Tutkimustuotoksia vuodessa
Tutkimustuotoksia vuodessa
Tutkimustuotos
- 1 - 50 osumaa 196 tuloksesta
Hakutulokset
-
2025
Active Learning of Molecular Data for Task-Specific Objectives
Ghosh, K., Todorovic, M., Vehtari, A. & Rinke, P., 7 tammik. 2025, julkaisussa: Journal of Chemical Physics. 162, 1, 014103.Tutkimustuotos: Lehtiartikkeli › Article › Scientific › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto12 Lataukset (Pure) -
Advances in projection predictive inference
McLatchie, Y., Rögnvaldsson, S., Weber, F. & Vehtari, A., 2025, julkaisussa: Statistical Science. 40, 1, s. 128-147 20 SivumääräTutkimustuotos: Lehtiartikkeli › Article › Scientific › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto3 Sitaatiot (Scopus)23 Lataukset (Pure) -
E-GuARD : expert-guided augmentation for the robust detection of compounds interfering with biological assays
Palmacci, V., Nahal, Y., Welsch, M., Engkvist, O., Kaski, S. & Kirchmair, J., jouluk. 2025, julkaisussa: Journal of Cheminformatics. 17, 1, s. 1-15 15 Sivumäärä, 64.Tutkimustuotos: Lehtiartikkeli › Article › Scientific › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto2 Lataukset (Pure) -
Enhancing atom mapping with multitask learning and symmetry-aware deep graph matching
Astero, M. & Rousu, J., jouluk. 2025, julkaisussa: Journal of Cheminformatics. 17, 1, s. 1-17 17 Sivumäärä, 87.Tutkimustuotos: Lehtiartikkeli › Article › Scientific › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto -
Health octo tool matches personalized health with rate of aging
Salimi, S., Vehtari, A., Salive, M., Kaeberlein, M., Raftery, D. & Ferrucci, L., jouluk. 2025, julkaisussa: Nature Communications. 16, 1, s. 1-16 16 Sivumäärä, 4007.Tutkimustuotos: Lehtiartikkeli › Article › Scientific › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto3 Lataukset (Pure) -
Identifying supermassive black hole recoil in elliptical galaxies
Rawlings, A., Keitaanranta, A., Mattero, M., Soininen, S., Wright, R. J., Kallioinen, N., Liao, S., Rantala, A., Johansson, P. H., Naab, T. & Irodotou, D., maalisk. 2025, julkaisussa: Monthly Notices of the Royal Astronomical Society. 537, 4, s. 3421-3447 27 SivumääräTutkimustuotos: Lehtiartikkeli › Article › Scientific › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto2 Sitaatiot (Scopus)4 Lataukset (Pure) -
Misspecification-robust likelihood-free inference in high dimensions
Thomas, O., Sá-Leão, R., de Lencastre, H., Kaski, S., Corander, J. & Pesonen, H., 3 toukok. 2025, (Sähköinen julkaisu (e-pub) ennen painettua julkistusta) julkaisussa: Computational Statistics. 114007.Tutkimustuotos: Lehtiartikkeli › Article › Scientific › vertaisarvioitu
Open access -
Molecular property prediction using pretrained-BERT and Bayesian active learning : a data-efficient approach to drug design
Masood, M. A., Kaski, S. & Cui, T., jouluk. 2025, julkaisussa: Journal of Cheminformatics. 17, 1, s. 1-15 15 Sivumäärä, 58.Tutkimustuotos: Lehtiartikkeli › Article › Scientific › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto4 Lataukset (Pure) -
Multi-target property prediction and optimization using latent spaces of generative model
Jain, A., Heinonen, M., Käsnänen, H., Sipilä, J. & Kaski, S., 30 kesäk. 2025, julkaisussa: Machine Learning: Science and Technology. 6, 2, s. 1-32 32 Sivumäärä, 025042.Tutkimustuotos: Lehtiartikkeli › Article › Scientific › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto1 Lataukset (Pure) -
Probabilistic analysis of spatial viscoelastic cues in 3D cell culture using magnetic microrheometry
Arasalo, O., Lehtonen, A. J., Kielosto, M., Heinonen, M. & Pokki, J., 21 tammik. 2025, julkaisussa: Biophysical Journal. 124, 2, s. 351-362 12 SivumääräTutkimustuotos: Lehtiartikkeli › Article › Scientific › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto39 Lataukset (Pure) -
Raw signal segmentation for estimating RNA modification from Nanopore direct RNA sequencing data
Cheng, G., Vehtari, A. & Cheng, L., 6 maalisk. 2025, (Sähköinen julkaisu (e-pub) ennen painettua julkistusta) julkaisussa: eLife. 24 SivumääräTutkimustuotos: Lehtiartikkeli › Article › Scientific › vertaisarvioitu
Open access -
Single-cell analysis of aplastic anemia reveals a convergence of NK and NK-like CD8+ T cells with a disease-associated TCR signature
Lundgren, S., Huuhtanen, J., Keränen, M., Feng, X., Patel, B. A., Ryland, G. L., Fox, L. C., Bravo-Perez, C., Clemente, M., Kerr, C., Walldin, G., Dufva, O., Zaimoku, Y., Tuononen, T., Myllymäki, M., Ebeling, F., Jokinen, E., Heinonen, M., Kasanen, T. & Klievink, J. & 14 muuta, , 26 helmik. 2025, julkaisussa: SCIENCE TRANSLATIONAL MEDICINE. 17, 787, s. 1-17 17 Sivumäärä, eadl6758.Tutkimustuotos: Lehtiartikkeli › Article › Scientific › vertaisarvioitu
1 Sitaatiot (Scopus)1 Lataukset (Pure) -
Video-Language Critic : Transferable Reward Functions for Language-Conditioned Robotics
Alakuijala, M., McLean, R., Woungang, I., Farsad, N., Kaski, S., Marttinen, P. & Yuan, K., 2025, julkaisussa: Transactions on Machine Learning Research. 2025, s. 1-22 22 SivumääräTutkimustuotos: Lehtiartikkeli › Article › Scientific › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto18 Lataukset (Pure) -
2024
A comparative study of clinical trial and real-world data in patients with diabetic kidney disease
Kurki, S., Halla-aho, V., Haussmann, M., Lähdesmäki, H., Leinonen, J. V. & Koskinen, M., 19 tammik. 2024, julkaisussa: Scientific Reports. 14, 1, 1731.Tutkimustuotos: Lehtiartikkeli › Article › Scientific › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto7 Sitaatiot (Scopus)23 Lataukset (Pure) -
A Framework for Improving the Reliability of Black-box Variational Inference
Welandawe, M., Riis Andersen, M., Vehtari, A. & Huggins, J. H., 2024, julkaisussa: Journal of Machine Learning Research. 25, s. 1−71Tutkimustuotos: Lehtiartikkeli › Article › Scientific › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto14 Lataukset (Pure) -
A Workflow for Building Computationally Rational Models of Human Behavior
Chandramouli, S., Shi, D., Putkonen, A., De Peuter, S., Zhang, S., Jokinen, J. P. P., Howes, A. & Oulasvirta, A., syysk. 2024, julkaisussa: Computational Brain and Behavior. 7, 3, s. 399-419 21 SivumääräTutkimustuotos: Lehtiartikkeli › Article › Scientific › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto3 Sitaatiot (Scopus)12 Lataukset (Pure) -
Bayesian cross-validation by parallel Markov chain Monte Carlo
Cooper, A., Vehtari, A., Forbes, C., Simpson, D. & Kennedy, L., elok. 2024, julkaisussa: STATISTICS AND COMPUTING. 34, 4, s. 1-15 15 Sivumäärä, 119.Tutkimustuotos: Lehtiartikkeli › Article › Scientific › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto35 Lataukset (Pure) -
Bayesian reduced rank regression models generalizable neural fingerprints that differentiate between individuals in magnetoencephalography data
Haakana, J., Merz, S., Kaski, S., Renvall, H. & Salmelin, R., toukok. 2024, julkaisussa: European Journal of Neuroscience. 59, 9, s. 2320-2335 16 SivumääräTutkimustuotos: Lehtiartikkeli › Article › Scientific › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto62 Lataukset (Pure) -
Central-Smoothing Hypergraph Neural Networks for Predicting Drug-Drug Interactions
Nguyen, D. A., Nguyen, C. H. & Mamitsuka, H., 3 huhtik. 2024, julkaisussa: IEEE Transactions on Neural Networks and Learning Systems . 35, 8, s. 11620-11625 6 SivumääräTutkimustuotos: Lehtiartikkeli › Article › Scientific › vertaisarvioitu
Open access7 Sitaatiot (Scopus) -
Collaborative learning from distributed data with differentially private synthetic data
Prediger, L., Jälkö, J., Honkela, A. & Kaski, S., 14 kesäk. 2024, julkaisussa: BMC Medical Informatics and Decision Making. 24, 1, s. 1-14 14 Sivumäärä, 167.Tutkimustuotos: Lehtiartikkeli › Article › Scientific › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto2 Sitaatiot (Scopus)12 Lataukset (Pure) -
Cross-Validatory Model Selection for Bayesian Autoregressions with Exogenous Regressors
Cooper, A., Simpson, D., Kennedy, L., Forbes, C. & Vehtari, A., 2024, (Sähköinen julkaisu (e-pub) ennen painettua julkistusta) julkaisussa: Bayesian Analysis. s. 1-25Tutkimustuotos: Lehtiartikkeli › Article › Scientific › vertaisarvioitu
Open access -
Detecting and diagnosing prior and likelihood sensitivity with power-scaling
Kallioinen, N., Paananen, T., Bürkner, P. C. & Vehtari, A., helmik. 2024, julkaisussa: STATISTICS AND COMPUTING. 34, 1, s. 1-27 27 Sivumäärä, 57.Tutkimustuotos: Lehtiartikkeli › Article › Scientific › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto9 Sitaatiot (Scopus)92 Lataukset (Pure) -
Efficient estimation and correction of selection-induced bias with order statistics
McLatchie, Y. & Vehtari, A., 12 kesäk. 2024, julkaisussa: STATISTICS AND COMPUTING. 34, 4, 132.Tutkimustuotos: Lehtiartikkeli › Article › Scientific › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto24 Lataukset (Pure) -
Entity Footprinting: Modeling Contextual User States via Digital Activity Monitoring
Rezaei Yousefi, Z., Vuong, T., Al-Ghossein, M., Ruotsalo, T., Jacucci, G. & Kaski, S., 22 huhtik. 2024, julkaisussa: ACM Transactions on Interactive Intelligent Systems. 14, 2, 26 Sivumäärä, 9.Tutkimustuotos: Lehtiartikkeli › Article › Scientific › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto1 Sitaatiot (Scopus)36 Lataukset (Pure) -
Evaluation of polygenic scoring methods in five biobanks shows larger variation between biobanks than methods and finds benefits of ensemble learning
Monti, R., Eick, L., Hudjashov, G., Läll, K., Kanoni, S., Wolford, B. N., Wingfield, B., Pain, O., Wharrie, S., Jermy, B., McMahon, A., Hartonen, T., Heyne, H., Mars, N., Lambert, S., Hveem, K., Inouye, M., van Heel, D. A., Mägi, R. & Marttinen, P. & 4 muuta, , 11 heinäk. 2024, julkaisussa: American Journal of Human Genetics. 111, 7, s. 1431-1447 17 SivumääräTutkimustuotos: Lehtiartikkeli › Article › Scientific › vertaisarvioitu
Open access7 Sitaatiot (Scopus) -
GORetriever : Reranking protein-description-based GO candidates by literature-driven deep information retrieval for protein function annotation
Yan, H., Wang, S., Liu, H., Mamitsuka, H. & Zhu, S., 1 syysk. 2024, julkaisussa: Bioinformatics. 40, s. ii53-ii61Tutkimustuotos: Lehtiartikkeli › Article › Scientific › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto1 Sitaatiot (Scopus)14 Lataukset (Pure) -
Human-in-the-loop active learning for goal-oriented molecule generation
Nahal, Y., Menke, J., Martinelli, J., Heinonen, M., Kabeshov, M., Janet, J. P., Nittinger, E., Engkvist, O. & Kaski, S., 9 jouluk. 2024, julkaisussa: Journal of Cheminformatics. 16, 1, 24 Sivumäärä, 138.Tutkimustuotos: Lehtiartikkeli › Article › Scientific › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto2 Sitaatiot (Scopus)11 Lataukset (Pure) -
Intelligent digital tools for screening of brain connectivity and dementia risk estimation in people affected by mild cognitive impairment: the AI-Mind clinical study protocol
Haraldsen, I. H., Hatlestad-Hall, C., Marra, C., Renvall, H., Maestu, F., Acosta-Hernandez, J., Alfonsin, S., Andersson, V., Anand, A., Ayllon, V., Babic, A., Belhadi, A., Birck, C., Bruna, R., Caraglia, N., Carrarini, C., Christensen, E., Cicchetti, A., Daugbjerg, S. & Di Bidino, R. & 49 muuta, , 5 tammik. 2024, julkaisussa: Frontiers in Neurorobotics. 17, s. 1-15 15 Sivumäärä, 1289406.Tutkimustuotos: Lehtiartikkeli › Article › Scientific › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto11 Sitaatiot (Scopus)35 Lataukset (Pure) -
Likelihood-free inference in state-space models with unknown dynamics
Aushev, A., Tran, T., Pesonen, H., Howes, A. & Kaski, S., helmik. 2024, julkaisussa: STATISTICS AND COMPUTING. 34, 1, 27.Tutkimustuotos: Lehtiartikkeli › Article › Scientific › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto1 Sitaatiot (Scopus)68 Lataukset (Pure) -
Metis : a Python-based user interface to collect expert feedback for generative chemistry models
Menke, J., Nahal, Y., Bjerrum, E. J., Kabeshov, M., Kaski, S. & Engkvist, O., jouluk. 2024, julkaisussa: Journal of Cheminformatics. 16, 1, s. 1-9 9 Sivumäärä, 100.Tutkimustuotos: Lehtiartikkeli › Article › Scientific › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto2 Sitaatiot (Scopus)20 Lataukset (Pure) -
Modeling public opinion over time and space : Trust in state institutions in Europe, 1989-2019
Kołczyńska, M., Bürkner, P. C., Kennedy, L. & Vehtari, A., 16 huhtik. 2024, julkaisussa: Survey Research Methods. 18, 1, s. 1-19 19 SivumääräTutkimustuotos: Lehtiartikkeli › Article › Scientific › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto2 Sitaatiot (Scopus)48 Lataukset (Pure) -
Pareto Smoothed Importance Sampling
Vehtari, A., Simpson, D., Gelman, A., Yao, Y. & Gabry, J., 2024, julkaisussa: Journal of Machine Learning Research. 25, 58 Sivumäärä, 72.Tutkimustuotos: Lehtiartikkeli › Article › Scientific › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto122 Lataukset (Pure) -
Past, Present and Future of Software for Bayesian Inference
Štrumbelj, E., Bouchard-Côté, A., Corander, J., Gelman, A., Rue, H., Murray, L., Pesonen, H., Plummer, M. & Vehtari, A., helmik. 2024, julkaisussa: Statistical Science. 39, 1, s. 46-61 16 SivumääräTutkimustuotos: Lehtiartikkeli › Article › Scientific › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto15 Sitaatiot (Scopus)7 Lataukset (Pure) -
Predicting habitat suitability for Asian elephants in non-analog ecosystems with Bayesian models
Noda, R., Mechenich, M. F., Saarinen, J., Vehtari, A. & Žliobaitė, I., syysk. 2024, julkaisussa: Ecological Informatics. 82, s. 1-15 15 Sivumäärä, 102658.Tutkimustuotos: Lehtiartikkeli › Article › Scientific › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto3 Sitaatiot (Scopus)32 Lataukset (Pure) -
Prior knowledge elicitation: The past, present, and future
Mikkola, P., Martin, O., Halasinamara Chandramouli, S., Hartmann, M., Abril Pla, O., Thomas, O., Pesonen, H., Corander, J., Vehtari, A., Kaski, S., Burkner, P.-C. & Klami, A., jouluk. 2024, julkaisussa: Bayesian Analysis. 19, 4, s. 1129–1161 33 SivumääräTutkimustuotos: Lehtiartikkeli › Article › Scientific › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto21 Sitaatiot (Scopus)17 Lataukset (Pure) -
Projection predictive variable selection for discrete response families with finite support
Weber, F., Glass, Ä. & Vehtari, A., 29 toukok. 2024, (Sähköinen julkaisu (e-pub) ennen painettua julkistusta) julkaisussa: Computational Statistics.Tutkimustuotos: Lehtiartikkeli › Article › Scientific › vertaisarvioitu
Open access2 Sitaatiot (Scopus) -
Targeted Active Learning for Bayesian Decision-Making
Filstroff, L., Sundin, I., Mikkola, P., Tiulpin, A., Kylmäoja, J. & Kaski, S., 12 kesäk. 2024, julkaisussa: Transactions on Machine Learning Research. 20 SivumääräTutkimustuotos: Lehtiartikkeli › Article › Scientific › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto14 Lataukset (Pure) -
Towards modeling evolving longitudinal health trajectories with a transformer-based deep learning model
Moen, H., Raj, V., Vabalas, A., Perola, M., Kaski, S., Ganna, A. & Marttinen, P., 2024, (Hyväksytty/In press) julkaisussa: arXiv.org.Tutkimustuotos: Lehtiartikkeli › Article › Scientific
-
Virtual laboratories : Transforming research with AI
Klami, A., Damoulas, T., Engkvist, O., Rinke, P. & Kaski, S., 27 elok. 2024, julkaisussa: Data-Centric Engineering. 5, s. 1-20 20 Sivumäärä, e19.Tutkimustuotos: Lehtiartikkeli › Article › Scientific › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto4 Sitaatiot (Scopus)83 Lataukset (Pure) -
2023
ABC of the future
Pesonen, H., Simola, U., Köhn-Luque, A., Vuollekoski, H., Lai, X., Frigessi, A., Kaski, S., Frazier, D. T., Maneesoonthorn, W., Martin, G. M. & Corander, J., elok. 2023, julkaisussa: International Statistical Review. 91, 2, s. 243-268Tutkimustuotos: Lehtiartikkeli › Article › Scientific › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto5 Sitaatiot (Scopus)20 Lataukset (Pure) -
An importance sampling approach for reliable and efficient inference in Bayesian ordinary differential equation models
Timonen, J., Siccha, N., Bales, B., Lähdesmäki, H. & Vehtari, A., 18 syysk. 2023, julkaisussa: Stat. 12, 1, e614.Tutkimustuotos: Lehtiartikkeli › Article › Scientific › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto1 Sitaatiot (Scopus)50 Lataukset (Pure) -
Bayesian Inference for Stochastic Multipath Radio Channel Models
Hirsch, C., Bharti, A., Pedersen, T. & Waagepetersen, R., 1 huhtik. 2023, julkaisussa: IEEE Transactions on Antennas and Propagation. 71, 4, s. 3460-3472Tutkimustuotos: Lehtiartikkeli › Article › Scientific › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto1 Sitaatiot (Scopus)36 Lataukset (Pure) -
Bird tolerance to humans in open tropical ecosystems
Mikula, P., Tomášek, O., Romportl, D., Aikins, T. K., Avendaño, J. E., Braimoh-Azaki, B. D. A., Chaskda, A., Cresswell, W., Cunningham, S. J., Dale, S., Favoretto, G. R., Floyd, K. S., Glover, H., Grim, T., Henry, D. A. W., Holmern, T., Hromada, M., Iwajomo, S. B., Lilleyman, A. & Magige, F. J. & 27 muuta, , jouluk. 2023, julkaisussa: Nature Communications. 14, 1, s. 1-10 10 Sivumäärä, 2146.Tutkimustuotos: Lehtiartikkeli › Article › Scientific › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto22 Sitaatiot (Scopus)17 Lataukset (Pure) -
Chemistry-Based Modeling on Phenotype-Based Drug-Induced Liver Injury Annotation : From Public to Proprietary Data
Moein, M., Heinonen, M., Mesens, N., Chamanza, R., Amuzie, C., Will, Y., Ceulemans, H., Kaski, S. & Herman, D., 21 elok. 2023, julkaisussa: Chemical Research in Toxicology. 36, 8, s. 1238−1247Tutkimustuotos: Lehtiartikkeli › Article › Scientific › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto5 Sitaatiot (Scopus)27 Lataukset (Pure) -
DeepMHCI : an anchor position-aware deep interaction model for accurate MHC-I peptide binding affinity prediction
Qu, W., You, R., Mamitsuka, H. & Zhu, S., 2 syysk. 2023, julkaisussa: Bioinformatics (Oxford, England). 39, 9, s. 1-10 10 Sivumäärä, btad551.Tutkimustuotos: Lehtiartikkeli › Article › Scientific › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto6 Sitaatiot (Scopus)50 Lataukset (Pure) -
DPVIm: Differentially Private Variational Inference Improved
Jälkö, J., Prediger, L., Honkela, A. & Kaski, S., syysk. 2023, julkaisussa: Transactions on Machine Learning Research. 2023Tutkimustuotos: Lehtiartikkeli › Article › Scientific › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto29 Lataukset (Pure) -
Fast Methods for Posterior Inference of Two-Group Normal-Normal Models
Greengard, P., Hoskins, J., Margossian, C. C., Gabry, J., Gelman, A. & Vehtari, A., syysk. 2023, julkaisussa: Bayesian Analysis. 18, 3, s. 889-907 19 SivumääräTutkimustuotos: Lehtiartikkeli › Article › Scientific › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto12 Lataukset (Pure) -
HAPNEST : efficient, large-scale generation and evaluation of synthetic datasets for genotypes and phenotypes
Wharrie, S., Yang, Z., Raj, V., Monti, R., Gupta, R., Wang, Y., Martin, A., O'Connor, L. J., Kaski, S., Marttinen, P., Palamara, P. F., Lippert, C. & Ganna, A., 2 syysk. 2023, julkaisussa: Bioinformatics (Oxford, England). 39, 9, s. 1-10 10 Sivumäärä, btad535.Tutkimustuotos: Lehtiartikkeli › Article › Scientific › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto8 Sitaatiot (Scopus)30 Lataukset (Pure) -
Learning representations that are closed-form Monge mapping optimal with application to domain adaptation
Struckmeier, O., Redko, I., Mallasto, A., Arndt, K., Heinonen, M. & Kyrki, V., 1 elok. 2023, julkaisussa: Transactions on Machine Learning Research.Tutkimustuotos: Lehtiartikkeli › Article › Scientific › vertaisarvioitu
Open access -
Modeling needs user modeling
Çelikok, M. M., Murena, P. A. & Kaski, S., 2023, julkaisussa: Frontiers in Artificial Intelligence. 6, s. 1-6 6 Sivumäärä, 1097891.Tutkimustuotos: Lehtiartikkeli › Article › Scientific › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto1 Sitaatiot (Scopus)33 Lataukset (Pure)