Professorship Kaski S.

Yksikkö: Tutkimusryhmä

Tutkimustuotokset

  1. 2020
  2. Julkaistu

    FullMeSH: Improving large-scale MeSH indexing with full text

    Dai, S., You, R., Lu, Z., Huang, X., Mamitsuka, H. & Zhu, S., 1 maaliskuuta 2020, julkaisussa : Bioinformatics. 36, 5, s. 1533-1541 9 Sivumäärä

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  3. Julkaistu

    Scaled coupled norms and coupled higher-order tensor completion

    Wimalawarne, K., Yamada, M. & Mamitsuka, H., 1 helmikuuta 2020, julkaisussa : Neural Computation. 32, 2, s. 447-484 38 Sivumäärä

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  4. Julkaistu

    Deep Contextual Attention for Human-Object Interaction Detection

    Wang, T., Anwer, R. M., Khan, M. H., Khan, F. S., Pang, Y., Shao, L. & Laaksonen, J., helmikuuta 2020, Proceedings of the International Conference on Computer Vision (ICCV2019). IEEE, s. 5694-5702 (Proceedings of the IEEE International Conference on Computer Vision; painos 2019-October).

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussavertaisarvioitu

  5. Hyväksytty/In press

    Parallel Gaussian process surrogate Bayesian inference with noisy likelihood evaluations

    Järvenpää, M., Gutmann, M., Vehtari, A. & Marttinen, P., helmikuuta 2020, (Hyväksytty/In press) julkaisussa : Bayesian Analysis.

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  6. Sähköinen julkaisu (e-pub) ennen painettua julkistusta

    Robust parallel hybrid artificial bee colony algorithms for the multi-dimensional numerical optimization

    Dokeroglu, T., Pehlivan, S. & Avenoglu, B., 9 tammikuuta 2020, julkaisussa : JOURNAL OF SUPERCOMPUTING.

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  7. Julkaistu

    High-dimensional structure learning of binary pairwise Markov networks: A comparative numerical study

    Pensar, J., Xu, Y., Puranen, S., Pesonen, M., Kabashima, Y. & Corander, J., 1 tammikuuta 2020, julkaisussa : Computational Statistics and Data Analysis. 141, s. 62-76 15 Sivumäärä

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  8. Hyväksytty/In press

    Computing Tight Differential Privacy Guarantees Using FFT

    Koskela, A., Jälkö, J. & Honkela, A., 2020, (Hyväksytty/In press) AISTATS.

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussavertaisarvioitu

  9. Hyväksytty/In press

    Learning spectrograms with convolutional spectral kernels

    Shen, Z., Heinonen, M. & Kaski, S., 2020, (Hyväksytty/In press) The 23rd International Conference on Artificial Intelligence and Statistic. (Proceedings of Machine Learning Research).

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussavertaisarvioitu

  10. Julkaistu

    Plasmids shaped the recent emergence of the major nosocomial pathogen Enterococcus faecium

    Arredondo-Alonso, S., Top, J., McNally, A., Puranen, S., Pesonen, M., Pensar, J., Marttinen, P., Braat, J., Rogers, M., van Schaik, W., Kaski, S., Willems, R. J. L., Corander, J. & Schürch, A., 2020, julkaisussa : MBIO. 11, 1, e03284-19.

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  11. 2019
  12. Julkaistu

    HPOAnnotator: improving large-scale prediction of HPO annotations by low-rank approximation with HPO semantic similarities and multiple PPI networks

    Gao, J., Liu, L., Yao, S., Huang, X., Mamitsuka, H. & Zhu, S., 23 joulukuuta 2019, julkaisussa : BMC Medical Genomics . 12, 14 Sivumäärä, 187.

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  13. Julkaistu

    A sparse linear regression model for incomplete datasets

    Veras, M. B. A., Mesquita, D. P. P., Mattos, C. L. C. & Gomes, J. P. P., 4 joulukuuta 2019, julkaisussa : Pattern Analysis and Applications.

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  14. Julkaistu

    Machine Teaching of Active Sequential Learners

    Peltola, T., Çelikok, M. M., Daee, P. & Kaski, S., 28 marraskuuta 2019, 33rd Conference on Neural Information Processing Systems: NeurIPS 2019 . Neural Information Processing Systems Foundation, s. 11202-11213 12 Sivumäärä (Advances in Neural Information Processing Systems).

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussavertaisarvioitu

  15. Julkaistu

    Recent advances and prospects of computational methods for metabolite identification: a review with emphasis on machine learning approaches

    Nguyen, D. H., Nguyen, C. H. & Mamitsuka, H., 27 marraskuuta 2019, julkaisussa : BRIEFINGS IN BIOINFORMATICS. 20, 6, s. 2028-2043 16 Sivumäärä

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  16. Hyväksytty/In press

    Scalable Probabilistic Matrix Factorization with Graph-­Based Priors

    Strahl, J., Peltonen, J., Mamitsuka, H. & Kaski, S., 22 marraskuuta 2019, (Hyväksytty/In press) Proceedings of AAAI-20, AAAI Conference on Artificial Intelligence. AAAI, 9 Sivumäärä

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussavertaisarvioitu

  17. Julkaistu

    PicSOM and EURECOM Experiments in TRECVID 2019

    Laria Mantecon, H., Laaksonen, J., Francis, D. & Huet, B., marraskuuta 2019, Proceedings of TRECVID 2019. NIST, 6 Sivumäärä

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussa

  18. Julkaistu

    AI4TV 2019: 1st international workshop on AI for smart TV content production, access and delivery

    Troncy, R., Laaksonen, J., Tavakoli, H. R., Nixon, L. & Mezaris, V., 15 lokakuuta 2019, MM 2019 - Proceedings of the 27th ACM International Conference on Multimedia. ACM, s. 2716-2717 2 Sivumäärä (MM 2019 - Proceedings of the 27th ACM International Conference on Multimedia).

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussavertaisarvioitu

  19. Julkaistu

    Geometry-aware relational exemplar attention for dense captioning

    Wang, T. J. J., Tavakoli, H. R., Sjöberg, M. & Laaksonen, J., 15 lokakuuta 2019, MULEA 2019 - 1st International Workshop on Multimodal Understanding and Learning for Embodied Applications, co-located with MM 2019. ACM, s. 3-11 9 Sivumäärä

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussavertaisarvioitu

  20. Julkaistu

    Modelling G×E with historical weather information improves genomic prediction in new environments

    Gillberg, J., Marttinen, P., Mamitsuka, H. & Kaski, S., 15 lokakuuta 2019, julkaisussa : Bioinformatics (Oxford, England). 35, 20, s. 4045-4052 8 Sivumäärä

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  21. Julkaistu

    Genome-wide epistasis and co-selection study using mutual information

    Pensar, J., Puranen, S., Arnold, B., MacAlasdair, N., Kuronen, J., Tonkin-Hill, G., Pesonen, M., Xu, Y., Sipola, A., Sánchez-Busó, L., Lees, J. A., Chewapreecha, C., Bentley, S. D., Harris, S. R., Parkhill, J., Croucher, N. J. & Corander, J., 10 lokakuuta 2019, julkaisussa : Nucleic Acids Research. 47, 18, s. 1-14 e112.

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  22. Julkaistu

    Local dimension reduction of summary statistics for likelihood-free inference

    Siren, J. & Kaski, S., 4 lokakuuta 2019, julkaisussa : STATISTICS AND COMPUTING. 12 Sivumäärä

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  23. Julkaistu

    Fuzzy least squares twin support vector machines

    Sartakhti, J. S., Afrabandpey, H. & Ghadiri, N., 1 lokakuuta 2019, julkaisussa : ENGINEERING APPLICATIONS OF ARTIFICIAL INTELLIGENCE. 85, s. 402-409 8 Sivumäärä

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  24. Julkaistu

    Single-subject analysis of N400 event-related potential component with five different methods

    Kallionpää, R. E., Pesonen, H., Scheinin, A., Sandman, N., Laitio, R., Scheinin, H., Revonsuo, A. & Valli, K., 1 lokakuuta 2019, julkaisussa : International Journal of Psychophysiology. 144, s. 14-24 11 Sivumäärä

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  25. Julkaistu
  26. Julkaistu

    Scaling up the effects of inbreeding depression from individuals to metapopulations

    Nonaka, E., Sirén, J., Somervuo, P., Ruokolainen, L., Ovaskainen, O. & Hanski, I., elokuuta 2019, julkaisussa : Journal of Animal Ecology. 88, 8, s. 1202-1214

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  27. Julkaistu

    ADAPTIVE: LeArning DAta-dePendenT, concIse molecular VEctors for fast, accurate metabolite identification from tandem mass spectra

    Nguyen, D. H., Nguyen, C. H. & Mamitsuka, H., 15 heinäkuuta 2019, julkaisussa : Bioinformatics. 35, 14, s. i164-i172 btz319.

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  28. Julkaistu

    Bayesian metabolic flux analysis reveals intracellular flux couplings

    Heinonen, M., Osmala, M., Mannerström, H., Wallenius, J., Kaski, S., Rousu, J. & Lähdesmäki, H., 15 heinäkuuta 2019, julkaisussa : Bioinformatics. 35, 14, s. i548-i557 btz315.

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  29. Julkaistu

    Block HSIC Lasso: Model-free biomarker detection for ultra-high dimensional data

    Climente-González, H., Azencott, C. A., Kaski, S. & Yamada, M., 15 heinäkuuta 2019, julkaisussa : Bioinformatics. 35, 14, s. i427-i435 btz333.

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  30. Julkaistu

    Representation transfer for differentially private drug sensitivity prediction

    Niinimäki, T., Heikkilä, M. A., Honkela, A. & Kaski, S., 15 heinäkuuta 2019, julkaisussa : Bioinformatics. 35, 14, s. i218-i224 btz373.

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  31. Julkaistu

    NetGO: improving large-scale protein function prediction with massive network information

    You, R., Yao, S., Xiong, Y., Huang, X., Sun, F., Mamitsuka, H. & Zhu, S., 2 heinäkuuta 2019, julkaisussa : Nucleic Acids Research. 47, W1, s. W379-W387

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  32. Julkaistu

    Learning Image Relations with Contrast Association Networks

    Lu, Y., Yang, Z., Kannala, J. & Kaski, S., 1 heinäkuuta 2019, 2019 International Joint Conference on Neural Networks, IJCNN 2019. IEEE, 7 Sivumäärä 8852344. (Proceedings of the International Joint Conference on Neural Networks; painos 2019-July).

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussavertaisarvioitu

  33. Julkaistu

    Human-in-the-loop Active Covariance Learning for Improving Prediction in Small Data Sets

    Afrabandpey, H., Peltola, T. & Kaski, S., heinäkuuta 2019, Proceedings of the 28th International Joint Conference on Artificial Intelligence, IJCAI 2019. s. 1959-1966 8 Sivumäärä (IJCAI International Joint Conference on Artificial Intelligence).

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussavertaisarvioitu

  34. Julkaistu

    Variable opportunities for outcrossing result in hotspots of novel genetic variation in a pathogen metapopulation

    Laine, A-L., Barres, B., Numminen, E. & Siren, J. P., 18 kesäkuuta 2019, julkaisussa : ELIFE. 8, s. 1-17 17 Sivumäärä, 47091.

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  35. Julkaistu

    Community assessment to advance computational prediction of cancer drug combinations in a pharmacogenomic screen

    AstraZeneca-Sanger Drug Combination DREAM Consortium, Kaski, S. & Marttinen, P., 17 kesäkuuta 2019, julkaisussa : Nature Communications. 10, 1, s. 1-17 17 Sivumäärä, 2674.

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  36. Julkaistu

    Machine Learning for Marketing

    Mamitsuka, H., 9 kesäkuuta 2019, 237 Sivumäärä

    Tutkimustuotos: Kirja

  37. Julkaistu

    Parameter Inference for Computational Cognitive Models with Approximate Bayesian Computation

    Kangasrääsiö, A., Jokinen, J. P. P., Oulasvirta, A., Howes, A. & Kaski, S., 1 kesäkuuta 2019, julkaisussa : COGNITIVE SCIENCE. 43, 6, 40 Sivumäärä, 12738.

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  38. Julkaistu
  39. Julkaistu

    Efficient acquisition rules for model-based approximate Bayesian computation

    Järvenpää, M., Gutmann, M. U., Pleska, A., Vehtari, A. & Marttinen, P., kesäkuuta 2019, julkaisussa : Bayesian Analysis. 14, 2, s. 595-622 28 Sivumäärä

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  40. Julkaistu

    Emergence of ceftazidime-avibactam-resistant Klebsiella pneumoniae during treatment, Finland, December 2018

    Räisänen, K., Koivula, I., Ilmavirta, H., Puranen, S., Kallonen, T., Lyytikäinen, O. & Jalava, J., 1 toukokuuta 2019, julkaisussa : EUROSURVEILLANCE. 24, 19, s. 1-3

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  41. Julkaistu

    Harmonizable mixture kernels with variational Fourier features

    Shen, Z., Heinonen, M. & Kaski, S., toukokuuta 2019, The 22nd International Conference on Artificial Intelligence and Statistic. s. 1812-1821 (Proceedings of Machine Learning Research; painos 89).

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussavertaisarvioitu

  42. Julkaistu

    A Bayesian model of acquisition and clearance of bacterial colonization incorporating within-host variation

    Järvenpää, M., Sater, M. R. A., Lagoudas, G. K., Blainey, P. C., Miller, L. G., McKinnell, J. A., Huang, S. S., Grad, Y. H. & Marttinen, P., 1 huhtikuuta 2019, julkaisussa : PLoS computational biology. 15, 4, s. 1-25 e1006534.

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  43. Julkaistu

    Discovering heritable modes of MEG spectral power

    Leppäaho, E., Renvall, H., Salmela, E., Kere, J., Salmelin, R. & Kaski, S., 1 huhtikuuta 2019, julkaisussa : Human Brain Mapping . 40, 5, s. 1391-1402 12 Sivumäärä

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  44. Julkaistu

    Gaussian kernels for incomplete data

    Mesquita, D. P. P., Gomes, J. P. P., Corona, F., Souza, A. H. & Nobre, J. S., 1 huhtikuuta 2019, julkaisussa : Applied Soft Computing Journal. 77, s. 356-365 10 Sivumäärä

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  45. Julkaistu

    Mobile Brainwaves: On the Interchangeability of Simple authentication Tasks with Low-Cost, Single-Electrode EEG Devices

    Haukipuro, E-S., Kolehmainen, V., Myllärinen, J., Remander, S., Salo, J., Takko, T., Nguyen, L., Sigg, S. & Findling, R., 1 huhtikuuta 2019, julkaisussa : IEICE Transactions on Communications. E102-B, 4, s. 760-767 8 Sivumäärä

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  46. Julkaistu

    Deep learning with differential Gaussian process flows

    Hegde, P., Heinonen, M., Lähdesmäki, H. & Kaski, S., huhtikuuta 2019, The 22nd International Conference on Artificial Intelligence and Statistic. Vuosikerta 89. s. 1-15 16 Sivumäärä (Proceedings of Machine Learning Research; painos 89).

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussavertaisarvioitu

  47. Julkaistu

    Integrating neurophysiologic relevance feedback in intent modeling for information retrieval

    Jacucci, G., Barral, O., Daee, P., Wenzel, M., Serim, B., Ruotsalo, T., Pluchino, P., Freeman, J., Gamberini, L., Kaski, S. & Blankertz, B., 12 maaliskuuta 2019, julkaisussa : JOURNAL OF THE ASSOCIATION FOR INFORMATION SCIENCE AND TECHNOLOGY. 14 Sivumäärä

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  48. Julkaistu

    Digging deeper into egocentric gaze prediction

    Tavakoli, H. R., Rahtu, E., Kannala, J. & Borji, A., 4 maaliskuuta 2019, Proceedings - 2019 IEEE Winter Conference on Applications of Computer Vision, WACV 2019. IEEE, s. 273-282 10 Sivumäärä 8658619

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussavertaisarvioitu

  49. Julkaistu

    Semantic matching by weakly supervised 2D point set registration

    Laskar, Z., Tavakoli, H. R. & Kannala, J., 4 maaliskuuta 2019, 2019 IEEE WINTER CONFERENCE ON APPLICATIONS OF COMPUTER VISION (WACV). IEEE, s. 1061-1069 9 Sivumäärä 8658796

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussavertaisarvioitu

  50. Julkaistu

    Integrated analysis of population genomics, transcriptomics and virulence provides novel insights into Streptococcus pyogenes pathogenesis

    Kachroo, P., Eraso, J. M., Olsen, R. J., Beres, S. B., Zhu, L., Nasser, W., Bernard, P. E., Cantu, C. C., Saavedra, M. O., Arredondo, M. J., Strope, B., Do, H., Kumaraswami, M., Vuopio, J., Gröndahl-Yli-Hannuksela, K., Kristinsson, K. G., Gottfredsson, M., Pesonen, M., Pensar, J., Davenport, E. R. & 11 muuta, Clark, A. G., Corander, J., Caugant, D. A., Gaini, S., Magnussen, M. D., Kubiak, S. L., Nguyen, H. A. T., Long, S. W., Porter, A. R., DeLeo, F. R. & Musser, J. M., 1 maaliskuuta 2019, julkaisussa : NATURE GENETICS. 51, 3, s. 548-559 12 Sivumäärä

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  51. Julkaistu

    Maternal pre- and postnatal anxiety symptoms and infant attention disengagement from emotional faces

    Kataja, E. L., Karlsson, L., Parsons, C. E., Pelto, J., Pesonen, H., Häikiö, T., Hyönä, J., Nolvi, S., Korja, R. & Karlsson, H., 15 tammikuuta 2019, julkaisussa : Journal of Affective Disorders. 243, s. 280-289 10 Sivumäärä

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  52. Julkaistu

    A Faster Tree-Decomposition Based Algorithm for Counting Linear Extensions

    Kangas, K., Koivisto, M. & Salonen, S., 1 tammikuuta 2019, julkaisussa : Algorithmica.

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

Edellinen 1 2 3 4 5 Seuraava

ID: 4319430