Professorship Kaski S.

Yksikkö: Tutkimusryhmä


  1. 2018
  2. Julkaistu

    Supervised low rank indefinite kernel approximation using minimum enclosing balls

    Schleif, F. M., Gisbrecht, A. & Tino, P., 27 marraskuuta 2018, julkaisussa : Neurocomputing. 318, s. 213-226 14 Sivumäärä

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  3. Julkaistu

    Convex Coupled Matrix and tensor completion

    Wimalawarne, K., Yamada, M. & Mamitsuka, H., 1 marraskuuta 2018, julkaisussa : Neural Computation. 30, 11, s. 3095-3127 33 Sivumäärä

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  4. Julkaistu

    PicSOM Experiments in TRECVID 2018

    Sjöberg, M., Tavakoli, H. R., Xu, Z., Mantecón, H. L. & Laaksonen, J., 1 marraskuuta 2018, Proceedings of the TRECVID 2018 Workshop. Gaithersburg, MD, USA

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussa

  5. Julkaistu

    Depression, depressive symptoms and treatments in women who have recently given birth: UK cohort study

    Petersen, I., Peltola, T., Kaski, S., Walters, K. R. & Hardoon, S., 24 lokakuuta 2018, julkaisussa : BMJ Open. 8, 10, s. 1-8 8 Sivumäärä, e02215.

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  6. Julkaistu

    Interactive visual data exploration with subjective feedback: An information-theoretic approach

    Puolamaki, K., Oikarinen, E., Kang, B., Lijffijt, J. & De Bie, T., 24 lokakuuta 2018, Proceedings of the 34th IEEE International Conference on Data Engineering (ICDE 2018). Institute of Electrical and Electronics Engineers, s. 1212-1215 4 Sivumäärä 8509333

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussavertaisarvioitu

  7. Julkaistu

    Textbook of Machine Learning and Data Mining: with Bioinformatics Applications

    Mamitsuka, H., 12 syyskuuta 2018, 388 Sivumäärä

    Tutkimustuotos: Kirja

  8. Julkaistu

    Correlation-compressed direct-coupling analysis

    Gao, C. Y., Zhou, H. J. & Aurell, E., 11 syyskuuta 2018, julkaisussa : Physical Review E. 98, 3, s. 1-15 032407.

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  9. Julkaistu

    Inverse reinforcement learning from summary data

    Kangasrääsiö, A. & Kaski, S., syyskuuta 2018, julkaisussa : Machine Learning. 107, 8-10, s. 1517–1535

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  10. Julkaistu

    ELFI: Engine for likelihood-free inference

    Lintusaari, J., Vuollekoski, H., Kangasrääsiö, A., Skytén, K., Järvenpää, M., Marttinen, P., Gutmann, M. U., Vehtari, A., Corander, J. & Kaski, S., 1 elokuuta 2018, julkaisussa : Journal of Machine Learning Research. 19, s. 1-7 7 Sivumäärä

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  11. Julkaistu

    GOLabeler: Improving sequence-based large-scale protein function prediction by learning to rank

    You, R., Zhang, Z., Xiong, Y., Sun, F., Mamitsuka, H. & Zhu, S., 15 heinäkuuta 2018, julkaisussa : Bioinformatics. 34, 14, s. 2465-2473 9 Sivumäärä

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  12. Julkaistu

    Local Interpretable Model-agnostic Explanations of Bayesian Predictive Models via Kullback-Leibler Projections

    Peltola, T., 13 heinäkuuta 2018.

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussavertaisarvioitu

  13. Julkaistu

    Two-stream part-based deep representation for human attribute recognition

    Anwer, R. M., Khan, F. S. & Laaksonen, J., 13 heinäkuuta 2018, Proceedings - 2018 International Conference on Biometrics, ICB 2018. Institute of Electrical and Electronics Engineers, s. 90-97 8 Sivumäärä

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussavertaisarvioitu

  14. Julkaistu

    Bacmeta: Simulator for genomic evolution in bacterial metapopulations

    Sipola, A., Marttinen, P. & Corander, J., 1 heinäkuuta 2018, julkaisussa : Bioinformatics. 34, 13, s. 2308-2310 3 Sivumäärä

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  15. Julkaistu

    SIMPLE Sparse Interaction Model over Peaks of moLEcules for fast, interpretable metabolite identification from tandem mass spectra

    Nguyen, D. H., Nguyen, C. H. & Mamitsuka, H., 1 heinäkuuta 2018, julkaisussa : Bioinformatics. 34, 13, s. i323-i332 10 Sivumäärä

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  16. Julkaistu

    Improving genomics-based predictions for precision medicine through active elicitation of expert knowledge

    Sundin, I., Peltola, T., Micallef, L., Afrabandpey, H., Soare, M., Majumder, M. M., Daee, P., He, C., Serim, B., Havulinna, A. & 4 muutaHeckman, C., Jacucci, G., Marttinen, P. & Kaski, S., 27 kesäkuuta 2018, julkaisussa : Bioinformatics. 34, 13, s. i395-i403

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  17. Julkaistu

    Characteristic functions of quantum heat with baths at different temperatures

    Aurell, E., 7 kesäkuuta 2018, julkaisussa : Physical Review E. 97, 6, s. 1-9 062117.

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  18. Julkaistu

    Inverse finite-size scaling for high-dimensional significance analysis

    Xu, Y., Puranen, S., Corander, J. & Kabashima, Y., 6 kesäkuuta 2018, julkaisussa : Physical Review E. 97, 6, s. 1-9 062112.

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  19. Julkaistu

    Effect of spatial connectivity on host resistance in a highly fragmented natural pathosystem

    Höckerstedt, L. M., Siren, J. P. & Laine, A. L., kesäkuuta 2018, julkaisussa : Journal of Evolutionary Biology. 31, 6, s. 844-852

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  20. Julkaistu

    A Combined PLS and Negative Binomial Regression Model for Inferring Association Networks from Next-generation Sequencing Count Data

    Pesonen, M., Nevalainen, J., Potter, S., Datta, S. & Datta, S., 1 toukokuuta 2018, julkaisussa : IEEE-ACM TRANSACTIONS ON COMPUTATIONAL BIOLOGY AND BIOINFORMATICS. 15, 3, s. 760-773 14 Sivumäärä

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  21. Julkaistu

    Unified picture of strong-coupling stochastic thermodynamics and time reversals

    Aurell, E., 9 huhtikuuta 2018, julkaisussa : Physical Review E. 97, 4, s. 1-10 042112.

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  22. Julkaistu

    Binary patterns encoded convolutional neural networks for texture recognition and remote sensing scene classification

    Anwer, R. M., Khan, F. S., van de Weijer, J., Molinier, M. & Laaksonen, J., 1 huhtikuuta 2018, julkaisussa : ISPRS Journal of Photogrammetry and Remote Sensing. 138, s. 74-85 12 Sivumäärä

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  23. Julkaistu

    Approximate message passing for nonconvex sparse regularization with stability and asymptotic analysis

    Sakata, A. & Xu, Y., 13 maaliskuuta 2018, julkaisussa : Journal of Statistical Mechanics: Theory and Experiment. 2018, 3, s. 1-35 033404.

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  24. Julkaistu

    User Modelling for Avoiding Overfitting in Interactive Knowledge Elicitation for Prediction

    Daee, P., Peltola, T., Vehtari, A. & Kaski, S., 8 maaliskuuta 2018, IUI 2018 - Proceedings of the 23rd International Conference on Intelligent User Interfaces. Association for Computing Machinery (ACM), s. 305-310 6 Sivumäärä

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussavertaisarvioitu

  25. Julkaistu

    Phenotype-driven identification of epithelial signalling clusters

    Marques, E., Peltola, T., Kaski, S. & Klefström, J., 5 maaliskuuta 2018, julkaisussa : Scientific Reports. 8, 1, s. 1-13 4034.

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  26. Julkaistu

    Efficient differentially private learning improves drug sensitivity prediction

    Honkela, A., Das, M., Nieminen, A., Dikmen, O. & Kaski, S., 6 helmikuuta 2018, julkaisussa : BIOLOGY DIRECT. 13, 1, s. 1-12

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  27. Julkaistu

    Film mood and its quantitative determinants in different types of scenes

    Tarvainen, J., Laaksonen, J. & Takala, T., 8 tammikuuta 2018, julkaisussa : IEEE Transactions on Affective Computing.

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  28. Julkaistu

    A conceptual framework for personalization of indoor comfort parameters based on office workers’ preferences

    Mirzaeifar, S., Daee, P. & Singh, V., 1 tammikuuta 2018, Product Lifecycle Management to Support Industry 4.0 - 15th IFIP WG 5.1 International Conference, PLM 2018, Proceedings. Ríos, J., Noël, F., Chiabert, P. & Bouras, A. (toim.). s. 35-45 11 Sivumäärä (IFIP Advances in Information and Communication Technology; painos 540).

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussavertaisarvioitu

  29. Julkaistu

    Author Tree-Structured Hierarchical Dirichlet Process

    Alam, M. H., Peltonen, J., Nummenmaa, J. & Järvelin, K., 1 tammikuuta 2018, Discovery Science - 21st International Conference, DS 2018, Proceedings. Ceci, M., Soldatova, L., Vanschoren, J. & Papadopoulos, G. (toim.). Springer Verlag, s. 311-327 17 Sivumäärä (Lecture Notes in Computer Science (including subseries Lecture Notes in Artificial Intelligence and Lecture Notes in Bioinformatics); painos 11198 LNAI).

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussavertaisarvioitu

  30. Julkaistu

    Data Mining for Systems Biology: Methods and Protocols

    Mamitsuka, H. (toim.), 1 tammikuuta 2018, 2nd toim. (Methods in Molecular Biology; painos 1807)

    Tutkimustuotos: Kirja

  31. Julkaistu

    DrugE-rank: Predicting drug-target interactions by learning to rank

    Deng, J., Yuan, Q., Mamitsuka, H. & Zhu, S., 1 tammikuuta 2018, Methods in Molecular Biology. s. 195-202 8 Sivumäärä (Methods in Molecular Biology; painos 1807).

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussavertaisarvioitu

  32. Sähköinen julkaisu (e-pub) ennen painettua julkistusta

    Maternal Depressive Symptoms During the Pre- and Postnatal Periods and Infant Attention to Emotional Faces

    Kataja, E. L., Karlsson, L., Leppänen, J. M., Pelto, J., Häikiö, T., Nolvi, S., Pesonen, H., Parsons, C. E., Hyönä, J. & Karlsson, H., 1 tammikuuta 2018, julkaisussa : CHILD DEVELOPMENT. 16 Sivumäärä

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  33. Julkaistu

    MeSHLabeler and DeepMeSH: Recent progress in large-scale MeSH indexing

    Peng, S., Mamitsuka, H. & Zhu, S., 1 tammikuuta 2018, Methods in Molecular Biology. s. 203-209 7 Sivumäärä (Methods in Molecular Biology; painos 1807).

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussavertaisarvioitu

  34. Julkaistu

    On the number of connected sets in bounded degree graphs

    Kangas, K., Kaski, P., Korhonen, J. H. & Koivisto, M., 1 tammikuuta 2018, julkaisussa : Electronic Journal of Combinatorics. 25, 4, s. 1-19 #P4.34.

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  35. Julkaistu

    Prediction of Multiple-Trait and Multiple-Environment Genomic Data Using Recommender Systems

    Montesinos-López, O. A., Montesinos-López, A., Crossa, J., Montesinos-López, J. C., Mota-Sanchez, D., Estrada-González, F., Gillberg, J., Singh, R., Mondal, S. & Juliana, P., 1 tammikuuta 2018, julkaisussa : G3: Genes, Genomes, Genetics. 8, 1, s. 131-147

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  36. Julkaistu


    Mamitsuka, H., 1 tammikuuta 2018, Data Mining for Systems Biology: Methods and Protocols. 2 toim. s. v-vi (Methods in Molecular Biology; painos 1807).

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussavertaisarvioitu

  37. Julkaistu

    Rethinking Summarization and Storytelling for Modern Social Multimedia

    Rudinac, S., Chua, T. S., Diaz-Ferreyra, N., Friedland, G., Gornostaja, T., Huet, B., Kaptein, R., Lindén, K., Moens, M. F., Peltonen, J. & 5 muutaRedi, M., Schedl, M., Shamma, D. A., Smeaton, A. & Xie, L., 1 tammikuuta 2018, MultiMedia Modeling - 24th International Conference, MMM 2018, Proceedings. Schoeffmann, K., Gabbouj, M., O'Connor, N. E., Elgammal, A., Chalidabhongse, T. H., Aramvith, S., Ngo, C. W. & Ho, Y-S. (toim.). Springer Verlag, s. 632-644 13 Sivumäärä (Lecture Notes in Computer Science (including subseries Lecture Notes in Artificial Intelligence and Lecture Notes in Bioinformatics); painos 10704 LNCS).

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussavertaisarvioitu

  38. Julkaistu

    SiBIC: A tool for generating a network of biclusters captured by maximal frequent itemset mining

    Takahashi, K. I., duVerle, D. A., Yotsukura, S., Takigawa, I. & Mamitsuka, H., 1 tammikuuta 2018, Methods in Molecular Biology. s. 95-111 17 Sivumäärä (Methods in Molecular Biology; painos 1807).

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussavertaisarvioitu

  39. Julkaistu

    VisualLabel: An integrated multimedia content management and access framework

    Ahmad, I., Rantanen, P., Sillberg, P., Laaksonen, J., Liu, S., Forss, T., Malik, A., Nieminen, M., Shetty, R., Ishikawa, S. & 4 muutaKallio, J., Saarinen, J. P., Gabbouj, M. & Soini, J., 1 tammikuuta 2018, Information Modelling and Knowledge Bases XXIX. Yoshida, N., Koopipat, C., Kiyoki, Y., Chawakitchareon, P., Hansuebsai, A., Sornlertlamvanich, V., Thalheim, B. & Jaakkola, H. (toim.). s. 321-342 22 Sivumäärä (Frontiers in Artificial Intelligence and Applications; painos 301).

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussavertaisarvioitu

  40. Julkaistu

    AI is far from ready

    Kaski, S., 2018, 1 Sivumäärä. AALTO-YLIOPISTO.

    Tutkimustuotos: Muu tuotos

  41. Julkaistu

    AiProAnnotator: Low-rank Approximation with network side information for high-performance, large-scale human Protein abnormality Annotator

    Gao, J., Yao, S., Mamitsuka, H. & Zhu, S., 2018, Proceedings - 2018 IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine, BIBM 2018. s. 13-20 8 Sivumäärä 8621517

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussavertaisarvioitu

  42. Julkaistu

    Bayesian Multi-View Factor Models for Drug Response and Brain Imaging Studies

    Leppäaho, E., 2018, Aalto University. 168 Sivumäärä


  43. Julkaistu

    Bottom-Up Attention Guidance for Recurrent Image Recognition

    Rezazadegan Tavakoli, H., Borji, A., Anwer, R., Rahtu, E. & Kannala, J., 2018, 2018 IEEE International Conference on Image Processing, ICIP 2018 - Proceedings. Institute of Electrical and Electronics Engineers, s. 3004-3008 5 Sivumäärä 8451537

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussavertaisarvioitu

  44. Julkaistu

    Counting Linear Extensions in Practice: MCMC Versus Exponential Monte Carlo

    Talvitie, T., Kangas, J-K., Niinimäki, T. & Koivisto, M., 2018, 32nd AAAI Conference on Artificial Intelligence, AAAI 2018. s. 1431-1438 8 Sivumäärä (Proceedings of the AAAI Conference on Artificial Intelligence).

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussavertaisarvioitu

  45. Julkaistu

    Deep Transfer Learning of Representations for Differentially Private Learning

    Niinimäki, T., Heikkilä, M., Kaski, S. & Honkela, A., 2018.

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussaKonferenssiesitysvertaisarvioitu

  46. Julkaistu

    Domain Adaptation for Resume Classification Using Convolutional Neural Networks

    Sayfullina, L., Malmi, E., Liao, Y. & Jung, A., 2018, Analysis of Images, Social Networks and Texts: 6th International Conference, AIST 2017, Moscow, Russia, July 27--29, 2017, Revised Selected Papers. van der Aalst, W. M. P., Ignatov, D. I., Khachay, M., Kuznetsov, S. O., Lempitsky, V., Lomazova, I. A., Loukachevitch, N., Napoli, A., Panchenko, A., Pardalos, P. M., Savchenko, A. V. & Wasserman, S. (toim.). Cham: Springer International Publishing AG, s. 82-93 12 Sivumäärä (Lecture Notes in Computer Science; painos 10716).

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussavertaisarvioitu

  47. Julkaistu

    Efficient Convex Completion of Coupled Tensors using Coupled Nuclear Norms

    Wimalawarne, K. & Mamitsuka, H., 2018, s. 6902-6910. 9 Sivumäärä.

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussaKonferenssiesitysvertaisarvioitu

  48. Julkaistu

    Factor Analysis on a Graph

    Karasuyama, M. & Mamitsuka, H., 2018, Proceedings of the Twenty-First International Conference on Artificial Intelligence and Statistics. Storkey, A. & Perez-Cruz, F. (toim.). s. 1117-1126 (Proceedings of Machine Learning Research; painos 84).

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussavertaisarvioitu

  49. Julkaistu

    Gaussian Process Modelling of Genome-wide High-throughput Sequencing Time Series

    Topa, H., 2018, Aalto University. 186 Sivumäärä


  50. Julkaistu

    Global Estimates of Errors in Quantum Computation by the Feynman–Vernon Formalism

    Aurell, E., 2018, julkaisussa : Journal of Statistical Physics. 171, 5, s. 745–767 23 Sivumäärä

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  51. Julkaistu

    Image and Video Captioning with Augmented Neural Architectures

    Shetty, R., Rezazadegan Tavakoli, H. & Laaksonen, J., 2018, julkaisussa : IEEE Multimedia. 25, 2, s. 34-46 13 Sivumäärä

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

ID: 4319430