie, T., 24 lokakuuta 2018, Proceedings of the 34th IEEE International Conference on Data Engineering (ICDE 2018). IEEE, s. 1212-1215 4 Sivumäärä 8509333

Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussaConference contributionScientificvertaisarvioitu

4 Sitaatiot (Scopus)

Inverse finite-size scaling for high-dimensional significance analysis

Xu, Y., Puranen, S., Corander, J. & Kabashima, Y., 6 kesäkuuta 2018, julkaisussa : Physical Review E. 97, 6, s. 1-9 062112.

Tutkimustuotos: LehtiartikkeliArticleScientificvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
3 Sitaatiot (Scopus)
161 Lataukset (Pure)

Inverse reinforcement learning from summary data

Kangasrääsiö, A. & Kaski, S., syyskuuta 2018, julkaisussa : Machine Learning. 107, 8-10, s. 1517–1535

Tutkimustuotos: LehtiartikkeliArticleScientificvertaisarvioitu

Open access
3 Sitaatiot (Scopus)

Likelihood-free inference via classification

Gutmann, M. U., Dutta, R., Kaski, S. & Corander, J., 2018, julkaisussa : STATISTICS AND COMPUTING. 28, 2, s. 411–425 15 Sivumäärä

Tutkimustuotos: LehtiartikkeliArticleScientificvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
20 Sitaatiot (Scopus)
229 Lataukset (Pure)

Local Interpretable Model-agnostic Explanations of Bayesian Predictive Models via Kullback-Leibler Projections

Peltola, T., 13 heinäkuuta 2018.

Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussaAbstractScientificvertaisarvioitu

Machine Learning Methods for Interactive Search Interfaces and Cognitive Models

Kangasrääsiö, A., 2018, Aalto University. 205 Sivumäärä

Tutkimustuotos: Doctoral ThesisCollection of Articles

Open access

Maternal Depressive Symptoms During the Pre- and Postnatal Periods and Infant Attention to Emotional Faces

Kataja, E. L., Karlsson, L., Leppänen, J. M., Pelto, J., Häikiö, T., Nolvi, S., Pesonen, H., Parsons, C. E., Hyönä, J. & Karlsson, H., 1 tammikuuta 2018, julkaisussa : CHILD DEVELOPMENT. 16 Sivumäärä

Tutkimustuotos: LehtiartikkeliArticleScientificvertaisarvioitu

6 Sitaatiot (Scopus)

MediaEval 2018: Predicting Media Memorability

Cohendet, R., Demarty, C-H., Duong, N. Q. K., Sjöberg, M., Ionescu, B. & Do, T. T., 2018, MediaEval 2018 - Multimedia Benchmark Workshop: Working Notes Proceedings of the MediaEval 2018 Workshop, Sophia, Antipolis, France, 29-31 October 2018. CEUR, 3 Sivumäärä (CEUR Workshop Proceedings; Vuosikerta 2283).

Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussaConference contributionScientificvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
21 Lataukset (Pure)

MeSHLabeler and DeepMeSH: Recent progress in large-scale MeSH indexing

Peng, S., Mamitsuka, H. & Zhu, S., 1 tammikuuta 2018, Methods in Molecular Biology. s. 203-209 7 Sivumäärä (Methods in Molecular Biology; Vuosikerta 1807).

Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussaChapterScientificvertaisarvioitu

1 Sitaatiot (Scopus)

Modelling User's Theory of AI's Mind in Interactive Intelligent Systems

Peltola, T., Celikok, M., Daee, P. & Kaski, S., 11 syyskuuta 2018, (Jätetty) julkaisussa : arXiv.org. s. 1-18 18 Sivumäärä

Tutkimustuotos: LehtiartikkeliArticleScientific

On the number of connected sets in bounded degree graphs

Kangas, K., Kaski, P., Korhonen, J. H. & Koivisto, M., 1 tammikuuta 2018, julkaisussa : Electronic Journal of Combinatorics. 25, 4, s. 1-19 #P4.34.

Tutkimustuotos: LehtiartikkeliArticleScientificvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
80 Lataukset (Pure)

Peace of mind and anxiety in the waking state are related to the affective content of dreams

Sikka, P., Pesonen, H. & Revonsuo, A., 1 joulukuuta 2018, julkaisussa : Scientific Reports. 8, 1, s. 1-13 12762.

Tutkimustuotos: LehtiartikkeliArticleScientificvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
6 Sitaatiot (Scopus)
125 Lataukset (Pure)

Phenotype-driven identification of epithelial signalling clusters

Marques, E., Peltola, T., Kaski, S. & Klefström, J., 5 maaliskuuta 2018, julkaisussa : Scientific Reports. 8, 1, s. 1-13 4034.

Tutkimustuotos: LehtiartikkeliArticleScientificvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
1 Sitaatiot (Scopus)
145 Lataukset (Pure)

PicSOM Content-Based Information Retrieval System: software source release version 0.37

Laaksonen, J., 17 joulukuuta 2018

Tutkimustuotos: Taiteellinen julkaisu ja ICT-julkaisuSoftwareScientific

PicSOM Experiments in TRECVID 2018

Sjöberg, M., Tavakoli, H. R., Xu, Z., Mantecón, H. L. & Laaksonen, J., 1 marraskuuta 2018, Proceedings of the TRECVID 2018 Workshop. Gaithersburg, MD, USA

Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussaConference contributionProfessional

Open access
Tiedosto
9 Lataukset (Pure)

Prediction of Multiple-Trait and Multiple-Environment Genomic Data Using Recommender Systems

Montesinos-López, O. A., Montesinos-López, A., Crossa, J., Montesinos-López, J. C., Mota-Sanchez, D., Estrada-González, F., Gillberg, J., Singh, R., Mondal, S. & Juliana, P., 1 tammikuuta 2018, julkaisussa : G3: Genes, Genomes, Genetics. 8, 1, s. 131-147

Tutkimustuotos: LehtiartikkeliArticleScientificvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
9 Sitaatiot (Scopus)
165 Lataukset (Pure)

Preface

Mamitsuka, H., 1 tammikuuta 2018, Data Mining for Systems Biology: Methods and Protocols. 2 toim. s. v-vi (Methods in Molecular Biology; Vuosikerta 1807).

Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussaForeword / postscriptScientificvertaisarvioitu

Probabilistic Formulation of the Take The Best Heuristic

Peltola, T., Jokinen, J. & Kaski, S., 2018, CogSci 2018 Proceedings . COGNITIVE SCIENCE SOCIETY, s. 2214-2219

Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussaConference contributionScientificvertaisarvioitu

Rethinking Summarization and Storytelling for Modern Social Multimedia

Rudinac, S., Chua, T. S., Diaz-Ferreyra, N., Friedland, G., Gornostaja, T., Huet, B., Kaptein, R., Lindén, K., Moens, M. F., Peltonen, J., Redi, M., Schedl, M., Shamma, D. A., Smeaton, A. & Xie, L., 1 tammikuuta 2018, MultiMedia Modeling - 24th International Conference, MMM 2018, Proceedings. Schoeffmann, K., Gabbouj, M., O'Connor, N. E., Elgammal, A., Chalidabhongse, T. H., Aramvith, S., Ngo, C. W. & Ho, Y-S. (toim.). s. 632-644 13 Sivumäärä (Lecture Notes in Computer Science (including subseries Lecture Notes in Artificial Intelligence and Lecture Notes in Bioinformatics); Vuosikerta 10704 LNCS).

Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussaConference contributionScientificvertaisarvioitu

3 Sitaatiot (Scopus)

SiBIC: A tool for generating a network of biclusters captured by maximal frequent itemset mining

Takahashi, K. I., duVerle, D. A., Yotsukura, S., Takigawa, I. & Mamitsuka, H., 1 tammikuuta 2018, Methods in Molecular Biology. s. 95-111 17 Sivumäärä (Methods in Molecular Biology; Vuosikerta 1807).

Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussaChapterScientificvertaisarvioitu

SIMPLE Sparse Interaction Model over Peaks of moLEcules for fast, interpretable metabolite identification from tandem mass spectra

Nguyen, D. H., Nguyen, C. H. & Mamitsuka, H., 1 heinäkuuta 2018, julkaisussa : Bioinformatics. 34, 13, s. i323-i332 10 Sivumäärä

Tutkimustuotos: LehtiartikkeliArticleScientificvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
5 Sitaatiot (Scopus)
49 Lataukset (Pure)

Subjectively Interesting Subgroup Discovery on Real-valued Targets

Lijffijt, J., Kang, B., Duivesteijn, W., Puolamäki, K., Oikarinen, E. & De Bie, T., 2018, Proceedings of the 34th IEEE International Conference on Data Engineering (ICDE 2018). IEEE, s. 1356-1359 4 Sivumäärä 8509369

Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussaConference contributionScientificvertaisarvioitu

1 Sitaatiot (Scopus)

SuperDCA for genome-wide epistasis analysis

Puranen, S., Pesonen, M., Pensar, J., Xu, Y., Lees, J. A., Bentley, S., Croucher, N. J. & Corander, J., 29 toukokuuta 2018, julkaisussa : Microbial Genomics. 4, 6

Tutkimustuotos: LehtiartikkeliArticleScientificvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
8 Sitaatiot (Scopus)
23 Lataukset (Pure)

Supervised low rank indefinite kernel approximation using minimum enclosing balls

Schleif, F. M., Gisbrecht, A. & Tino, P., 27 marraskuuta 2018, julkaisussa : Neurocomputing. 318, s. 213-226 14 Sivumäärä

Tutkimustuotos: LehtiartikkeliArticleScientificvertaisarvioitu

3 Sitaatiot (Scopus)