Siirry päänavigointiin Siirry hakuun Siirry pääsisältöön

MD simulation trajectory and related files for POPC bilayer with 30 mol% of deprotonated pazePC (Berger, Gromacs 4.5.)

  • Samuli Ollila (Creator)
  • Himanshu Khandelia (Creator)

Tietoaineisto

Description

Simulation trajectory and related files for POPC bilayer with 30mol% of pazePC in deprotonated form used in "Acyl chain disorder and azelaoyl orientation in lipid membranes containing oxidised lipids" by T. M. Ferreira, et al., to be submitted.

90 POPC, 38 pazePC, 7250 water and 38 potassium molecules. Simulation time 120ns.

Force field for POPC is based on Berger model and force field for pazePC is from H. Khandelia and O. G. Mouritsen, Biophysical Journal, 2009, 96(7), 2734 – 2743, http://dx.doi.org/10.1016/j.bpj.2009.01.007.

If used, please cite approriate publications.
Koska saatavilla16 tammik. 2016
JulkaisijaZenodo

Dataset Licences

  • CC0-1.0
  • Acyl Chain Disorder and Azelaoyl Orientation in Lipid Membranes Containing Oxidized Lipids

    Ferreira, T. M., Sood, R., Bärenwald, R., Carlström, G., Topgaard, D., Saalwächter, K., Kinnunen, P. K. J. & Ollila, O. H. S., 28 kesäk. 2016, julkaisussa: Langmuir. 32, 25, s. 6524-6533 10 Sivumäärä

    Tutkimustuotos: LehtiartikkeliArticleScientificvertaisarvioitu

    27 Sitaatiot (Scopus)

Siteeraa tätä