Professorship Kaski S.

Yksikkö: Tutkimusryhmä

Tutkimustuotokset

  1. 2018
  2. Julkaistu

    A Combined PLS and Negative Binomial Regression Model for Inferring Association Networks from Next-generation Sequencing Count Data

    Pesonen, M., Nevalainen, J., Potter, S., Datta, S. & Datta, S., 1 toukokuuta 2018, julkaisussa : IEEE-ACM TRANSACTIONS ON COMPUTATIONAL BIOLOGY AND BIOINFORMATICS. 15, 3, s. 760-773 14 Sivumäärä

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  3. Julkaistu

    Unified picture of strong-coupling stochastic thermodynamics and time reversals

    Aurell, E., 9 huhtikuuta 2018, julkaisussa : Physical Review E. 97, 4, s. 1-10 042112.

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  4. Julkaistu

    Binary patterns encoded convolutional neural networks for texture recognition and remote sensing scene classification

    Anwer, R. M., Khan, F. S., van de Weijer, J., Molinier, M. & Laaksonen, J., 1 huhtikuuta 2018, julkaisussa : ISPRS Journal of Photogrammetry and Remote Sensing. 138, s. 74-85 12 Sivumäärä

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  5. Julkaistu

    Approximate message passing for nonconvex sparse regularization with stability and asymptotic analysis

    Sakata, A. & Xu, Y., 13 maaliskuuta 2018, julkaisussa : Journal of Statistical Mechanics: Theory and Experiment. 2018, 3, s. 1-35 033404.

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  6. Julkaistu

    User Modelling for Avoiding Overfitting in Interactive Knowledge Elicitation for Prediction

    Daee, P., Peltola, T., Vehtari, A. & Kaski, S., 8 maaliskuuta 2018, IUI 2018 - Proceedings of the 23rd International Conference on Intelligent User Interfaces. ACM, s. 305-310 6 Sivumäärä

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussavertaisarvioitu

  7. Julkaistu

    Phenotype-driven identification of epithelial signalling clusters

    Marques, E., Peltola, T., Kaski, S. & Klefström, J., 5 maaliskuuta 2018, julkaisussa : Scientific Reports. 8, 1, s. 1-13 4034.

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  8. Julkaistu

    Efficient differentially private learning improves drug sensitivity prediction

    Honkela, A., Das, M., Nieminen, A., Dikmen, O. & Kaski, S., 6 helmikuuta 2018, julkaisussa : BIOLOGY DIRECT. 13, 1, s. 1-12

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  9. Julkaistu

    Film mood and its quantitative determinants in different types of scenes

    Tarvainen, J., Laaksonen, J. & Takala, T., 8 tammikuuta 2018, julkaisussa : IEEE Transactions on Affective Computing.

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  10. Julkaistu

    A conceptual framework for personalization of indoor comfort parameters based on office workers’ preferences

    Mirzaeifar, S., Daee, P. & Singh, V., 1 tammikuuta 2018, Product Lifecycle Management to Support Industry 4.0 - 15th IFIP WG 5.1 International Conference, PLM 2018, Proceedings. Ríos, J., Noël, F., Chiabert, P. & Bouras, A. (toim.). s. 35-45 11 Sivumäärä (IFIP Advances in Information and Communication Technology; painos 540).

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussavertaisarvioitu

  11. Julkaistu

    Author Tree-Structured Hierarchical Dirichlet Process

    Alam, M. H., Peltonen, J., Nummenmaa, J. & Järvelin, K., 1 tammikuuta 2018, Discovery Science - 21st International Conference, DS 2018, Proceedings. Ceci, M., Soldatova, L., Vanschoren, J. & Papadopoulos, G. (toim.). s. 311-327 17 Sivumäärä (Lecture Notes in Computer Science (including subseries Lecture Notes in Artificial Intelligence and Lecture Notes in Bioinformatics); painos 11198 LNAI).

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussavertaisarvioitu

  12. Julkaistu

    Data Mining for Systems Biology: Methods and Protocols

    Mamitsuka, H. (toim.), 1 tammikuuta 2018, 2nd toim. (Methods in Molecular Biology; painos 1807)

    Tutkimustuotos: Kirja

  13. Julkaistu

    DrugE-rank: Predicting drug-target interactions by learning to rank

    Deng, J., Yuan, Q., Mamitsuka, H. & Zhu, S., 1 tammikuuta 2018, Methods in Molecular Biology. s. 195-202 8 Sivumäärä (Methods in Molecular Biology; painos 1807).

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussavertaisarvioitu

  14. Sähköinen julkaisu (e-pub) ennen painettua julkistusta

    Maternal Depressive Symptoms During the Pre- and Postnatal Periods and Infant Attention to Emotional Faces

    Kataja, E. L., Karlsson, L., Leppänen, J. M., Pelto, J., Häikiö, T., Nolvi, S., Pesonen, H., Parsons, C. E., Hyönä, J. & Karlsson, H., 1 tammikuuta 2018, julkaisussa : CHILD DEVELOPMENT. 16 Sivumäärä

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  15. Julkaistu

    MeSHLabeler and DeepMeSH: Recent progress in large-scale MeSH indexing

    Peng, S., Mamitsuka, H. & Zhu, S., 1 tammikuuta 2018, Methods in Molecular Biology. s. 203-209 7 Sivumäärä (Methods in Molecular Biology; painos 1807).

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussavertaisarvioitu

  16. Julkaistu

    On the number of connected sets in bounded degree graphs

    Kangas, K., Kaski, P., Korhonen, J. H. & Koivisto, M., 1 tammikuuta 2018, julkaisussa : Electronic Journal of Combinatorics. 25, 4, s. 1-19 #P4.34.

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  17. Julkaistu

    Prediction of Multiple-Trait and Multiple-Environment Genomic Data Using Recommender Systems

    Montesinos-López, O. A., Montesinos-López, A., Crossa, J., Montesinos-López, J. C., Mota-Sanchez, D., Estrada-González, F., Gillberg, J., Singh, R., Mondal, S. & Juliana, P., 1 tammikuuta 2018, julkaisussa : G3: Genes, Genomes, Genetics. 8, 1, s. 131-147

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  18. Julkaistu

    Preface

    Mamitsuka, H., 1 tammikuuta 2018, Data Mining for Systems Biology: Methods and Protocols. 2 toim. s. v-vi (Methods in Molecular Biology; painos 1807).

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussavertaisarvioitu

  19. Julkaistu

    Rethinking Summarization and Storytelling for Modern Social Multimedia

    Rudinac, S., Chua, T. S., Diaz-Ferreyra, N., Friedland, G., Gornostaja, T., Huet, B., Kaptein, R., Lindén, K., Moens, M. F., Peltonen, J., Redi, M., Schedl, M., Shamma, D. A., Smeaton, A. & Xie, L., 1 tammikuuta 2018, MultiMedia Modeling - 24th International Conference, MMM 2018, Proceedings. Schoeffmann, K., Gabbouj, M., O'Connor, N. E., Elgammal, A., Chalidabhongse, T. H., Aramvith, S., Ngo, C. W. & Ho, Y-S. (toim.). s. 632-644 13 Sivumäärä (Lecture Notes in Computer Science (including subseries Lecture Notes in Artificial Intelligence and Lecture Notes in Bioinformatics); painos 10704 LNCS).

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussavertaisarvioitu

  20. Julkaistu

    SiBIC: A tool for generating a network of biclusters captured by maximal frequent itemset mining

    Takahashi, K. I., duVerle, D. A., Yotsukura, S., Takigawa, I. & Mamitsuka, H., 1 tammikuuta 2018, Methods in Molecular Biology. s. 95-111 17 Sivumäärä (Methods in Molecular Biology; painos 1807).

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussavertaisarvioitu

  21. Julkaistu

    VisualLabel: An integrated multimedia content management and access framework

    Ahmad, I., Rantanen, P., Sillberg, P., Laaksonen, J., Liu, S., Forss, T., Malik, A., Nieminen, M., Shetty, R., Ishikawa, S., Kallio, J., Saarinen, J. P., Gabbouj, M. & Soini, J., 1 tammikuuta 2018, Information Modelling and Knowledge Bases XXIX. Yoshida, N., Koopipat, C., Kiyoki, Y., Chawakitchareon, P., Hansuebsai, A., Sornlertlamvanich, V., Thalheim, B. & Jaakkola, H. (toim.). IOS PRESS, s. 321-342 22 Sivumäärä (Frontiers in Artificial Intelligence and Applications; painos 301).

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussavertaisarvioitu

  22. Julkaistu

    AI is far from ready

    Kaski, S., 2018, 1 Sivumäärä. AALTO-YLIOPISTO.

    Tutkimustuotos: Muu tuotos

  23. Julkaistu

    AiProAnnotator: Low-rank Approximation with network side information for high-performance, large-scale human Protein abnormality Annotator

    Gao, J., Yao, S., Mamitsuka, H. & Zhu, S., 2018, Proceedings - 2018 IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine, BIBM 2018. s. 13-20 8 Sivumäärä 8621517

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussavertaisarvioitu

  24. Julkaistu

    A Scalable Scheme for Counting Linear Extensions

    Talvitie, T., Kangas, J-K., Niinimäki, T. & Koivisto, M., 2018, IJCAI'18: Proceedings of the 27th International Joint Conference on Artificial Intelligence. s. 5119–5125

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussavertaisarvioitu

  25. Julkaistu

    Bayesian Multi-View Factor Models for Drug Response and Brain Imaging Studies

    Leppäaho, E., 2018, Aalto University. 168 Sivumäärä

    Tutkimustuotos

  26. Julkaistu

    Bottom-Up Attention Guidance for Recurrent Image Recognition

    Rezazadegan Tavakoli, H., Borji, A., Anwer, R., Rahtu, E. & Kannala, J., 2018, 2018 IEEE International Conference on Image Processing, ICIP 2018 - Proceedings. IEEE, s. 3004-3008 5 Sivumäärä 8451537

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussavertaisarvioitu

  27. Julkaistu

    Counting Linear Extensions in Practice: MCMC Versus Exponential Monte Carlo

    Talvitie, T., Kangas, J-K., Niinimäki, T. & Koivisto, M., 2018, 32nd AAAI Conference on Artificial Intelligence, AAAI 2018. AAAI PRESS, s. 1431-1438 8 Sivumäärä (Proceedings of the AAAI Conference on Artificial Intelligence).

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussavertaisarvioitu

  28. Julkaistu

    Deep Transfer Learning of Representations for Differentially Private Learning

    Niinimäki, T., Heikkilä, M., Kaski, S. & Honkela, A., 2018.

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussaKonferenssiesitysvertaisarvioitu

  29. Julkaistu

    Domain Adaptation for Resume Classification Using Convolutional Neural Networks

    Sayfullina, L., Malmi, E., Liao, Y. & Jung, A., 2018, Analysis of Images, Social Networks and Texts: 6th International Conference, AIST 2017, Moscow, Russia, July 27--29, 2017, Revised Selected Papers. van der Aalst, W. M. P., Ignatov, D. I., Khachay, M., Kuznetsov, S. O., Lempitsky, V., Lomazova, I. A., Loukachevitch, N., Napoli, A., Panchenko, A., Pardalos, P. M., Savchenko, A. V. & Wasserman, S. (toim.). Cham, s. 82-93 12 Sivumäärä (Lecture Notes in Computer Science; painos 10716).

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussavertaisarvioitu

  30. Julkaistu

    Efficient Convex Completion of Coupled Tensors using Coupled Nuclear Norms

    Wimalawarne, K. & Mamitsuka, H., 2018, s. 6902-6910. 9 Sivumäärä.

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussaKonferenssiesitysvertaisarvioitu

  31. Julkaistu

    Factor Analysis on a Graph

    Karasuyama, M. & Mamitsuka, H., 2018, Proceedings of the Twenty-First International Conference on Artificial Intelligence and Statistics. Storkey, A. & Perez-Cruz, F. (toim.). s. 1117-1126 (Proceedings of Machine Learning Research; painos 84).

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussavertaisarvioitu

  32. Julkaistu

    Gaussian Process Modelling of Genome-wide High-throughput Sequencing Time Series

    Topa, H., 2018, Aalto University. 186 Sivumäärä

    Tutkimustuotos

  33. Julkaistu

    Global Estimates of Errors in Quantum Computation by the Feynman–Vernon Formalism

    Aurell, E., 2018, julkaisussa : Journal of Statistical Physics. 171, 5, s. 745–767 23 Sivumäärä

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  34. Julkaistu

    Image and Video Captioning with Augmented Neural Architectures

    Shetty, R., Rezazadegan Tavakoli, H. & Laaksonen, J., 2018, julkaisussa : IEEE Multimedia. 25, 2, s. 34-46 13 Sivumäärä

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  35. Julkaistu

    Information Visualization Evaluation Using Crowdsourcing

    Borgo, R., Micallef, L., Bach, B., McGee, F. & Lee, B., 2018, julkaisussa : Computer Graphics Forum. 37, 3, s. 573-595 23 Sivumäärä

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  36. Julkaistu

    Interactive Intent Modeling for Exploratory Search

    Ruotsalo, T., Peltonen, J., Eugster, M. JA., Glowacka, D., Floréen, P., Myllymäki, P., Jacucci, G. & Kaski, S., 2018, julkaisussa : ACM TRANSACTIONS ON INFORMATION SYSTEMS. 36, 4, s. 1-46 44.

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  37. Julkaistu

    Likelihood-free inference via classification

    Gutmann, M. U., Dutta, R., Kaski, S. & Corander, J., 2018, julkaisussa : STATISTICS AND COMPUTING. 28, 2, s. 411–425 15 Sivumäärä

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  38. Julkaistu
  39. Julkaistu

    MediaEval 2018: Predicting Media Memorability

    Cohendet, R., Demarty, C-H., Duong, N. Q. K., Sjöberg, M., Ionescu, B. & Do, T. T., 2018, MediaEval 2018 - Multimedia Benchmark Workshop: Working Notes Proceedings of the MediaEval 2018 Workshop, Sophia, Antipolis, France, 29-31 October 2018. CEUR, 3 Sivumäärä (CEUR Workshop Proceedings; painos 2283).

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussavertaisarvioitu

  40. Julkaistu

    Probabilistic Formulation of the Take The Best Heuristic

    Peltola, T., Jokinen, J. & Kaski, S., 2018, CogSci 2018 Proceedings . COGNITIVE SCIENCE SOCIETY, s. 2214-2219

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussavertaisarvioitu

  41. Julkaistu

    Subjectively Interesting Subgroup Discovery on Real-valued Targets

    Lijffijt, J., Kang, B., Duivesteijn, W., Puolamäki, K., Oikarinen, E. & De Bie, T., 2018, Proceedings of the 34th IEEE International Conference on Data Engineering (ICDE 2018). IEEE, s. 1356-1359 4 Sivumäärä 8509369

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussavertaisarvioitu

  42. Julkaistu

    The MediaEval 2018 Emotional Impact of Movies Task

    Dellandréa, E., Huigsloot, M., Chen, L., Baveye, Y., Xiao, Z. & Sjöberg, M., 2018, MediaEval 2018 - Multimedia Benchmark Workshop: Working Notes Proceedings of the MediaEval 2018 Workshop, Sophia, Antipolis, France, 29-31 October 2018. CEUR, 3 Sivumäärä (CEUR Workshop Proceedings; painos 2283).

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussavertaisarvioitu

  43. Julkaistu

    The MeMAD submission to the WMT18 multimodal translation task

    Grönroos, S-A., Huet, B., Kurimo, M., Laaksonen, J., Merialdo, B., Pham, P., Sjöberg, M., Sulubacak, U., Tiedemann, J., Troncy, R. & Vázquez, R., 2018, Proceedings of the Third Conference on Machine Translation (WMT), Volume 2: Shared Task Papers. Vuosikerta 2. s. 609-617 9 Sivumäärä

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussavertaisarvioitu

  44. Julkaistu

    Using counterfactual queries to improve models for decision-support

    Sundin, I., Schulam, P., Siivola, E., Vehtari, A., Saria, S. & Kaski, S., 2018.

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussavertaisarvioitu

  45. Julkaistu

    Variational zero-inflated Gaussian processes with sparse kernels

    Hegde, P., Heinonen, M. & Kaski, S., 2018, 34th Conference on Uncertainty in Artificial Intelligence 2018, UAI 2018. AUAI Press, Vuosikerta 1. s. 361-371 148

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussavertaisarvioitu

  46. Julkaistu

    Word embedding based on low-rank doubly stochastic matrix decomposition

    Sedov, D. & Yang, Z., 2018, Neural Information Processing: 25th International Conference, ICONIP 2018 Siem Reap, Cambodia, December 13–16, 2018 Proceedings, Part III. Vuosikerta 3. s. 90-100 10 Sivumäärä (Lecture Notes in Computer Science (including subseries Lecture Notes in Artificial Intelligence and Lecture Notes in Bioinformatics); painos 11303 LNCS).

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussavertaisarvioitu

  47. 2017
  48. Julkaistu

    What you see is what you can change: Human-centered machine learning by interactive visualization

    Sacha, D., Sedlmair, M., Zhang, L., Lee, J. A., Peltonen, J., Weiskopf, D., North, S. C. & Keim, D. A., 13 joulukuuta 2017, julkaisussa : Neurocomputing. 268, s. 164-175 12 Sivumäärä

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  49. Julkaistu

    Brain-to-brain hyperclassification reveals action-specific motor mapping of observed actions in humans

    Smirnov, D., Lachat, F., Peltola, T., Lahnakoski, J., Koistinen, O-P., Glerean, E., Vehtari, A., Hari, R., Sams, M. & Nummenmaa, L., 11 joulukuuta 2017, julkaisussa : PloS one. 12, 12, e0189508.

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  50. Julkaistu

    Inference of Strategic Behavior based on Incomplete Observation Data

    Kangasrääsiö, A. & Kaski, S., 8 joulukuuta 2017, NIPS17 Workshop: Learning in the Presence of Strategic Behavior. Carnegie Mellon University, 4 Sivumäärä

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussa

  51. Julkaistu

    Computational and perceptual determinants of film mood in different types of scenes

    Tarvainen, J., Laaksonen, J. & Takala, T., joulukuuta 2017, Proceedings - 2017 IEEE International Symposium on Multimedia, ISM 2017. IEEE, s. 185-192

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussavertaisarvioitu

  52. Julkaistu

    Efficient acquisition rules for model-based approximate Bayesian computation

    Järvenpää, M., Gutmann, M., Pleska, A., Vehtari, A. & Marttinen, P., joulukuuta 2017.

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussavertaisarvioitu

ID: 4319430