Professorship Kaski S.

Yksikkö: Tutkimusryhmä

Tutkimustuotokset

  1. 2017
  2. Julkaistu

    Steady diffusion in a drift field: A comparison of large-deviation techniques and multiple-scale analysis

    Aurell, E. & Bo, S., 27 syyskuuta 2017, julkaisussa : Physical Review E. 96, 3, s. 1-12 032140.

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkeli

  3. Julkaistu

    MediSyn: Uncertainty-aware Visualization of Multiple Biomedical Datasets to Support Drug Treatment Selection

    He, C., Micallef, L., Tanoli, Z-U-R., Kaski, S., Aittokallio, T. & Jacucci, G., 13 syyskuuta 2017, julkaisussa : BMC Bioinformatics. 18, s. 1-12 393.

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkeli

  4. Julkaistu

    Fixation Prediction in Videos using Unsupervised Hierarchical Features

    Wang, J., Rezazadegan Tavakoli, H. & Laaksonen, J., 22 elokuuta 2017, Proceedings - 30th IEEE Conference on Computer Vision and Pattern Recognition Workshops, CVPRW 2017. IEEE, s. 2225-2232 8 Sivumäärä 8015010. (IEEE Computer Society Conference on Computer Vision and Pattern Recognition workshops).

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussavertaisarvioitu

  5. Julkaistu

    Visualizing activity traces to support collaborative literature searching

    Athukorala, K., Micallef, L., An, C., Reijonen, A., Peltonen, J., Ruotsalo, T. & Jacucci, G., 14 elokuuta 2017, VINCI 2017 - 10th International Symposium on Visual Information Communication and Interaction. ACM, s. 45-52 8 Sivumäärä

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussavertaisarvioitu

  6. Julkaistu

    Convex factorization machine for toxicogenomics prediction

    Yamada, M., Lian, W., Goyal, A., Chen, J., Wimalawarne, K., Khan, S. A., Kaski, S., Mamitsuka, H. & Chang, Y., 13 elokuuta 2017, KDD 2017 - Proceedings of the 23rd ACM SIGKDD International Conference on Knowledge Discovery and Data Mining. ACM, s. 1215-1224 10 Sivumäärä

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussavertaisarvioitu

  7. Julkaistu

    Localized Lasso for High-Dimensional Regression

    Yamada, M., Koh, T., Iwata, T., Shawe-Taylor, J. & Kaski, S., 1 elokuuta 2017, Proceedings of the 20th International Conference on Artificial Intelligence and Statistics. Singh, A. & Zhu, J. (toim.). Fort Lauderdale, FL, USA, s. 325-333 9 Sivumäärä (Proceedings of Machine Learning Research; painos 54).

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussavertaisarvioitu

  8. Julkaistu

    Systematic identification of feature combinations for predicting drug response with Bayesian multi-view multi-task linear regression

    Ammad-Ud-Din, M., Khan, S. A., Wennerberg, K. & Aittokallio, T., 15 heinäkuuta 2017, julkaisussa : Bioinformatics. 33, 14, s. i359-i368

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkeli

  9. Julkaistu

    Knowledge elicitation via sequential probabilistic inference for high-dimensional prediction

    Daee, P., Peltola, T., Soare, M. & Kaski, S., 12 heinäkuuta 2017, julkaisussa : Machine Learning. 106, 9, s. 1599-1620 22 Sivumäärä

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkeli

  10. Julkaistu

    Interactive Prior Elicitation of Feature Similarities for Small Sample Size Prediction

    Afrabandpey, H., Peltola, T. & Kaski, S., 10 heinäkuuta 2017, Proceedings of the 25th Conference on User Modeling, Adaptation and Personalization . Bratislava, Slovakia: ACM, s. 265-269 4 Sivumäärä

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussavertaisarvioitu

  11. Julkaistu

    A transcriptomics data-driven gene space accurately predicts liver cytopathology and drug-induced liver injury

    Kohonen, P., Parkkinen, J. A., Willighagen, E. L., Ceder, R., Wennerberg, K., Kaski, S. & Grafström, R. C., 3 heinäkuuta 2017, julkaisussa : Nature Communications. 8, s. 1-15 15932.

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkeli

  12. Julkaistu

    An Information Retrieval Approach for Finding Dependent Subspaces of Multiple Views

    Lin, Z. & Peltonen, J., heinäkuuta 2017, Machine Learning and Data Mining in Pattern Recognition: 13th International Conference, MLDM 2017 New York, NY, USA, July 15 – 20, 2017, Proceedings. Perner, P. (toim.). s. 1-16 15 Sivumäärä (Lecture Notes in Computer Science; nro 10358).

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussavertaisarvioitu

  13. Julkaistu

    Image pseudo tag generation with Deep Boltzmann machine anc topic-concept similarity map

    Ishikawa, S., Laaksonen, J. & Karhunen, J., 30 kesäkuuta 2017, 2017 International Joint Conference on Neural Networks, IJCNN 2017 - Proceedings. IEEE, s. 1305-1312 8 Sivumäärä 7966003

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussavertaisarvioitu

  14. Julkaistu

    Understanding quantitative determinants of film mood in different types of scenes

    Tarvainen, J., Laaksonen, J. & Takala, T., 13 kesäkuuta 2017.

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussavertaisarvioitu

  15. Julkaistu

    TEX-Nets: Binary patterns encoded convolutional neural networks for texture recognition

    Anwer, R. M., Khan, F. S., van de Weijer, J. & Laaksonen, J., 6 kesäkuuta 2017, ICMR 2017 - Proceedings of the 2017 ACM International Conference on Multimedia Retrieval. ACM, s. 125-132 8 Sivumäärä

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussavertaisarvioitu

  16. Julkaistu

    VisualLabel: An Integrated Multimedia Content Management and Access Framework

    Ahmad, I., Rantanen, P., Sillberg, P., Laaksonen, J., Liu, S., Forss, T., Malik, A., Nieminen, M., Shetty, R., Ishikawa, S. & 4 muuta, Kallio, J., Saarinen, J. P., Gabbouj, M. & Soini, J., 5 kesäkuuta 2017, The Proceedings of the 27th International Conference on Information Modelling and Knowledge Bases, EJC 2017. Sornlertlamvanich, V., Chawakitchareon, P., Hansuebsai, A., Koopipat, C., Kiyoki, Y., Kangassalo, H., Thalheim, B. & Yoshida, N. (toim.). Thailand, s. 332-353 22 Sivumäärä

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussavertaisarvioitu

  17. Julkaistu

    Cavity master equation for the continuous time dynamics of discrete-spin models

    Aurell, E., Del Ferraro, G., Dominguez, E. & Mulet, R., 12 toukokuuta 2017, julkaisussa : Physical Review E. 95, 5, s. 1-14 14 Sivumäärä, 052119.

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkeli

  18. Julkaistu

    Inferring Cognitive Models from Data using Approximate Bayesian Computation

    Kangasrääsiö, A., Athukorala, K., Howes, A., Corander, J., Kaski, S. & Oulasvirta, A., 9 toukokuuta 2017, Proceedings of the 2017 CHI Conference on Human Factors in Computing Systems. ACM, s. 1295-1306 12 Sivumäärä

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussavertaisarvioitu

  19. Julkaistu

    Multi-view kernel completion

    Bhadra, S., Kaski, S. & Rousu, J., toukokuuta 2017, julkaisussa : Machine Learning. 106, 5, s. 713–739

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkeli

  20. Julkaistu

    Landscape of RNA polyadenylation in E. coli

    Maes, A., Gracia, C., Innocenti, N., Zhang, K., Aurell, E. & Hajnsdorf, E., 17 maaliskuuta 2017, julkaisussa : Nucleic Acids Research. 45, 5, s. 2746-2756 11 Sivumäärä

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkeli

  21. Julkaistu

    BCI for physiological text annotation

    Barral, O., Kosunen, I., Ruotsalo, T., Spapé, M. M., Eugster, M. J. A., Ravaja, N., Kaski, S. & Jacucci, G., 13 maaliskuuta 2017, BCIforReal 2017 - Proceedings of the 2017 ACM Workshop on An Application-Oriented Approach to BCI Out of the Laboratory, co-located with IUI 2017. ACM, s. 9-13 5 Sivumäärä

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussavertaisarvioitu

  22. Julkaistu

    Improving search result comprehension by topic-relevance map visualization

    Peltonen, J., Belorustceva, K. & Ruotsalo, T., 7 maaliskuuta 2017, IUI 2017 - Companion of the 22nd International Conference on Intelligent User Interfaces. ACM, s. 149-152 4 Sivumäärä

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussavertaisarvioitu

  23. Julkaistu

    Interactive Elicitation of Knowledge on Feature Relevance Improves Predictions in Small Data Sets

    Micallef, L., Sundin, I., Marttinen, P., Ammad-Ud-Din, M., Peltola, T., Soare, M., Jacucci, G. & Kaski, S., 7 maaliskuuta 2017, IUI 2017 - Proceedings of the 22nd International Conference on Intelligent User Interfaces. ACM, s. 547-552 6 Sivumäärä

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussavertaisarvioitu

  24. Julkaistu

    Negative relevance feedback for exploratory search with visual interactive intent modeling

    Peltonen, J., Strahl, J. & Floréen, P., 7 maaliskuuta 2017, IUI 2017 - Proceedings of the 22nd International Conference on Intelligent User Interfaces. ACM, s. 149-159 11 Sivumäärä

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussavertaisarvioitu

  25. Julkaistu

    Topic-relevance map: Visualization for improving search result comprehension

    Peltonen, J., Belorustceva, K. & Ruotsalo, T., 7 maaliskuuta 2017, IUI 2017 - Proceedings of the 22nd International Conference on Intelligent User Interfaces. ACM, s. 611-622 12 Sivumäärä

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussavertaisarvioitu

  26. Julkaistu

    Cluster analysis to estimate the risk of preeclampsia in the high-risk Prediction and Prevention of Preeclampsia and Intrauterine Growth Restriction (PREDO) study

    Villa, P. M., Marttinen, P., Gillberg, J., Inkeri Lokki, A., Majander, K., Ordén, M. R., Taipale, P., Pesonen, A., Räikkönen, K., Hämäläinen, E. & 2 muuta, Kajantie, E. & Laivuori, H., 1 maaliskuuta 2017, julkaisussa : PloS one. 12, 3, s. 1-14 e0174399.

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkeli

  27. Julkaistu

    Interacting networks of resistance, virulence and core machinery genes identified by genome-wide epistasis analysis

    Skwark, M. J., Croucher, N. J., Puranen, S., Chewapreecha, C., Pesonen, M., Xu, Y., Turner, P., Harris, S. R., Beres, S. B., Musser, J. M. & 4 muuta, Parkhill, J., Bentley, S. D., Aurell, E. & Corander, J., 1 helmikuuta 2017, julkaisussa : PLoS Genetics. 13, 2, e1006508.

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkeli

  28. Julkaistu

    Regression with n → 1 by expert knowledge elicitation

    Soare, M., Ammad-Ud-din, M. & Kaski, S., 31 tammikuuta 2017, Proceedings - 2016 15th IEEE International Conference on Machine Learning and Applications, ICMLA 2016. IEEE, s. 734-739 6 Sivumäärä 7838235

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussavertaisarvioitu

  29. Julkaistu

    Parallel coordinate plots for neighbor retrieval

    Peltonen, J. & Lin, Z., 1 tammikuuta 2017, Proceedings of the 12th International Joint Conference on Computer Vision, Imaging and Computer Graphics Theory and Applications. Vuosikerta 3. s. 40-51 12 Sivumäärä

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussavertaisarvioitu

  30. Julkaistu

    Visual Interaction with Dimensionality Reduction: A Structured Literature Analysis

    Sacha, D., Zhang, L., Sedlmair, M., Lee, J. A., Peltonen, J., Weiskopf, D., North, S. C. & Keim, D. A., 1 tammikuuta 2017, julkaisussa : IEEE Transactions on Visualization and Computer Graphics. 23, 1, s. 241-250 10 Sivumäärä, 7536217.

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkeli

  31. Julkaistu

    A Community Challenge for Inferring Genetic Predictors of Gene Essentialities through Analysis of a Functional Screen of Cancer Cell Lines

    Gönen, M., Weir, B. A., Cowley, G. S., Vazquez, F., Guan, Y., Jaiswal, A., Karasuyama, M., Uzunangelov, V., Wang, T., Tsherniak, A. & 35 muuta, Howell, S., Marbach, D., Hoff, B., Norman, T. C., Airola, A., Bivol, A., Bunte, K., Carlin, D., Chopra, S., Deran, A., Ellrott, K., Gopalacharyulu, P., Graim, K., Kaski, S., Khan, S. A., Newton, Y., Ng, S., Pahikkala, T., Paull, E., Sokolov, A., Tang, H., Tang, J., Wennerberg, K., Xie, Y., Zhan, X., Zhu, F., Aittokallio, T., Mamitsuka, H., Stuart, J. M., Boehm, J. S., Root, D. E., Xiao, G., Stolovitzky, G., Hahn, W. C. & Margolin, A. A., 2017, julkaisussa : Cell Systems. 5, 5, s. 485-497

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkeli

  32. Julkaistu

    Adaptive edge weighting for graph-based learning algorithms

    Karasuyama, M. & Mamitsuka, H., 2017, julkaisussa : Machine Learning. 106, 2, s. 307-335

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkeli

  33. Julkaistu

    Bacmeta: simulation for genomic evolution in bacterial metapopulations

    Sipola, A., Marttinen, P. & Corander, J., 2017, julkaisussa : bioRxiv.

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkeli

  34. Julkaistu

    Bayes Forest: A data-intensive generator of morphological tree clones

    Potapov, I., Järvenpää, M., Åkerblom, M., Raumonen, P. & Kaasalainen, M., 2017, julkaisussa : GigaScience. 6, 10, s. 1-13 gix079.

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkeli

  35. Julkaistu

    Differentially Private Bayesian Learning on Distributed Data

    Heikkilä, M., Lagerspetz, E., Kaski, S., Shimizu, K., Tarkoma, S. & Honkela, A., 2017, Advances in Neural Information Processing Systems 30: Proceedings of NIPS 2017. Curran Associates, Inc., s. 3227-3236 10 Sivumäärä (Advances in Neural Information Processing Systems; painos 30).

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussavertaisarvioitu

  36. Julkaistu

    Digital Me: Controlling and Making Sense of My Digital Footprint

    Sjöberg, M., Chen, H-H., Floreen, P., Koskela, M., Kuikkaniemi, K., Lehtiniemi, T. & Peltonen, J., 2017, Symbiotic Interaction: 5th International Workshop, Symbiotic 2016, Padua, Italy, September 29–30, 2016, Revised Selected Papers. Gamberini, L., Spagnolli, A., Jacucci, G., Blankertz, B. & Freeman, J. (toim.). Cham, s. 155-167 (Lecture Notes in Computer Science; painos 9961).

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussavertaisarvioitu

  37. Julkaistu

    ELFI, a software package for likelihood-free inference

    Lintusaari, J., Vuollekoski, H., Kangasrääsiö, A., Skyten, K., Järvenpää, M., Gutmann, M., Vehtari, A., Corander, J. & Kaski, S., 2017.

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussaKonferenssiesitys

  38. Julkaistu
  39. Julkaistu
  40. Julkaistu
  41. Julkaistu
  42. Julkaistu

    Modelling Human Decision-making based on Aggregate Observation Data

    Kangasrääsiö, A. & Kaski, S., 2017, Human In The Loop-ML Workshop at ICML. Sydney, 4 Sivumäärä

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussa

  43. Julkaistu

    Non-Stationary Spectral Kernels

    Remes, S., Heinonen, M. & Kaski, S., 2017, Advances in Neural Information Processing Systems 30: Proceedings of NIPS2017. Curran Associates, Inc., s. 4645-4654 (Advances in Neural Information Processing Systems; painos 30).

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussavertaisarvioitu

  44. Julkaistu

    Paying Attention to Descriptions Generated by Image Captioning Models

    Rezazadegan Tavakoli, H., Shetty, R., Borji, A. & Laaksonen, J., 2017, Proceedings - 2017 IEEE International Conference on Computer Vision, ICCV 2017. IEEE, s. 2506-2515 8237534. (IEEE International Conference on Computer Vision).

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussavertaisarvioitu

  45. Julkaistu

    Resolving outbreak dynamics using Approximate Bayesian Computation for stochastic birth-death models

    Lintusaari, J., Blomstedt, P., Sivula, T., Gutmann, M. U., Kaski, S. & Corander, J., 2017, julkaisussa : bioRxiv. 11 Sivumäärä

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkeli

  46. Julkaistu

    Saliency Revisited: Analysis of Mouse Movements versus Fixations

    Rezazadegan Tavakoli, H., Ahmed, F., Borji, A. & Laaksonen, J., 2017, 2017 IEEE Conference on Computer Vision and Pattern Recognition (CVPR) . IEEE, s. 6354-6362 (IEEE Conference on Computer Vision and Pattern Recognition).

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussavertaisarvioitu

  47. Julkaistu

    Scale coding bag of deep features for human attribute and action recognition

    Khan, F. S., van de Weijer, J., Anwer, R. M., Bagdanov, A. D., Felsberg, M. & Laaksonen, J., 2017, julkaisussa : MACHINE VISION AND APPLICATIONS. 29, 1, s. 55–71 17 Sivumäärä

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkeli

  48. Julkaistu

    The Mixing of Markov Chains on Linear Extensions in Practice

    Talvitie, T., Niinimäki, T. & Koivisto, M., 2017, Proceedings of the Twenty-Sixth International Joint Conference on Artificial Intelligence (IJCAI-17). Sierra, C. (toim.). s. 524-530

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussavertaisarvioitu

  49. Julkaistu

    Top-down deep appearance attention for action recognition

    Anwer, R. M., Khan, F. S., van de Weijer, J. & Laaksonen, J., 2017, Image Analysis - 20th Scandinavian Conference, SCIA 2017, Proceedings. Springer-Verlag, s. 297-309 13 Sivumäärä (Lecture Notes in Computer Science (including subseries Lecture Notes in Artificial Intelligence and Lecture Notes in Bioinformatics); painos 10269 LNCS).

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussavertaisarvioitu

  50. Julkaistu

    Uni- and multimodal methods for single- and multi-label recognition

    Ishikawa, S. & Laaksonen, J., 2017, julkaisussa : Multimedia Tools and Applications. 76, 21, s. 22405–22423 19 Sivumäärä

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkeli

  51. 2016
  52. Julkaistu

    ELFI: Engine for Likelihood-Free Inference

    Kangasrääsiö, A., Lintusaari, J., Skyten, K., Järvenpää, M., Vuollekoski, H., Gutmann, M., Vehtari, A., Corander, J. & Kaski, S., 9 joulukuuta 2016. 4 Sivumäärä.

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussaKonferenssiesitys

ID: 4319430