SyMMys huippuyksikkö

Yksikkö: Tutkimusalue

Tutkimustuotokset

  1. 2019
  2. Julkaistu

    Early detection of peripheral blood cell signature in children developing β-cell autoimmunity at a young age

    Kallionpää, H., Somani, J., Tuomela, S., Ullah, U., De Albuquerque, R., Lönnberg, T., Komsi, E., Siljander, H., Honkanen, J., Härkönen, T. & 11 muuta, Peet, A., Tillmann, V., Chandra, V., Anagandula, M. K., Frisk, G., Otonkoski, T., Rasool, O., Lund, R., Lähdesmäki, H., Knip, M. & Lahesmaa, R., 1 lokakuuta 2019, julkaisussa : DIABETES. 68, 10, s. 2024-2034 11 Sivumäärä

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  3. Julkaistu

    Peripheral blood DNA methylation differences in twin pairs discordant for Alzheimer's disease

    Konki, M., Malonzo, M., Karlsson, I. K., Lindgren, N., Ghimire, B., Smolander, J., Scheinin, N. M., Ollikainen, M., Laiho, A., Elo, L. L. & 7 muuta, Lonnberg, T., Roytta, M., Pedersen, N. L., Kaprio, J., Lahdesmaki, H., Rinne, J. O. & Lund, R. J., 2 syyskuuta 2019, julkaisussa : Clinical epigenetics. 11, 1, 12 Sivumäärä, 130.

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  4. Julkaistu

    Bayesian metabolic flux analysis reveals intracellular flux couplings

    Heinonen, M., Osmala, M., Mannerström, H., Wallenius, J., Kaski, S., Rousu, J. & Lähdesmäki, H., 15 heinäkuuta 2019, julkaisussa : Bioinformatics. 35, 14, s. i548-i557 btz315.

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  5. Julkaistu

    An additive Gaussian process regression model for interpretable non-parametric analysis of longitudinal data

    Cheng, L., Ramchandran, S., Vatanen, T., Lietzén, N., Lahesmaa, R., Vehtari, A. & Lähdesmäki, H., 17 huhtikuuta 2019, julkaisussa : Nature Communications. 10, 1, s. 1-11 11 Sivumäärä, 1798.

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  6. Julkaistu

    Deep learning with differential Gaussian process flows

    Hegde, P., Heinonen, M., Lähdesmäki, H. & Kaski, S., huhtikuuta 2019, The 22nd International Conference on Artificial Intelligence and Statistic. Vuosikerta 89. s. 1-15 16 Sivumäärä (Proceedings of Machine Learning Research; painos 89).

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussavertaisarvioitu

  7. Julkaistu

    A Mathematical Model for Enhancer Activation Kinetics During Cell Differentiation

    Nousiainen, K., Intosalmi, J. & Lähdesmäki, H., 1 tammikuuta 2019, Algorithms for Computational Biology - 6th International Conference, AlCoB 2019, Proceedings. Vega-Rodríguez, M. A., Holmes, I. & Martín-Vide, C. (toim.). Springer Verlag, s. 191-202 12 Sivumäärä (Lecture Notes in Computer Science (including subseries Lecture Notes in Artificial Intelligence and Lecture Notes in Bioinformatics); painos 11488 LNBI).

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussavertaisarvioitu

  8. Hyväksytty/In press

    ODE2VAE: Deep generative second order ODEs with Bayesian neural networks

    Yildiz, C., Heinonen, M. & Lähdesmäki, H., 2019, (Hyväksytty/In press) NeurIPS.

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussavertaisarvioitu

  9. 2018
  10. Julkaistu

    Genomic variation and strain-specific functional adaptation in the human gut microbiome during early life

    Vatanen, T., Plichta, D. R., Somani, J., Münch, P. C., Arthur, T. D., Hall, A. B., Rudolf, S., Oakeley, E. J., Ke, X., Young, R. A. & 18 muuta, Haiser, H. J., Kolde, R., Yassour, M., Luopajärvi, K., Siljander, H., Virtanen, S. M., Ilonen, J., Uibo, R., Tillmann, V., Mokurov, S., Dorshakova, N., Porter, J. A., McHardy, A. C., Lähdesmäki, H., Vlamakis, H., Huttenhower, C., Knip, M. & Xavier, R. J., 17 joulukuuta 2018, julkaisussa : Nature Microbiology.

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  11. Julkaistu

    Characterization and non-parametric modeling of the developing serum proteome during infancy and early childhood

    Lietzén, N., Cheng, L., Moulder, R., Siljander, H., Laajala, E., Härkönen, T., Peet, A., Vehtari, A., Tillmann, V., Knip, M. & 2 muuta, Lähdesmäki, H. & Lahesmaa, R., 1 joulukuuta 2018, julkaisussa : Scientific Reports. 8, 1, s. 1-13 5883.

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  12. Julkaistu

    snpEnrichR: analyzing co-localization of SNPs and their proxies in genomic regions

    Nousiainen, K., Kanduri, K., Ricaño-Ponce, I., Wijmenga, C., Lahesmaa, R., Kumar, V. & Lähdesmäki, H., 1 joulukuuta 2018, julkaisussa : Bioinformatics (Oxford, England). 34, 23, s. 4112-4114 3 Sivumäärä

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  13. Julkaistu

    The human gut microbiome in early-onset type 1 diabetes from the TEDDY study

    Vatanen, T., Franzosa, E. A., Schwager, R., Tripathi, S., Arthur, T. D., Vehik, K., Lernmark, Å., Hagopian, W. A., Rewers, M. J., She, J. X. & 12 muuta, Toppari, J., Ziegler, A. G., Akolkar, B., Krischer, J. P., Stewart, C. J., Ajami, N. J., Petrosino, J. F., Gevers, D., Lähdesmäki, H., Vlamakis, H., Huttenhower, C. & Xavier, R. J., 25 lokakuuta 2018, julkaisussa : Nature. 562, 7728, s. 589-594 6 Sivumäärä

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  14. Julkaistu

    Temporal clustering analysis of endothelial cell gene expression following exposure to a conventional radiotherapy dose fraction using Gaussian process clustering

    Heinonen, M., Milliat, F., Benadjaoud, M. A., François, A., Buard, V., Tarlet, G., D'Alché-Buc, F. & Guipaud, O., 1 lokakuuta 2018, julkaisussa : PloS one. 13, 10, s. 1-31 e0204960.

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  15. Julkaistu

    Learning with multiple pairwise kernels for drug bioactivity prediction

    Cichonska, A., Pahikkala, T., Szedmak, S., Julkunen, H., Airola, A., Heinonen, M., Aittokallio, T. & Rousu, J., 1 heinäkuuta 2018, julkaisussa : Bioinformatics. 34, 13, s. i509-i518

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  16. Julkaistu

    MGPfusion: Predicting protein stability changes with Gaussian process kernel learning and data fusion

    Jokinen, E., Heinonen, M. & Lähdesmäki, H., 1 heinäkuuta 2018, julkaisussa : Bioinformatics. 34, 13, s. i274-i283

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  17. Julkaistu

    Flex ddG: Rosetta Ensemble-Based Estimation of Changes in Protein–Protein Binding Affinity upon Mutation

    Barlow, K., Conchuir, S., Thompson, S., Suresh, P., Lucas, J., Heinonen, M. & Kortemme, T., 31 toukokuuta 2018, julkaisussa : Journal of Physical Chemistry B. 122, 21, s. 5389-5399 11 Sivumäärä

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  18. Julkaistu

    Quantitative proteomic characterization and comparison of T helper 17 and induced regulatory T cells

    Mohammad, I., Nousiainen, K., Bhosale, S. D., Starskaia, I., Moulder, R., Rokka, A., Cheng, F., Mohanasundaram, P., Eriksson, J. E., Goodlett, D. R. & 2 muuta, Lähdesmäki, H. & Chen, Z., 31 toukokuuta 2018, julkaisussa : PLoS Biology. 16, 5, e2004194.

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  19. Julkaistu

    Time-resolved transcriptome and proteome landscape of human regulatory T cell (Treg) differentiation reveals novel regulators of FOXP3

    Schmidt, A., Marabita, F., Kiani, N. A., Gross, C. C., Johansson, H. J., Éliás, S., Rautio, S., Eriksson, M., Fernandes, S. J., Silberberg, G. & 8 muuta, Ullah, U., Bhatia, U., Lähdesmäki, H., Lehtiö, J., Gomez-Cabrero, D., Wiendl, H., Lahesmaa, R. & Tegnér, J., 7 toukokuuta 2018, julkaisussa : BMC Biology. 16, 1, s. 1-35 47.

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  20. Julkaistu

    Atopic asthma after rhinovirus-induced wheezing is associated with DNA methylation change in the SMAD3 gene promoter

    Lund, R. J., Osmala, M., Malonzo, M., Lukkarinen, M., Leino, A., Salmi, J., Vuorikoski, S., Turunen, R., Vuorinen, T., Akdis, C. & 3 muuta, Lähdesmäki, H., Lahesmaa, R. & Jartti, T., 5 toukokuuta 2018, julkaisussa : Allergy. 73, 8, s. 1735-1740 6 Sivumäärä

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  21. Sähköinen julkaisu (e-pub) ennen painettua julkistusta
  22. Julkaistu

    Transcriptional Repressor HIC1 Contributes to Suppressive Function of Human Induced Regulatory T Cells

    Ubaid Ullah, U., Andrabi, S. B. A., Tripathi, S. K., Dirasantha, O., Kanduri, K., Rautio, S., Gross, C. C., Lehtimäki, S., Bala, K., Tuomisto, J. & 7 muuta, Bhatia, U., Chakroborty, D., Elo, L. L., Lähdesmäki, H., Wiendl, H., Rasool, O. & Lahesmaa, R., 20 helmikuuta 2018, julkaisussa : Cell Reports. 22, 8, s. 2094-2106 13 Sivumäärä

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  23. Julkaistu

    Generative models for quantification of DNA modifications

    Äijö, T., Bonneau, R. & Lähdesmäki, H., 1 tammikuuta 2018, Methods in Molecular Biology. s. 37-50 14 Sivumäärä (Methods in Molecular Biology; painos 1807).

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussavertaisarvioitu

  24. Julkaistu

    A Nonparametric Spatio-temporal SDE Model

    Yildiz, C., Heinonen, M. & Lähdesmäki, H., 2018, NIPS 2018 Spatiotemporal Workshop: 32nd Conference on Neural Information Processing Systems (NIPS 2018), Montréal, Canada. Neural Information Processing Systems Foundation, s. 1-5

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussa

  25. Julkaistu

    Learning unknown ODE models with Gaussian processes

    Heinonen, M., Yildiz, C., Mannerström, H., Intosalmi, J. & Lähdesmäki, H., 2018, Proceedings of the 35th International Conference on Machine Learning, ICML 2018. Vuosikerta 5. s. 3120-3132 13 Sivumäärä (Proceedings of Machine Learning Research; painos 80).

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussavertaisarvioitu

  26. Julkaistu

    Variational zero-inflated Gaussian processes with sparse kernels

    Hegde, P., Heinonen, M. & Kaski, S., 2018, 34th Conference on Uncertainty in Artificial Intelligence 2018, UAI 2018. AUAI Press, Vuosikerta 1. s. 361-371 148

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussavertaisarvioitu

  27. 2017
  28. Julkaistu

    A Mutually-Dependent Hadamard Kernel for Modelling Latent Variable Couplings

    Remes, S., Heinonen, M. & Kaski, S., marraskuuta 2017, Proceedings of the 9th Asian Conference on Machine Learning. Zhang, M-L. & Noh, Y-K. (toim.). s. 455-470 16 Sivumäärä (Proceedings of Machine Learning Research; painos 77).

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussavertaisarvioitu

  29. Julkaistu

    Intestinal virome changes precede autoimmunity in type I diabetes-susceptible children

    Zhao, G., Vatanen, T., Droit, L., Park, A., Kostic, A. D., Poon, T. W., Vlamakis, H., Siljander, H., Härkönen, T., Hämäläinen, A. M. & 7 muuta, Peet, A., Tillmann, V., Ilonen, J., Wang, D., Knip, M., Xavier, R. J. & Virgin, H. W., 25 heinäkuuta 2017, julkaisussa : Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 114, 30, s. E6166-E6175

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  30. Julkaistu

    Efficient statistical methods for detecting differential methylation

    Halla-aho, V. & Lähdesmäki, H., 22 heinäkuuta 2017.

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussaKonferenssiesitys

  31. Julkaistu

    Genome-wide Analysis of STAT3-Mediated Transcription during Early Human Th17 Cell Differentiation

    Tripathi, S. K., Chen, Z., Larjo, A., Kanduri, K., Nousiainen, K., Äijo, T., Ricaño-Ponce, I., Hrdlickova, B., Tuomela, S., Laajala, E. & 5 muuta, Salo, V., Kumar, V., Wijmenga, C., Lähdesmäki, H. & Lahesmaa, R., 30 toukokuuta 2017, julkaisussa : Cell Reports. 19, 9, s. 1888-1901 14 Sivumäärä

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  32. Julkaistu

    RNA Polymerase III Subunit POLR3G Regulates Specific Subsets of PolyA+ and SmallRNA Transcriptomes and Splicing in Human Pluripotent Stem Cells

    Lund, R. J., Rahkonen, N., Malonzo, M., Kauko, L., Emani, M. R., Kivinen, V., Närvä, E., Kemppainen, E., Laiho, A., Skottman, H. & 5 muuta, Hovatta, O., Rasool, O., Nykter, M., Lähdesmäki, H. & Lahesmaa, R., 9 toukokuuta 2017, julkaisussa : Stem Cell Reports. 8, 5, s. 1442-1454 13 Sivumäärä

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  33. Julkaistu

    High-throughput automated microfluidic sample preparation for accurate microbial genomics

    Kim, S., De Jonghe, J., Kulesa, A. B., Feldman, D., Vatanen, T., Bhattacharyya, R. P., Berdy, B., Gomez, J., Nolan, J., Epstein, S. & 1 muuta, Blainey, P. C., 27 tammikuuta 2017, julkaisussa : Nature Communications. 8, s. 1-10 13919.

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  34. Julkaistu

    Acquired Somatic Mutations in T Cells in Patients with Aplastic Anemia and Hypoplastic Myelodysplastic Syndromes

    Lundgren, S., Keränen, M., Nousiainen, K., Eldfors, S., Hannula, S., Hannunen, T., Ellonen, P., Walldin, G., Clemente, M., Ebeling, F. & 5 muuta, Rajala, H., Maciejewski, J. P., Lähdesmäki, H., Hellstrom-Lindberg, E. & Mustjoki, S., 2017, julkaisussa : BLOOD. 130, Suppl 1, s. 1169-1169 1 Sivumäärä

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  35. Julkaistu

    Non-Stationary Spectral Kernels

    Remes, S., Heinonen, M. & Kaski, S., 2017, Advances in Neural Information Processing Systems 30: Proceedings of NIPS2017. Curran Associates, Inc., s. 4645-4654 (Advances in Neural Information Processing Systems; painos 30).

    Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/konferenssijulkaisussavertaisarvioitu

  36. Julkaistu

    TET2 and 3 proteins control iNKT cell lineage specification and TCR mediated expansion

    Tsagaratou, A., Avalos, E. G., Rautio, S., Browne, J. S., Togher, S., Pastor, W., Rothenberg, E. V., Lahdesmaki, H. & Rao, A., 2017, julkaisussa : JOURNAL OF IMMUNOLOGY. 198, 1, Supplement, s. 215.11

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  37. Julkaistu

    TET proteins regulate the lineage specification and TCR-mediated expansion of iNKT cells

    Tsagaratou, A., González-Avalos, E., Rautio, S., Scott-Browne, J. P., Togher, S., Pastor, W. A., Rothenberg, E. V., Chavez, L., Lähdesmäki, H. & Rao, A., 2017, julkaisussa : NATURE IMMUNOLOGY. 18, 1, s. 45-53

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  38. 2016
  39. Julkaistu

    Selected proceedings of Machine Learning in Systems Biology: MLSB 2016

    van Dijk, A. D. J., Lähdesmäki, H., de Ridder, D. & Rousu, J., 13 joulukuuta 2016, julkaisussa : BMC Bioinformatics. 17, Supplement 16, 2 Sivumäärä

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkeli

  40. Julkaistu

    Selected proceedings of Machine Learning in Systems Biology: MLSB 2016

    van Dijk, A. D. J., Lähdesmäki, H., de Ridder, D. & Rousu, J., joulukuuta 2016, julkaisussa : BMC Bioinformatics. 17

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  41. Julkaistu

    A subpopulation model to analyze heterogeneous cell differentiation dynamics

    Chan, Y. H., Intosalmi, J., Rautio, S. & Lähdesmäki, H., 1 marraskuuta 2016, julkaisussa : Bioinformatics. 32, 21, s. 3306-3313 8 Sivumäärä

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  42. Julkaistu

    Mature Let-7 miRNAs fine tune expression of LIN28B in pluripotent human embryonic stem cells

    Rahkonen, N., Stubb, A., Malonzo, M., Edelman, S., Emani, M. R., Närvä, E., Lähdesmäki, H., Ruohola-Baker, H., Lahesmaa, R. & Lund, R., 1 marraskuuta 2016, julkaisussa : STEM CELL RESEARCH. 17, 3, s. 498-503 6 Sivumäärä

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  43. Julkaistu

    The effect of host genetics on the gut microbiome

    Bonder, M. J., Kurilshikov, A., Tigchelaar, E. F., Mujagic, Z., Imhann, F., Vila, A. V., Deelen, P., Vatanen, T., Schirmer, M., Smeekens, S. P. & 20 muuta, Zhernakova, D. V., Jankipersadsing, S. A., Jaeger, M., Oosting, M., Cenit, M. C., Masclee, A. A. M., Swertz, M. A., Li, Y., Kumar, V., Joosten, L., Harmsen, H., Weersma, R. K., Franke, L., Hofker, M. H., Xavier, R. J., Jonkers, D., Netea, M. G., Wijmenga, C., Fu, J. & Zhernakova, A., 1 marraskuuta 2016, julkaisussa : NATURE GENETICS. 48, 11, s. 1407-1412 6 Sivumäärä

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  44. Julkaistu

    LuxGLM: A probabilistic covariate model for quantification of DNA methylation modifications with complex experimental designs

    Äijö, T., Yue, X., Rao, A. & Lähdesmäki, H., 1 syyskuuta 2016, julkaisussa : Bioinformatics. 32, 17, s. i511-i519

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  45. Julkaistu

    Crowdsourced assessment of common genetic contribution to predicting anti-TNF treatment response in rheumatoid arthritis

    Sieberts, S. K., Zhu, F., García-García, J., Stahl, E., Pratap, A., Pandey, G., Pappas, D., Aguilar, D., Anton, B., Bonet, J. & 83 muuta, Eksi, R., Fornés, O., Guney, E., Li, H., Marín, M. A., Panwar, B., Planas-Iglesias, J., Poglayen, D., Cui, J., Falcao, A. O., Suver, C., Hoff, B., Balagurusamy, V. S. K., Dillenberger, D., Neto, E. C., Norman, T., Aittokallio, T., Ammad-Ud-Din, M., Azencott, C. A., Bellón, V., Boeva, V., Bunte, K., Chheda, H., Cheng, L., Corander, J., Dumontier, M., Goldenberg, A., Gopalacharyulu, P., Hajiloo, M., Hidru, D., Jaiswal, A., Kaski, S., Khalfaoui, B., Khan, S. A., Kramer, E. R., Marttinen, P., Mezlini, A. M., Molparia, B., Pirinen, M., Saarela, J., Samwald, M., Stoven, V., Tang, H., Tang, J., Torkamani, A., Vert, J. P., Wang, B., Wang, T., Wennerberg, K., Wineinger, N. E., Xiao, G., Xie, Y., Yeung, R., Zhan, X., Zhao, C., Greenberg, J., Kremer, J., Michaud, K., Barton, A., Coenen, M., Mariette, X., Miceli, C., Shadick, N., Weinblatt, M., De Vries, N., Tak, P. P., Gerlag, D., Huizinga, T. W. J., Kurreeman, F., Allaart, C. F., Louis Bridges, S., Criswell, L., Moreland, L., Klareskog, L., Saevarsdottir, S., Padyukov, L., Gregersen, P. K., Friend, S., Plenge, R., Stolovitzky, G., Oliva, B., Guan, Y. & Mangravite, L. M., 23 elokuuta 2016, julkaisussa : Nature Communications. 7, s. 1-9 12460.

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  46. Julkaistu

    Increased Intestinal Microbial Diversity Following Fecal Microbiota Transplant for Active Crohn's Disease

    Vaughn, B. P., Vatanen, T., Allegretti, J. R., Bai, A., Xavier, R. J., Korzenik, J., Gevers, D., Ting, A., Robson, S. C. & Moss, A. C., 10 elokuuta 2016, julkaisussa : INFLAMMATORY BOWEL DISEASES. 22, 9, s. 2182-2190 9 Sivumäärä

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  47. Julkaistu

    Dysbiosis, inflammation, and response to treatment: A longitudinal study of pediatric subjects with newly diagnosed inflammatory bowel disease

    Shaw, K. A., Bertha, M., Hofmekler, T., Chopra, P., Vatanen, T., Srivatsa, A., Prince, J., Kumar, A., Sauer, C., Zwick, M. E. & 5 muuta, Satten, G. A., Kostic, A. D., Mulle, J. G., Xavier, R. J. & Kugathasan, S., 13 heinäkuuta 2016, julkaisussa : GENOME MEDICINE. 8, 1, 75.

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  48. Julkaistu

    Genome wide analysis of protein production load in Trichoderma reesei

    Pakula, T. M., Nygren, H., Barth, D., Heinonen, M., Castillo, S., Penttilä, M. & Arvas, M., 28 kesäkuuta 2016, julkaisussa : Biotechnology for Biofuels. 9, 1, s. 1-26 132.

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  49. Julkaistu

    Data-driven mechanistic analysis method to reveal dynamically evolving regulatory networks

    Intosalmi, J., Nousiainen, K., Ahlfors, H. & Lähdesmäki, H., 15 kesäkuuta 2016, julkaisussa : Bioinformatics. 32, 12, s. 288-296

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  50. Julkaistu

    Natural history of the infant gut microbiome and impact of antibiotic treatment on bacterial strain diversity and stability

    Yassour, M., Vatanen, T., Siljander, H., Hämäläinen, A. M., Härkönen, T., Ryhänen, S. J., Franzosa, E. A., Vlamakis, H., Huttenhower, C., Gevers, D. & 3 muuta, Lander, E. S., Knip, M. & Xavier, R. J., 15 kesäkuuta 2016, julkaisussa : SCIENCE TRANSLATIONAL MEDICINE. 8, 343, 343ra81.

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  51. Julkaistu

    Variation in Microbiome LPS Immunogenicity Contributes to Autoimmunity in Humans

    Vatanen, T., Kostic, A. D., D'Hennezel, E., Siljander, H., Franzosa, E. A., Yassour, M., Kolde, R., Vlamakis, H., Arthur, T. D., Hämäläinen, A. M. & 15 muuta, Peet, A., Tillmann, V., Uibo, R., Mokurov, S., Dorshakova, N., Ilonen, J., Virtanen, S. M., Szabo, S. J., Porter, J. A., Lähdesmäki, H., Huttenhower, C., Gevers, D., Cullen, T. W., Knip, M. & Xavier, R. J., 5 toukokuuta 2016, julkaisussa : CELL. 165, 4, s. 842-853 12 Sivumäärä

    Tutkimustuotos: Lehtiartikkelivertaisarvioitu

  52. Julkaistu

    Comparative analysis of human and mouse transcriptomes of Th17 cell priming

    Tuomela, S., Rautio, S., Ahlfors, H., Oling, V., Salo, V., Ullah, U., Chen, Z., Hämälistö, S., Tripathi, S., Äijö, T. & 6 muuta, Rasool, O., Soueidan, H., Wessels, L., Stockinger, B., Lähdesmäki, H. & Lahesmaa, R., toukokuuta 2016, julkaisussa : SCANDINAVIAN JOURNAL OF IMMUNOLOGY. 83, 5, s. 380-380 1 Sivumäärä

    Tutkimustuotos: LehtiartikkeliKokousabstrakti

  53. Julkaistu

    Enterovirus-associated changes in plasma proteome of children with genetic susceptibility to type 1 diabetes

    Lietzen, N., Cheng, L., Oikarinen, S., Goo, Y. A., Goodlett, D., Toppari, J., Ilonen, J., Veijola, R., Knip, M., Lähdesmäki, H. & 2 muuta, Hyöty, H. & Lahesmaa, R., toukokuuta 2016, julkaisussa : SCANDINAVIAN JOURNAL OF IMMUNOLOGY. 83, 5, s. 381-381 1 Sivumäärä

    Tutkimustuotos: LehtiartikkeliKokousabstraktivertaisarvioitu

  54. Julkaistu

    Identification of global regulators of T-helper cell lineage specification

    Kanduri, K., Tripathi, S., Larjo, A., Mannerström, H., Ullah, U., Lund, R., Hawkins, R. D., Ren, B., Lähdesmäki, H. & Lahesmaa, R., toukokuuta 2016, julkaisussa : SCANDINAVIAN JOURNAL OF IMMUNOLOGY. 83, 5, s. 379-379 1 Sivumäärä

    Tutkimustuotos: LehtiartikkeliKokousabstraktivertaisarvioitu

Edellinen 1 2 Seuraava

ID: 4687034