Computer Science - Computational Life Sciences (CSLife)

Suodatin
Conference article in proceedings

Hakutulokset

  • 2025

    Clustering students’ text form feedback data: comparison of eight vector space models

    Hämäläinen, W., Rybicki, J.-M., Malmi, L., Jung, A. & Pollari-Malmi, K., 24 tammik. 2025, ICBDE '24: Proceedings of the 2024 7th International Conference on Big Data and Education. New York: ACM, s. 57-64 8 Sivumäärä

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussa › Conference article in proceedings › Scientific › vertaisarvioitu

    Open access
    Tiedosto
    12 Lataukset (Pure)

  • MassSpecGym : A benchmark for the discovery and identification of molecules

    Bushuiev, R., Bushuiev, A., de Jonge, N. F., Young, A., Kretschmer, F., Samusevich, R., Heirman, J., Wang, F., Zhang, L., Dührkop, K., Ludwig, M., Haupt, N. A., Kalia, A., Brungs, C., Schmid, R., Greiner, R., Wang, B., Wishart, D. S., Liu, L. P. & Rousu, J. & 10 muuta, Bittremieux, W., Rost, H., Mak, T. D., Hassoun, S., Huber, F., van der Hooft, J. J. J., Stravs, M. A., Böcker, S., Sivic, J. & Pluskal, T., 2025, Advances in Neural Information Processing Systems 37 (NeurIPS 2024). Curran Associates Inc., s. 1-18 18 Sivumäärä (Advances in Neural Information Processing Systems).

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussa › Conference article in proceedings › Scientific › vertaisarvioitu

    Open access
    2 Sitaatiot (Scopus)
  • 2024

    A General Design Method for Scaffold-Free DNA Wireframe Nanostructures

    Elonen, A., Mohammed, A. & Orponen, P., 2024, Unconventional Computation and Natural Computation - 21st International Conference, UCNC 2024, Proceedings. Cho, D.-J. & Kim, J. (toim.). Springer, s. 178-189 12 Sivumäärä (Lecture Notes in Computer Science (including subseries Lecture Notes in Artificial Intelligence and Lecture Notes in Bioinformatics); Vuosikerta 14776 LNCS).

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussa › Conference article in proceedings › Scientific › vertaisarvioitu

    Open access
    Tiedosto
    1 Sitaatiot (Scopus)
    1 Lataukset (Pure)

  • Automated Rendering of Multi-stranded DNA Complexes with Pseudoknots

    Nowicka, M., Gautam, V. K. & Orponen, P., 2024, Unconventional Computation and Natural Computation - 21st International Conference, UCNC 2024, Proceedings. Cho, D.-J. & Kim, J. (toim.). Springer, s. 190-202 13 Sivumäärä (Lecture Notes in Computer Science (including subseries Lecture Notes in Artificial Intelligence and Lecture Notes in Bioinformatics); Vuosikerta 14776 LNCS).

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussa › Conference article in proceedings › Scientific › vertaisarvioitu

    Open access
    Tiedosto
    1 Lataukset (Pure)

  • Designing 3D RNA Origami Nanostructures with a Minimum Number of Kissing Loops

    Elonen, A. & Orponen, P., syysk. 2024, 30th International Conference on DNA Computing and Molecular Programming, DNA 30 2024. Seki, S. & Stewart, J. M. (toim.). Schloss Dagstuhl - Leibniz-Zentrum für Informatik, s. 1-12 12 Sivumäärä 4. (Leibniz International Proceedings in Informatics, LIPIcs; Vuosikerta 314).

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussa › Conference article in proceedings › Scientific › vertaisarvioitu

    Open access
    Tiedosto
    28 Lataukset (Pure)

  • Estimating treatment effects from single-arm trials via latent-variable modeling

    Haussmann, M., Le, T. M. S., Halla-aho, V., Kurki, S., Leinonen, J., Koskinen, M., Kaski, S. & Lähdesmäki, H., 2024, Proceedings of the 27th International Conference on Artificial Intelligence and Statistics . JMLR, Vuosikerta 238. s. 2926-2934 (Proceedings of Machine Learning Research; Vuosikerta 238).

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussa › Conference article in proceedings › Scientific › vertaisarvioitu

    Open access
    Tiedosto
    1 Lataukset (Pure)

  • Learning Space-Time Continuous Latent Neural PDEs from Partially Observed States

    Iakovlev, V., Heinonen, M. & Lähdesmäki, H., 2024, Advances in Neural Information Processing Systems 36 (NeurIPS 2023). Curran Associates Inc., 24 Sivumäärä (Advances in Neural Information Processing Systems; Vuosikerta 36).

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussa › Conference article in proceedings › Scientific › vertaisarvioitu

    Open access

  • Optimizing Feature Selection for Unbalanced Metabolomics Data with A Background Factor : A Comparative Study in Parkinson's Disease

    Zhang, Y., Hämäläinen, W., Reinikka, P., Herukka, S. K., Leinonen, V., Lehtonen, M. & Lehtonen, Š., 2024, Proceedings - 2024 IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine, BIBM 2024. Cannataro, M., Zheng, H., Gao, L., Cheng, J., de Miranda, J. L., Zumpano, E., Hu, X., Cho, Y.-R. & Park, T. (toim.). IEEE, s. 5884-5891 8 Sivumäärä (Proceedings (IEEE international conference on bioinformatics and biomedicine)).

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussa › Conference article in proceedings › Scientific › vertaisarvioitu

    Open access
    Tiedosto
    3 Lataukset (Pure)
  • 2023

    Mental Health Coping Stories on Social Media: A Causal-Inference Study of Papageno Effect

    Yuan, Y., Saha, K., Keller, B., Isometsä, E. T. & Aledavood, T., 30 huhtik. 2023, ACM Web Conference 2023 - Proceedings of the World Wide Web Conference, WWW 2023. ACM, s. 2677–2685

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussa › Conference article in proceedings › Scientific › vertaisarvioitu

    Open access
    Tiedosto
    13 Sitaatiot (Scopus)
    68 Lataukset (Pure)

  • Minority Stress Experienced by LGBTQ Online Communities during the COVID-19 Pandemic

    Yuan, Y., Verma, G., Keller, B. & Aledavood, T., 2 kesäk. 2023, Proceedings of the Seventeenth International AAAI Conference on Web and Social Media. AAAI Press, s. 936-947 (Proceedings of the International AAAI Conference on Web and Social Media; Vuosikerta 17).

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussa › Conference article in proceedings › Scientific › vertaisarvioitu

    Open access
  • 2022

    A Variational Autoencoder for Heterogeneous Temporal and Longitudinal Data

    Öǧretir, M., Ramchandran, S., Papatheodorou, D. & Lähdesmäki, H., 2022, Proceedings - 21st IEEE International Conference on Machine Learning and Applications, ICMLA 2022. Wani, M. A., Kantardzic, M., Palade, V., Neagu, D., Yang, L. & Chan, K.-Y. (toim.). IEEE, s. 1522-1529 8 Sivumäärä

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussa › Conference article in proceedings › Scientific › vertaisarvioitu

    Open access
    Tiedosto
    3 Sitaatiot (Scopus)
    107 Lataukset (Pure)

  • Learning to Predict Graphs with Fused Gromov-Wasserstein Barycenters

    Brogat-Motte, L., Flamary, R., Brouard, C., Rousu, J. & d'Alché-Buc, F., 2022, Proceedings of the 39th International Conference on Machine Learning, PMLR. JMLR, s. 2321-2335 (Proceedings of Machine Learning Research ; Vuosikerta 162).

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussa › Conference article in proceedings › Scientific › vertaisarvioitu

    Open access

  • Variational multiple shooting for Bayesian ODEs with Gaussian processes

    Hedge, P., Yildiz, C., Lähdesmäki, H., Kaski, S. & Heinonen, M., 2022, Proceedings of the 38th Conference on Uncertainty in Artificial Intelligence (UAI 2022), PMLR. JMLR, s. 790-799 (Proceedings of Machine Learning Research ; Vuosikerta 180).

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussa › Conference article in proceedings › Scientific › vertaisarvioitu

    Open access
    Tiedosto
    1 Sitaatiot (Scopus)
    68 Lataukset (Pure)
  • 2021

    Continuous-time Model-based Reinforcement Learning

    Yildiz, C., Heinonen, M. & Lähdesmäki, H., 21 heinäk. 2021, Proceedings of the 38th International Conference on Machine Learning, ICML 2021. JMLR, s. 12009-12018 (Proceedings of Machine Learning Research; Vuosikerta 139).

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussa › Conference article in proceedings › Scientific › vertaisarvioitu

    Open access
    Tiedosto
    73 Lataukset (Pure)

  • Latent Gaussian process with composite likelihoods and numerical quadrature

    Ramchandran, S., Koskinen, M. & Lahdesmaki, H., 2021, 24TH INTERNATIONAL CONFERENCE ON ARTIFICIAL INTELLIGENCE AND STATISTICS (AISTATS). Banerjee, A. & Fukumizu, K. (toim.). Microtome Publishing, 10 Sivumäärä (Proceedings of Machine Learning Research; Vuosikerta 130).

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussa › Conference article in proceedings › Scientific › vertaisarvioitu

    Open access
    Tiedosto
    31 Lataukset (Pure)

  • Learning continuous-time PDEs from sparse data with graph neural networks

    Iakovlev, V., Heinonen, M. & Lähdesmäki, H., 2021, International Conference on Learning Representations. OpenReview.net, 15 Sivumäärä

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussa › Conference article in proceedings › Professional

    Open access

  • Longitudinal Variational Autoencoder

    Ramchandran, S., Tikhonov, G., Kujanpaa, K., Koskinen, M. & Lahdesmaki, H., 2021, 24TH INTERNATIONAL CONFERENCE ON ARTIFICIAL INTELLIGENCE AND STATISTICS (AISTATS). Banerjee, A. & Fukumizu, K. (toim.). Microtome Publishing, 11 Sivumäärä (Proceedings of Machine Learning Research; Vuosikerta 130).

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussa › Conference article in proceedings › Scientific › vertaisarvioitu

    Open access
    Tiedosto
    72 Lataukset (Pure)
  • 2004

    Balanced data gathering in energy-constrained sensor networks

    Falck, E., Floréen, P., Kaski, P., Kohonen, J. & Orponen, P., 2004, ALGOSENSORS'04, First International Workshop on Algorithmic Aspects of Wireless Sensor Networks, Turku, Suomi, 16.7.2004. Nikoletseas, S. & Rolim, J. D. P. (toim.). Berlin Heidelberg: Springer, s. 59-70

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussa › Conference article in proceedings › Scientific › vertaisarvioitu

    Tiedosto
    57 Lataukset (Pure)
  • 2003

    Multicast time maximization in energy constrained wireless networks

    Floréen, P., Kaski, P., Kohonen, J. & Orponen, P., 2003, DIALM-POMC '03 Joint Workshop on Foundations of Mobile Computing, San Diego, CA, USA, 19.9.2003. Richa, A. & Welch, J. (toim.). ACM, New York: ACM, s. 50-58

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussa › Conference article in proceedings › Scientific › vertaisarvioitu

    Open access
    Tiedosto
    49 Sitaatiot (Scopus)
    231 Lataukset (Pure)